RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.87■■■■■ 4.13
RBBP6-211ENST00000568316 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.79■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 SHROOM2Q13796 1616 aa40.79■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 IQGAP2Q13576 1575 aa40.79■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF11O15085 1522 aa40.78■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 JPH4Q96JJ6 628 aa40.78■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 GOLGA3Q08378 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
RBBP6-211ENST00000568316 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RBBP6-211ENST00000568316 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RBBP6-211ENST00000568316 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RBBP6-211ENST00000568316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
RBBP6-211ENST00000568316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.66■■■■■ 4.1
RBBP6-211ENST00000568316 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
RBBP6-211ENST00000568316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.57■■■■■ 4.08
RBBP6-211ENST00000568316 ARAP1Q96P48 1450 aa40.51■■■■■ 4.07
RBBP6-211ENST00000568316 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
RBBP6-211ENST00000568316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.47■■■■■ 4.07
RBBP6-211ENST00000568316 DISP1Q96F81 1524 aa40.47■■■■■ 4.07
RBBP6-211ENST00000568316 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.4■■■■■ 4.06
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA0556O60303 1618 aa40.4■■■■■ 4.06
RBBP6-211ENST00000568316 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.37■■■■■ 4.05
RBBP6-211ENST00000568316 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.33■■■■■ 4.05
RBBP6-211ENST00000568316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
RBBP6-211ENST00000568316 SAMD9Q5K651 1589 aa40.29■■■■■ 4.04
RBBP6-211ENST00000568316 P3H3Q8IVL6 736 aa40.28■■■■■ 4.04
RBBP6-211ENST00000568316 PTPRGP23470 1445 aa40.25■■■■■ 4.03
RBBP6-211ENST00000568316 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.21■■■■■ 4.03
RBBP6-211ENST00000568316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.14■■■■■ 4.02
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.13■■■■■ 4.01
RBBP6-211ENST00000568316 CLIP1P30622 1438 aa40.07■■■■■ 4
RBBP6-211ENST00000568316 CEP162Q5TB80 1403 aa40.02■■■■■ 4
RBBP6-211ENST00000568316 UACAQ9BZF9 1416 aa39.99■■■■□ 3.99
RBBP6-211ENST00000568316 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.98■■■■□ 3.99
RBBP6-211ENST00000568316 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.98■■■■□ 3.99
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC2Q92887 1545 aa39.91■■■■□ 3.98
RBBP6-211ENST00000568316 ABCA8O94911 1581 aa39.91■■■■□ 3.98
RBBP6-211ENST00000568316 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
RBBP6-211ENST00000568316 FMN1Q68DA7 1419 aa39.82■■■■□ 3.97
RBBP6-211ENST00000568316 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.81■■■■□ 3.96
RBBP6-211ENST00000568316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.78■■■■□ 3.96
RBBP6-211ENST00000568316 ARID3CA6NKF2 412 aa39.72■■■■□ 3.95
RBBP6-211ENST00000568316 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.71■■■■□ 3.95
RBBP6-211ENST00000568316 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
RBBP6-211ENST00000568316 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
RBBP6-211ENST00000568316 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
RBBP6-211ENST00000568316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
RBBP6-211ENST00000568316 HECW1Q76N89 1606 aa39.61■■■■□ 3.93
RBBP6-211ENST00000568316 ATP10BO94823 1461 aa39.6■■■■□ 3.93
RBBP6-211ENST00000568316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.58■■■■□ 3.93
RBBP6-211ENST00000568316 MAPKBP1O60336 1514 aa39.58■■■■□ 3.93
RBBP6-211ENST00000568316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
RBBP6-211ENST00000568316 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
RBBP6-211ENST00000568316 ASXL2Q76L83 1435 aa39.53■■■■□ 3.92
RBBP6-211ENST00000568316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.52■■■■□ 3.92
RBBP6-211ENST00000568316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
RBBP6-211ENST00000568316 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.49■■■■□ 3.91
RBBP6-211ENST00000568316 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
RBBP6-211ENST00000568316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.44■■■■□ 3.9
RBBP6-211ENST00000568316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
RBBP6-211ENST00000568316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.41■■■■□ 3.9
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.37■■■■□ 3.89
RBBP6-211ENST00000568316 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.35■■■■□ 3.89
RBBP6-211ENST00000568316 DIP2BQ9P265 1576 aa39.33■■■■□ 3.89
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.3■■■■□ 3.88
RBBP6-211ENST00000568316 KCNH8Q96L42 1107 aa39.29■■■■□ 3.88
RBBP6-211ENST00000568316 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.28■■■■□ 3.88
RBBP6-211ENST00000568316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.26■■■■□ 3.88
RBBP6-211ENST00000568316 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
RBBP6-211ENST00000568316 GLI2P10070 1586 aa39.16■■■■□ 3.86
RBBP6-211ENST00000568316 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.15■■■■□ 3.86
RBBP6-211ENST00000568316 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
RBBP6-211ENST00000568316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.13■■■■□ 3.86
RBBP6-211ENST00000568316 TIAM1Q13009 1591 aa39.12■■■■□ 3.85
RBBP6-211ENST00000568316 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.06■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 APLP2Q06481 763 aa39.04■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 KIF14Q15058 1648 aa39.03■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.03■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.03■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K1Q13233 1512 aa39.02■■■■□ 3.84
RBBP6-211ENST00000568316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.01■■■■□ 3.843e-7■■■□□ 16.3
RBBP6-211ENST00000568316 TSPOAP1O95153 1857 aa39■■■■□ 3.83
RBBP6-211ENST00000568316 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.99■■■■□ 3.83
RBBP6-211ENST00000568316 CD109Q6YHK3 1445 aa38.98■■■■□ 3.83
RBBP6-211ENST00000568316 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.98■■■■□ 3.83
RBBP6-211ENST00000568316 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.93■■■■□ 3.82
RBBP6-211ENST00000568316 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
RBBP6-211ENST00000568316 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
RBBP6-211ENST00000568316 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.8■■■■□ 3.8
RBBP6-211ENST00000568316 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
RBBP6-211ENST00000568316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.79■■■■□ 3.8
RBBP6-211ENST00000568316 PLCH2O75038 1416 aa38.76■■■■□ 3.8
RBBP6-211ENST00000568316 NCOA2Q15596 1464 aa38.76■■■■□ 3.8
RBBP6-211ENST00000568316 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.72■■■■□ 3.79
RBBP6-211ENST00000568316 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.7■■■■□ 3.79
RBBP6-211ENST00000568316 PREX2Q70Z35 1606 aa38.7■■■■□ 3.79
RBBP6-211ENST00000568316 FANCAO15360 1455 aa38.69■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.68■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.67■■■■□ 3.78
RBBP6-211ENST00000568316 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms