RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-204ENST00000561518 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
RNPS1-204ENST00000561518 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.47■■■□□ 2.15
RNPS1-204ENST00000561518 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.45■■■□□ 2.15
RNPS1-204ENST00000561518 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.45■■■□□ 2.14
RNPS1-204ENST00000561518 IQGAP2Q13576 1575 aa28.39■■■□□ 2.14
RNPS1-204ENST00000561518 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.36■■■□□ 2.13
RNPS1-204ENST00000561518 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
RNPS1-204ENST00000561518 JPH4Q96JJ6 628 aa28.33■■■□□ 2.13
RNPS1-204ENST00000561518 SHROOM2Q13796 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
RNPS1-204ENST00000561518 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.25■■■□□ 2.11
RNPS1-204ENST00000561518 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RNPS1-204ENST00000561518 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.21■■■□□ 2.11
RNPS1-204ENST00000561518 DISP1Q96F81 1524 aa28.18■■■□□ 2.1
RNPS1-204ENST00000561518 P3H3Q8IVL6 736 aa28.16■■■□□ 2.1
RNPS1-204ENST00000561518 CEP162Q5TB80 1403 aa28.15■■■□□ 2.1
RNPS1-204ENST00000561518 SAMD9Q5K651 1589 aa28.13■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 CLIP1P30622 1438 aa28.13■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 KIAA0556O60303 1618 aa28.13■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.12■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 ARHGEF11O15085 1522 aa28.12■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.11■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.08■■■□□ 2.09
RNPS1-204ENST00000561518 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.07■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.06■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
RNPS1-204ENST00000561518 ARAP1Q96P48 1450 aa27.99■■■□□ 2.07
RNPS1-204ENST00000561518 PTPRGP23470 1445 aa27.96■■■□□ 2.07
RNPS1-204ENST00000561518 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.87■■■□□ 2.05
RNPS1-204ENST00000561518 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.83■■■□□ 2.05
RNPS1-204ENST00000561518 FMN1Q68DA7 1419 aa27.83■■■□□ 2.05
RNPS1-204ENST00000561518 ABCA8O94911 1581 aa27.78■■■□□ 2.04
RNPS1-204ENST00000561518 UACAQ9BZF9 1416 aa27.78■■■□□ 2.04
RNPS1-204ENST00000561518 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.75■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.74■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC2Q92887 1545 aa27.72■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.71■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.7■■■□□ 2.03
RNPS1-204ENST00000561518 ARID3CA6NKF2 412 aa27.7■■■□□ 2.02
RNPS1-204ENST00000561518 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.7■■■□□ 2.02
RNPS1-204ENST00000561518 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
RNPS1-204ENST00000561518 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.65■■■□□ 2.02
RNPS1-204ENST00000561518 HECW1Q76N89 1606 aa27.64■■■□□ 2.02
RNPS1-204ENST00000561518 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.58■■■□□ 2.01
RNPS1-204ENST00000561518 ATP10BO94823 1461 aa27.58■■■□□ 2.01
RNPS1-204ENST00000561518 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.57■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
RNPS1-204ENST00000561518 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.5■■□□□ 1.99
RNPS1-204ENST00000561518 TIAM1Q13009 1591 aa27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-204ENST00000561518 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.43■■□□□ 1.98
RNPS1-204ENST00000561518 APLP2Q06481 763 aa27.42■■□□□ 1.98
RNPS1-204ENST00000561518 ASXL2Q76L83 1435 aa27.41■■□□□ 1.98
RNPS1-204ENST00000561518 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.39■■□□□ 1.98
RNPS1-204ENST00000561518 MAPKBP1O60336 1514 aa27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 MAP3K1Q13233 1512 aa27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.34■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
RNPS1-204ENST00000561518 KCNH8Q96L42 1107 aa27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-204ENST00000561518 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.32■■□□□ 1.96
RNPS1-204ENST00000561518 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-204ENST00000561518 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
RNPS1-204ENST00000561518 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.26■■□□□ 1.96
RNPS1-204ENST00000561518 KIF14Q15058 1648 aa27.24■■□□□ 1.95
RNPS1-204ENST00000561518 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.19■■□□□ 1.94
RNPS1-204ENST00000561518 DIP2BQ9P265 1576 aa27.18■■□□□ 1.94
RNPS1-204ENST00000561518 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.16■■□□□ 1.94
RNPS1-204ENST00000561518 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.942e-7■■■□□ 19.1
RNPS1-204ENST00000561518 NCOA2Q15596 1464 aa27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-204ENST00000561518 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
RNPS1-204ENST00000561518 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.14■■□□□ 1.93
RNPS1-204ENST00000561518 GLI2P10070 1586 aa27.11■■□□□ 1.93
RNPS1-204ENST00000561518 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-204ENST00000561518 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-204ENST00000561518 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.1■■□□□ 1.93
RNPS1-204ENST00000561518 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.05■■□□□ 1.92
RNPS1-204ENST00000561518 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-204ENST00000561518 CD109Q6YHK3 1445 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-204ENST00000561518 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.04■■□□□ 1.92
RNPS1-204ENST00000561518 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RNPS1-204ENST00000561518 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
RNPS1-204ENST00000561518 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.99■■□□□ 1.91
RNPS1-204ENST00000561518 PLCH2O75038 1416 aa26.99■■□□□ 1.91
RNPS1-204ENST00000561518 PREX2Q70Z35 1606 aa26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-204ENST00000561518 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.96■■□□□ 1.91
RNPS1-204ENST00000561518 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.95■■□□□ 1.9
RNPS1-204ENST00000561518 TSPOAP1O95153 1857 aa26.95■■□□□ 1.9
RNPS1-204ENST00000561518 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.94■■□□□ 1.9
RNPS1-204ENST00000561518 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms