RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 MSH5O43196 834 aa10.08□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 SYNJ2O15056 1496 aa10.07□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.07□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 PBRM1Q86U86 1689 aa10.06□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 FKBP8Q14318 412 aa10.06□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 SLC4A2P04920 1241 aa10.05□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 KDM6BO15054 1643 aa10.04□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.04□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
TRIM25-208ENST00000574234 GRIN2BQ13224 1484 aa10.01□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.01□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 SHROOM2Q13796 1616 aa10□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 SOGA1O94964 1423 aa9.99□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 DIP2BQ9P265 1576 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.98□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 CEP170Q5SW79 1584 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.97□□□□□ -0.81
TRIM25-208ENST00000574234 MAPKBP1O60336 1514 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 TSPOAP1O95153 1857 aa9.96□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 FBXO41Q8TF61 875 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.93□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 ADGRL1O94910 1474 aa9.91□□□□□ -0.82
TRIM25-208ENST00000574234 GRIN2AQ12879 1464 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 NUP160Q12769 1436 aa9.89□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.88□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 ADAMTS12P58397 1594 aa9.86□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.85□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.85□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 CUX1P39880 1505 aa9.84□□□□□ -0.83
TRIM25-208ENST00000574234 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.82□□□□□ -0.84
TRIM25-208ENST00000574234 TOP2BQ02880 1626 aa9.79□□□□□ -0.84
TRIM25-208ENST00000574234 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
TRIM25-208ENST00000574234 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 SOCS7O14512 581 aa9.77□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 GLI2P10070 1586 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.76□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.73□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.72□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.71□□□□□ -0.85
TRIM25-208ENST00000574234 JPH4Q96JJ6 628 aa9.69□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 CUL7Q14999 1698 aa9.67□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 ILDR2Q71H61 639 aa9.67□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.66□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.66□□□□□ -0.86
TRIM25-208ENST00000574234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.64□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 KIF21BO75037 1637 aa9.64□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.63□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.63□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 ABCC2Q92887 1545 aa9.62□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.62□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 ASXL2Q76L83 1435 aa9.62□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.61□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 PLCB2Q00722 1185 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM25-208ENST00000574234 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.58□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.57□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRMP28827 1452 aa9.57□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.53□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRGP23470 1445 aa9.53□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.52□□□□□ -0.88
TRIM25-208ENST00000574234 CERKQ8TCT0 537 aa9.52□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 MADDQ8WXG6 1647 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 FBXO3Q9UK99 471 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 UACAQ9BZF9 1416 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.46□□□□□ -0.89
TRIM25-208ENST00000574234 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 IQGAP2Q13576 1575 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 CD109Q6YHK3 1445 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 STRCQ7RTU9 1775 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 BCANQ96GW7 911 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TRIM25-208ENST00000574234 DISP1Q96F81 1524 aa9.4□□□□□ -0.91
TRIM25-208ENST00000574234 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIM25-208ENST00000574234 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIM25-208ENST00000574234 PROM2Q8N271 834 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIM25-208ENST00000574234 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIM25-208ENST00000574234 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.6 ms