RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557404.3

KIAA0391-204, Transcript of KIAA0391, humanhuman

TSL 3

Gene KIAA0391, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0391-204ENST00000557404 OSCARQ8IYS5 282 aa23.25■■□□□ 1.31
KIAA0391-204ENST00000557404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.24■■□□□ 1.31
KIAA0391-204ENST00000557404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.19■■□□□ 1.3
KIAA0391-204ENST00000557404 SHROOM2Q13796 1616 aa23.19■■□□□ 1.3
KIAA0391-204ENST00000557404 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.19■■□□□ 1.3
KIAA0391-204ENST00000557404 IQGAP2Q13576 1575 aa23.14■■□□□ 1.3
KIAA0391-204ENST00000557404 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.13■■□□□ 1.29
KIAA0391-204ENST00000557404 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.11■■□□□ 1.29
KIAA0391-204ENST00000557404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.11■■□□□ 1.29
KIAA0391-204ENST00000557404 JPH4Q96JJ6 628 aa23.1■■□□□ 1.29
KIAA0391-204ENST00000557404 DISP1Q96F81 1524 aa23.08■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 SAMD9Q5K651 1589 aa23.02■■□□□ 1.28
KIAA0391-204ENST00000557404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
KIAA0391-204ENST00000557404 ARHGEF11O15085 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
KIAA0391-204ENST00000557404 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.97■■□□□ 1.27
KIAA0391-204ENST00000557404 KIAA0556O60303 1618 aa22.97■■□□□ 1.27
KIAA0391-204ENST00000557404 CEP162Q5TB80 1403 aa22.92■■□□□ 1.26
KIAA0391-204ENST00000557404 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.89■■□□□ 1.26
KIAA0391-204ENST00000557404 ARAP1Q96P48 1450 aa22.88■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 CLIP1P30622 1438 aa22.87■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.85■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 P3H3Q8IVL6 736 aa22.84■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.83■■□□□ 1.25
KIAA0391-204ENST00000557404 PTPRGP23470 1445 aa22.75■■□□□ 1.23
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCA8O94911 1581 aa22.74■■□□□ 1.23
KIAA0391-204ENST00000557404 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
KIAA0391-204ENST00000557404 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.68■■□□□ 1.22
KIAA0391-204ENST00000557404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.66■■□□□ 1.22
KIAA0391-204ENST00000557404 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.66■■□□□ 1.22
KIAA0391-204ENST00000557404 UACAQ9BZF9 1416 aa22.65■■□□□ 1.22
KIAA0391-204ENST00000557404 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 FMN1Q68DA7 1419 aa22.63■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.62■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.62■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCC2Q92887 1545 aa22.62■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.61■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.6■■□□□ 1.21
KIAA0391-204ENST00000557404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.56■■□□□ 1.2
KIAA0391-204ENST00000557404 ATP10BO94823 1461 aa22.54■■□□□ 1.2
KIAA0391-204ENST00000557404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.54■■□□□ 1.2
KIAA0391-204ENST00000557404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
KIAA0391-204ENST00000557404 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
KIAA0391-204ENST00000557404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
KIAA0391-204ENST00000557404 HECW1Q76N89 1606 aa22.48■■□□□ 1.19
KIAA0391-204ENST00000557404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.45■■□□□ 1.18
KIAA0391-204ENST00000557404 ARID3CA6NKF2 412 aa22.43■■□□□ 1.18
KIAA0391-204ENST00000557404 MAPKBP1O60336 1514 aa22.39■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 MAP3K1Q13233 1512 aa22.38■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.38■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.37■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 TIAM1Q13009 1591 aa22.37■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 ASXL2Q76L83 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KIAA0391-204ENST00000557404 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.28■■□□□ 1.16
KIAA0391-204ENST00000557404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.28■■□□□ 1.16
KIAA0391-204ENST00000557404 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
KIAA0391-204ENST00000557404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
KIAA0391-204ENST00000557404 KIF14Q15058 1648 aa22.24■■□□□ 1.15
KIAA0391-204ENST00000557404 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.22■■□□□ 1.15
KIAA0391-204ENST00000557404 DIP2BQ9P265 1576 aa22.22■■□□□ 1.15
KIAA0391-204ENST00000557404 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.2■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.2■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 GLI2P10070 1586 aa22.2■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.19■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.16■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.16■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.14■■□□□ 1.14
KIAA0391-204ENST00000557404 KCNH8Q96L42 1107 aa22.14■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 NCOA2Q15596 1464 aa22.12■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.12■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
KIAA0391-204ENST00000557404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.08■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.07■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.06■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 APLP2Q06481 763 aa22.05■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.04■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 PLCH2O75038 1416 aa22.03■■□□□ 1.12
KIAA0391-204ENST00000557404 CD109Q6YHK3 1445 aa22.01■■□□□ 1.11
KIAA0391-204ENST00000557404 PREX2Q70Z35 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
KIAA0391-204ENST00000557404 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22■■□□□ 1.11
KIAA0391-204ENST00000557404 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.98■■□□□ 1.11
KIAA0391-204ENST00000557404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.96■■□□□ 1.11
KIAA0391-204ENST00000557404 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.95■■□□□ 1.1
KIAA0391-204ENST00000557404 TSPOAP1O95153 1857 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms