RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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GGA3-217ENST00000583667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.35■□□□□ 0.85
GGA3-217ENST00000583667 ADGRL1O94910 1474 aa20.34■□□□□ 0.85
GGA3-217ENST00000583667 JPH4Q96JJ6 628 aa20.31■□□□□ 0.84
GGA3-217ENST00000583667 ADAMTS12P58397 1594 aa20.28■□□□□ 0.84
GGA3-217ENST00000583667 TSPOAP1O95153 1857 aa20.26■□□□□ 0.83
GGA3-217ENST00000583667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.25■□□□□ 0.83
GGA3-217ENST00000583667 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.23■□□□□ 0.83
GGA3-217ENST00000583667 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.2■□□□□ 0.82
GGA3-217ENST00000583667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
GGA3-217ENST00000583667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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GGA3-217ENST00000583667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
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GGA3-217ENST00000583667 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.85■□□□□ 0.77
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GGA3-217ENST00000583667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.36■□□□□ 0.69
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GGA3-217ENST00000583667 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.35■□□□□ 0.69
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GGA3-217ENST00000583667 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.21■□□□□ 0.67
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GGA3-217ENST00000583667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.15■□□□□ 0.66
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GGA3-217ENST00000583667 STRCQ7RTU9 1775 aa19.13■□□□□ 0.65
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GGA3-217ENST00000583667 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.08■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.07■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 PTPRTO14522 1441 aa19.07■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.07■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.06■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.06■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.04■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 RICTORQ6R327 1708 aa19.03■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.02■□□□□ 0.64
GGA3-217ENST00000583667 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.99■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.99■□□□□ 0.63
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