RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.41■■■■□ 3.58
CIPC-208ENST00000557115 CUL7Q14999 1698 aa37.41■■■■□ 3.58
CIPC-208ENST00000557115 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.36■■■■□ 3.57
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.34■■■■□ 3.57
CIPC-208ENST00000557115 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.54
CIPC-208ENST00000557115 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.02■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.02■■■■□ 3.52
CIPC-208ENST00000557115 PTPRGP23470 1445 aa37.01■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 IQGAP2Q13576 1575 aa37■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.96■■■■□ 3.51
CIPC-208ENST00000557115 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.93■■■■□ 3.5
CIPC-208ENST00000557115 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.92■■■■□ 3.5
CIPC-208ENST00000557115 MAPKBP1O60336 1514 aa36.87■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.85■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.82■■■■□ 3.49
CIPC-208ENST00000557115 DISP1Q96F81 1524 aa36.78■■■■□ 3.48
CIPC-208ENST00000557115 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.75■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 DIP2BQ9P265 1576 aa36.7■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 ABCC2Q92887 1545 aa36.7■■■■□ 3.47
CIPC-208ENST00000557115 UACAQ9BZF9 1416 aa36.69■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 PRXQ9BXM0 1461 aa36.66■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.64■■■■□ 3.46
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0556O60303 1618 aa36.63■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.59■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 ASXL2Q76L83 1435 aa36.58■■■■□ 3.45
CIPC-208ENST00000557115 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.56■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA3Q08378 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.55■■■■□ 3.44
CIPC-208ENST00000557115 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.47■■■■□ 3.43
CIPC-208ENST00000557115 TSPOAP1O95153 1857 aa36.45■■■■□ 3.43
CIPC-208ENST00000557115 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
CIPC-208ENST00000557115 EEA1Q15075 1411 aa36.4■■■■□ 3.42
CIPC-208ENST00000557115 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 KDM6BO15054 1643 aa36.37■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 P3H3Q8IVL6 736 aa36.36■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 GLI2P10070 1586 aa36.36■■■■□ 3.41
CIPC-208ENST00000557115 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
CIPC-208ENST00000557115 ABCA8O94911 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
CIPC-208ENST00000557115 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.25■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 KCNH8Q96L42 1107 aa36.2■■■■□ 3.39
CIPC-208ENST00000557115 ARID3CA6NKF2 412 aa36.18■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.15■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.15■■■■□ 3.38
CIPC-208ENST00000557115 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.1■■■■□ 3.37
CIPC-208ENST00000557115 SAMD9Q5K651 1589 aa36.1■■■■□ 3.37
CIPC-208ENST00000557115 CD109Q6YHK3 1445 aa36.05■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 ATP10BO94823 1461 aa36.04■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.02■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 KIF21BO75037 1637 aa36.01■■■■□ 3.36
CIPC-208ENST00000557115 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.99■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.95■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CIPC-208ENST00000557115 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.94■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.93■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.92■■■■□ 3.34
CIPC-208ENST00000557115 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.85■■■■□ 3.33
CIPC-208ENST00000557115 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.77■■■■□ 3.32
CIPC-208ENST00000557115 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.72■■■■□ 3.31
CIPC-208ENST00000557115 ADGRL1O94910 1474 aa35.69■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.66■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.64■■■■□ 3.3
CIPC-208ENST00000557115 FMN1Q68DA7 1419 aa35.61■■■■□ 3.29
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.58■■■■□ 3.29
CIPC-208ENST00000557115 NEO1Q92859 1461 aa35.57■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 RAPGEF3O95398 923 aa35.55■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CIPC-208ENST00000557115 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 HECW1Q76N89 1606 aa35.46■■■■□ 3.27
CIPC-208ENST00000557115 FANCAO15360 1455 aa35.41■■■■□ 3.26
CIPC-208ENST00000557115 AKNAQ7Z591 1439 aa35.4■■■■□ 3.26
CIPC-208ENST00000557115 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.38■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
CIPC-208ENST00000557115 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.3■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 PLCH2O75038 1416 aa35.29■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 CLIP1P30622 1438 aa35.26■■■■□ 3.24
CIPC-208ENST00000557115 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.23■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.22■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 KIF14Q15058 1648 aa35.2■■■■□ 3.23
CIPC-208ENST00000557115 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.19■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 RICTORQ6R327 1708 aa35.18■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.16■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.15■■■■□ 3.22
CIPC-208ENST00000557115 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.12■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.11■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.1■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms