RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IQGAP2Q13576 1575 aa25.64■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SHROOM2Q13796 1616 aa25.57■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.56■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 JPH4Q96JJ6 628 aa25.5■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGEF11O15085 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DISP1Q96F81 1524 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIAA0556O60303 1618 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAMD9Q5K651 1589 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP162Q5TB80 1403 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 P3H3Q8IVL6 736 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLIP1P30622 1438 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARAP1Q96P48 1450 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPRGP23470 1445 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.08■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FMN1Q68DA7 1419 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCA8O94911 1581 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UACAQ9BZF9 1416 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCC2Q92887 1545 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HECW1Q76N89 1606 aa24.95■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.95■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARID3CA6NKF2 412 aa24.9■■□□□ 1.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATP10BO94823 1461 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.76■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAPKBP1O60336 1514 aa24.74■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIAM1Q13009 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASXL2Q76L83 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP3K1Q13233 1512 aa24.65■■□□□ 1.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APLP2Q06481 763 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DIP2BQ9P265 1576 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KCNH8Q96L42 1107 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF14Q15058 1648 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.56■■□□□ 1.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GLI2P10070 1586 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.48■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.46■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TSPOAP1O95153 1857 aa24.45■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.43■■□□□ 1.5
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NCOA2Q15596 1464 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CD109Q6YHK3 1445 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PREX2Q70Z35 1606 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLCH2O75038 1416 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms