RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 SHROOM2Q13796 1616 aa20.75■□□□□ 0.91
DNMT1-208ENST00000586667 IQGAP2Q13576 1575 aa20.74■□□□□ 0.91
DNMT1-208ENST00000586667 OSCARQ8IYS5 282 aa20.68■□□□□ 0.9
DNMT1-208ENST00000586667 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.66■□□□□ 0.9
DNMT1-208ENST00000586667 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.65■□□□□ 0.9
DNMT1-208ENST00000586667 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.61■□□□□ 0.89
DNMT1-208ENST00000586667 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.61■□□□□ 0.89
DNMT1-208ENST00000586667 SAMD9Q5K651 1589 aa20.6■□□□□ 0.89
DNMT1-208ENST00000586667 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.6■□□□□ 0.89
DNMT1-208ENST00000586667 DISP1Q96F81 1524 aa20.59■□□□□ 0.89
DNMT1-208ENST00000586667 KIAA0556O60303 1618 aa20.56■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.53■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ARHGEF11O15085 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 JPH4Q96JJ6 628 aa20.52■□□□□ 0.88
DNMT1-208ENST00000586667 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.5■□□□□ 0.87
DNMT1-208ENST00000586667 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.5■□□□□ 0.87
DNMT1-208ENST00000586667 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.5■□□□□ 0.87
DNMT1-208ENST00000586667 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.5■□□□□ 0.87
DNMT1-208ENST00000586667 CEP162Q5TB80 1403 aa20.5■□□□□ 0.87
DNMT1-208ENST00000586667 CLIP1P30622 1438 aa20.45■□□□□ 0.86
DNMT1-208ENST00000586667 ARAP1Q96P48 1450 aa20.43■□□□□ 0.86
DNMT1-208ENST00000586667 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.43■□□□□ 0.86
DNMT1-208ENST00000586667 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.42■□□□□ 0.86
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.39■□□□□ 0.85
DNMT1-208ENST00000586667 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
DNMT1-208ENST00000586667 ABCA8O94911 1581 aa20.31■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 PTPRGP23470 1445 aa20.3■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 P3H3Q8IVL6 736 aa20.3■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.28■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.28■□□□□ 0.84
DNMT1-208ENST00000586667 FMN1Q68DA7 1419 aa20.26■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.25■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 ABCC2Q92887 1545 aa20.25■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.22■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 UACAQ9BZF9 1416 aa20.22■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.21■□□□□ 0.83
DNMT1-208ENST00000586667 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.2■□□□□ 0.82
DNMT1-208ENST00000586667 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.19■□□□□ 0.82
DNMT1-208ENST00000586667 HECW1Q76N89 1606 aa20.19■□□□□ 0.82
DNMT1-208ENST00000586667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
DNMT1-208ENST00000586667 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.14■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.14■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.1■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 ATP10BO94823 1461 aa20.08■□□□□ 0.81
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.05■□□□□ 0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MAPKBP1O60336 1514 aa20.04■□□□□ 0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TIAM1Q13009 1591 aa20.04■□□□□ 0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.02■□□□□ 0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MAP3K1Q13233 1512 aa20.01■□□□□ 0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ARID3CA6NKF2 412 aa19.99■□□□□ 0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ASXL2Q76L83 1435 aa19.96■□□□□ 0.79
DNMT1-208ENST00000586667 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.95■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.92■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 KIF14Q15058 1648 aa19.91■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.9■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 DIP2BQ9P265 1576 aa19.9■□□□□ 0.78
DNMT1-208ENST00000586667 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.85■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.84■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.84■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 GLI2P10070 1586 aa19.83■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
DNMT1-208ENST00000586667 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.83■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.761e-10■■□□□ 13.3
DNMT1-208ENST00000586667 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.81■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.8■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.77■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 NCOA2Q15596 1464 aa19.77■□□□□ 0.76
DNMT1-208ENST00000586667 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
DNMT1-208ENST00000586667 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.73■□□□□ 0.75
DNMT1-208ENST00000586667 PREX2Q70Z35 1606 aa19.73■□□□□ 0.75
DNMT1-208ENST00000586667 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.72■□□□□ 0.75
DNMT1-208ENST00000586667 APLP2Q06481 763 aa19.71■□□□□ 0.75
DNMT1-208ENST00000586667 KCNH8Q96L42 1107 aa19.69■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.69■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.69■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.68■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.68■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.65■□□□□ 0.74
DNMT1-208ENST00000586667 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
DNMT1-208ENST00000586667 PLCH2O75038 1416 aa19.64■□□□□ 0.73
DNMT1-208ENST00000586667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.64■□□□□ 0.73
DNMT1-208ENST00000586667 CD109Q6YHK3 1445 aa19.64■□□□□ 0.73
DNMT1-208ENST00000586667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.61■□□□□ 0.73
DNMT1-208ENST00000586667 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.61■□□□□ 0.73
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