RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589530.5

KDSR-208, Transcript of 3-ketodihydrosphingosine reductase, human

TSL 2

Gene KDSR, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDSR-208	ENST00000589530	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.61	■■■■□ 3.13
KDSR-208	ENST00000589530	CUL7	Q14999	1698 aa		34.6	■■■■□ 3.13
KDSR-208	ENST00000589530	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		34.53	■■■■□ 3.12
KDSR-208	ENST00000589530	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.52	■■■■□ 3.12
KDSR-208	ENST00000589530	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	34.25	■■■■□ 3.07
KDSR-208	ENST00000589530	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.22	■■■■□ 3.07
KDSR-208	ENST00000589530	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.19	■■■■□ 3.06
KDSR-208	ENST00000589530	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		34.19	■■■■□ 3.06
KDSR-208	ENST00000589530	PTPRG	P23470	1445 aa		34.18	■■■■□ 3.06
KDSR-208	ENST00000589530	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		34.18	■■■■□ 3.06
KDSR-208	ENST00000589530	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
KDSR-208	ENST00000589530	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.12	■■■■□ 3.05
KDSR-208	ENST00000589530	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		34.11	■■■■□ 3.05
KDSR-208	ENST00000589530	MAPKBP1	O60336	1514 aa		34.09	■■■■□ 3.05
KDSR-208	ENST00000589530	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		34.07	■■■■□ 3.04
KDSR-208	ENST00000589530	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		34.06	■■■■□ 3.04
KDSR-208	ENST00000589530	DISP1	Q96F81	1524 aa		34.04	■■■■□ 3.04
KDSR-208	ENST00000589530	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		34.01	■■■■□ 3.04
KDSR-208	ENST00000589530	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.95	■■■■□ 3.03
KDSR-208	ENST00000589530	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.94	■■■■□ 3.02
KDSR-208	ENST00000589530	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.93	■■■■□ 3.02
KDSR-208	ENST00000589530	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.91	■■■■□ 3.02
KDSR-208	ENST00000589530	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.9	■■■■□ 3.02
KDSR-208	ENST00000589530	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.88	■■■■□ 3.01
KDSR-208	ENST00000589530	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.86	■■■■□ 3.01
KDSR-208	ENST00000589530	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.81	■■■■□ 3
KDSR-208	ENST00000589530	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.79	■■■■□ 3
KDSR-208	ENST00000589530	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.76	■■■■□ 3
KDSR-208	ENST00000589530	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.76	■■■□□ 2.99
KDSR-208	ENST00000589530	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.74	■■■□□ 2.99
KDSR-208	ENST00000589530	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.7	■■■□□ 2.99
KDSR-208	ENST00000589530	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
KDSR-208	ENST00000589530	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
KDSR-208	ENST00000589530	GLI2	P10070	1586 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KDSR-208	ENST00000589530	EEA1	Q15075	1411 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KDSR-208	ENST00000589530	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
KDSR-208	ENST00000589530	KDM6B	O15054	1643 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KDSR-208	ENST00000589530	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KDSR-208	ENST00000589530	ABCA8	O94911	1581 aa		33.57	■■■□□ 2.96
KDSR-208	ENST00000589530	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
KDSR-208	ENST00000589530	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
KDSR-208	ENST00000589530	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.49	■■■□□ 2.95
KDSR-208	ENST00000589530	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.46	■■■□□ 2.95
KDSR-208	ENST00000589530	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.43	■■■□□ 2.94
KDSR-208	ENST00000589530	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.43	■■■□□ 2.94
KDSR-208	ENST00000589530	KCNH8	Q96L42	1107 aa		33.41	■■■□□ 2.94
KDSR-208	ENST00000589530	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
KDSR-208	ENST00000589530	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.38	■■■□□ 2.93
KDSR-208	ENST00000589530	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.36	■■■□□ 2.93
KDSR-208	ENST00000589530	ATP10B	O94823	1461 aa		33.34	■■■□□ 2.93
KDSR-208	ENST00000589530	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
KDSR-208	ENST00000589530	KIF21B	O75037	1637 aa		33.33	■■■□□ 2.93
KDSR-208	ENST00000589530	CD109	Q6YHK3	1445 aa		33.29	■■■□□ 2.92
KDSR-208	ENST00000589530	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.26	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.25	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KDSR-208	ENST00000589530	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
KDSR-208	ENST00000589530	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
KDSR-208	ENST00000589530	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
KDSR-208	ENST00000589530	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
KDSR-208	ENST00000589530	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KDSR-208	ENST00000589530	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		33.06	■■■□□ 2.88
KDSR-208	ENST00000589530	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.01	■■■□□ 2.87
KDSR-208	ENST00000589530	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.97	■■■□□ 2.87
KDSR-208	ENST00000589530	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.96	■■■□□ 2.87
KDSR-208	ENST00000589530	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.95	■■■□□ 2.86
KDSR-208	ENST00000589530	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KDSR-208	ENST00000589530	NEO1	Q92859	1461 aa		32.88	■■■□□ 2.85
KDSR-208	ENST00000589530	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.88	■■■□□ 2.85
KDSR-208	ENST00000589530	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
KDSR-208	ENST00000589530	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
KDSR-208	ENST00000589530	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.84	■■■□□ 2.85
KDSR-208	ENST00000589530	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.8	■■■□□ 2.84
KDSR-208	ENST00000589530	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.76	■■■□□ 2.83
KDSR-208	ENST00000589530	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KDSR-208	ENST00000589530	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KDSR-208	ENST00000589530	FANCA	O15360	1455 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KDSR-208	ENST00000589530	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
KDSR-208	ENST00000589530	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KDSR-208	ENST00000589530	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
KDSR-208	ENST00000589530	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KDSR-208	ENST00000589530	PLCH2	O75038	1416 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KDSR-208	ENST00000589530	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
KDSR-208	ENST00000589530	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.57	■■■□□ 2.81
KDSR-208	ENST00000589530	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.57	■■■□□ 2.81
KDSR-208	ENST00000589530	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	KIF14	Q15058	1648 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.53	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	CLIP1	P30622	1438 aa		32.52	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.51	■■■□□ 2.8
KDSR-208	ENST00000589530	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
KDSR-208	ENST00000589530	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.48	■■■□□ 2.79
KDSR-208	ENST00000589530	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KDSR-208	ENST00000589530	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.47	■■■□□ 2.79
KDSR-208	ENST00000589530	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.46	■■■□□ 2.79
KDSR-208	ENST00000589530	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.46	■■■□□ 2.79

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