RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.5■■■□□ 2.15
ILF3-217ENST00000589998 WDR97A6NE52 1622 aa28.5■■■□□ 2.15
ILF3-217ENST00000589998 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.49■■■□□ 2.15
ILF3-217ENST00000589998 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.44■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.43■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.41■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.41■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ILF3-217ENST00000589998 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ILF3-217ENST00000589998 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.34■■■□□ 2.13
ILF3-217ENST00000589998 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ILF3-217ENST00000589998 P3H3Q8IVL6 736 aa28.28■■■□□ 2.12
ILF3-217ENST00000589998 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.27■■■□□ 2.12
ILF3-217ENST00000589998 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.24■■■□□ 2.11
ILF3-217ENST00000589998 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.24■■■□□ 2.11
ILF3-217ENST00000589998 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
ILF3-217ENST00000589998 BCANQ96GW7 911 aa28.22■■■□□ 2.11
ILF3-217ENST00000589998 FKBP8Q14318 412 aa28.2■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.19■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.17■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.14e-9■■■■□ 23.4
ILF3-217ENST00000589998 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.14■■■□□ 2.1
ILF3-217ENST00000589998 CCER2I3L3R5 266 aa28.13■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.11■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.09■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.09■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.09■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.09■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.08■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 ANP32CO43423 234 aa28.08■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.08■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 CUL7Q14999 1698 aa28.08■■■□□ 2.09
ILF3-217ENST00000589998 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.06■■■□□ 2.08
ILF3-217ENST00000589998 TRIM52Q96A61 297 aa28.04■■■□□ 2.08
ILF3-217ENST00000589998 TONSLQ96HA7 1378 aa28.04■■■□□ 2.08
ILF3-217ENST00000589998 NEFLP07196 543 aa28.03■■■□□ 2.08
ILF3-217ENST00000589998 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ILF3-217ENST00000589998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.01■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.01■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 FMN1Q68DA7 1419 aa28■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 TOPBP1Q92547 1522 aa27.99■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 HFM1A2PYH4 1435 aa27.99■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 UACAQ9BZF9 1416 aa27.98■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 PTPRKQ15262 1439 aa27.98■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
ILF3-217ENST00000589998 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.94■■■□□ 2.06
ILF3-217ENST00000589998 NAIPQ13075 1403 aa27.89■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 SAMD9Q5K651 1589 aa27.89■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 NCOA2Q15596 1464 aa27.87■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.87■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.86■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ILF3-217ENST00000589998 GRIN2BQ13224 1484 aa27.82■■■□□ 2.04
ILF3-217ENST00000589998 NESP48681 1621 aa27.81■■■□□ 2.04
ILF3-217ENST00000589998 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
ILF3-217ENST00000589998 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.78■■■□□ 2.04
ILF3-217ENST00000589998 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.75■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.74■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.72■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 ARHGEF11O15085 1522 aa27.7■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 HECW1Q76N89 1606 aa27.7■■■□□ 2.03
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.7■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.68■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.66■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.64■■■□□ 2.02
ILF3-217ENST00000589998 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.64■■■□□ 2.01
ILF3-217ENST00000589998 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
ILF3-217ENST00000589998 KDM6BO15054 1643 aa27.61■■■□□ 2.01
ILF3-217ENST00000589998 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.59■■■□□ 2.01
ILF3-217ENST00000589998 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.59■■■□□ 2.01
ILF3-217ENST00000589998 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ILF3-217ENST00000589998 AKNAQ7Z591 1439 aa27.56■■■□□ 2
ILF3-217ENST00000589998 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.55■■■□□ 2
ILF3-217ENST00000589998 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
ILF3-217ENST00000589998 MSH5O43196 834 aa27.5■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 CCDC184Q52MB2 194 aa27.48■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.47■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.45■■□□□ 1.99
ILF3-217ENST00000589998 NCOA1Q15788 1441 aa27.45■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 MIA2Q96PC5 1412 aa27.44■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 CCDC7Q96M83 1385 aa27.43■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.43■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.41■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 FOXD1Q16676 465 aa27.4■■□□□ 1.98
ILF3-217ENST00000589998 IQGAP2Q13576 1575 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms