RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 KIF27Q86VH2 1401 aa44.82■■■■■ 4.77
E2F4-213ENST00000569573 IGF1RP08069 1367 aa44.75■■■■■ 4.75
E2F4-213ENST00000569573 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.75■■■■■ 4.75
E2F4-213ENST00000569573 CUL7Q14999 1698 aa44.72■■■■■ 4.75
E2F4-213ENST00000569573 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.7■■■■■ 4.75
E2F4-213ENST00000569573 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.67■■■■■ 4.74
E2F4-213ENST00000569573 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.57■■■■■ 4.73
E2F4-213ENST00000569573 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.52■■■■■ 4.72
E2F4-213ENST00000569573 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.52■■■■■ 4.72
E2F4-213ENST00000569573 MAPKBP1O60336 1514 aa44.51■■■■■ 4.72
E2F4-213ENST00000569573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.51■■■■■ 4.72
E2F4-213ENST00000569573 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
E2F4-213ENST00000569573 DIP2BQ9P265 1576 aa44.38■■■■■ 4.69
E2F4-213ENST00000569573 PTPRGP23470 1445 aa44.37■■■■■ 4.69
E2F4-213ENST00000569573 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.34■■■■■ 4.69
E2F4-213ENST00000569573 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.26■■■■■ 4.68
E2F4-213ENST00000569573 IQGAP2Q13576 1575 aa44.26■■■■■ 4.68
E2F4-213ENST00000569573 TSPOAP1O95153 1857 aa44.13■■■■■ 4.65
E2F4-213ENST00000569573 ABCC2Q92887 1545 aa44.12■■■■■ 4.65
E2F4-213ENST00000569573 KDM6BO15054 1643 aa44.11■■■■■ 4.65
E2F4-213ENST00000569573 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.08■■■■■ 4.65
E2F4-213ENST00000569573 DISP1Q96F81 1524 aa44■■■■■ 4.63
E2F4-213ENST00000569573 ASXL2Q76L83 1435 aa43.99■■■■■ 4.63
E2F4-213ENST00000569573 UACAQ9BZF9 1416 aa43.99■■■■■ 4.63
E2F4-213ENST00000569573 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.99■■■■■ 4.63
E2F4-213ENST00000569573 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.99■■■■■ 4.63
E2F4-213ENST00000569573 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.93■■■■■ 4.62
E2F4-213ENST00000569573 GLI2P10070 1586 aa43.84■■■■■ 4.61
E2F4-213ENST00000569573 KIAA0556O60303 1618 aa43.84■■■■■ 4.61
E2F4-213ENST00000569573 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.78■■■■■ 4.6
E2F4-213ENST00000569573 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
E2F4-213ENST00000569573 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
E2F4-213ENST00000569573 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
E2F4-213ENST00000569573 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.71■■■■■ 4.59
E2F4-213ENST00000569573 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.68■■■■■ 4.58
E2F4-213ENST00000569573 GOLGA3Q08378 1498 aa43.65■■■■■ 4.58
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.6■■■■■ 4.57
E2F4-213ENST00000569573 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.59■■■■■ 4.57
E2F4-213ENST00000569573 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.54■■■■■ 4.56
E2F4-213ENST00000569573 PRXQ9BXM0 1461 aa43.51■■■■■ 4.56
E2F4-213ENST00000569573 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
E2F4-213ENST00000569573 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
E2F4-213ENST00000569573 ABCA8O94911 1581 aa43.41■■■■■ 4.54
E2F4-213ENST00000569573 KCNH8Q96L42 1107 aa43.39■■■■■ 4.54
E2F4-213ENST00000569573 ADGRL1O94910 1474 aa43.35■■■■■ 4.53
E2F4-213ENST00000569573 CD109Q6YHK3 1445 aa43.32■■■■■ 4.53
E2F4-213ENST00000569573 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.27■■■■■ 4.52
E2F4-213ENST00000569573 P3H3Q8IVL6 736 aa43.27■■■■■ 4.52
E2F4-213ENST00000569573 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.24■■■■■ 4.51
E2F4-213ENST00000569573 ARID3CA6NKF2 412 aa43.22■■■■■ 4.51
E2F4-213ENST00000569573 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.22■■■■■ 4.51
E2F4-213ENST00000569573 ATP10BO94823 1461 aa43.07■■■■■ 4.49
E2F4-213ENST00000569573 SAMD9Q5K651 1589 aa43.03■■■■■ 4.48
E2F4-213ENST00000569573 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
E2F4-213ENST00000569573 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
E2F4-213ENST00000569573 EEA1Q15075 1411 aa43■■■■■ 4.47
E2F4-213ENST00000569573 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
E2F4-213ENST00000569573 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.97■■■■■ 4.47
E2F4-213ENST00000569573 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.91■■■■■ 4.46
E2F4-213ENST00000569573 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.89■■■■■ 4.46
E2F4-213ENST00000569573 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.85■■■■■ 4.45
E2F4-213ENST00000569573 KIF21BO75037 1637 aa42.82■■■■■ 4.45
E2F4-213ENST00000569573 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.81■■■■■ 4.44
E2F4-213ENST00000569573 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.79■■■■■ 4.44
E2F4-213ENST00000569573 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
E2F4-213ENST00000569573 NEO1Q92859 1461 aa42.74■■■■■ 4.43
E2F4-213ENST00000569573 RAPGEF3O95398 923 aa42.7■■■■■ 4.43
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.69■■■■■ 4.42
E2F4-213ENST00000569573 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.63■■■■■ 4.42
E2F4-213ENST00000569573 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
E2F4-213ENST00000569573 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
E2F4-213ENST00000569573 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.49■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.48■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 FANCAO15360 1455 aa42.45■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.44■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.44■■■■■ 4.39
E2F4-213ENST00000569573 AKNAQ7Z591 1439 aa42.44■■■■■ 4.38
E2F4-213ENST00000569573 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.388e-9■■■■■ 57.3
E2F4-213ENST00000569573 PTPRMP28827 1452 aa42.43■■■■■ 4.38
E2F4-213ENST00000569573 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.36■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.36■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.35■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 RICTORQ6R327 1708 aa42.33■■■■■ 4.37
E2F4-213ENST00000569573 FMN1Q68DA7 1419 aa42.3■■■■■ 4.36
E2F4-213ENST00000569573 MADDQ8WXG6 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
E2F4-213ENST00000569573 HECW1Q76N89 1606 aa42.25■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.21■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.2■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.2■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.2■■■■■ 4.35
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.19■■■■■ 4.34
E2F4-213ENST00000569573 PLCH2O75038 1416 aa42.19■■■■■ 4.34
E2F4-213ENST00000569573 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.15■■■■■ 4.34
E2F4-213ENST00000569573 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
E2F4-213ENST00000569573 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.14■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms