RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.88■■■■□ 3.01
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUL7Q14999 1698 aa33.76■■■□□ 2.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.7■■■□□ 2.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.65■■■□□ 2.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.65■■■□□ 2.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.62■■■□□ 2.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPKBP1O60336 1514 aa33.6■■■□□ 2.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.59■■■□□ 2.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRGP23470 1445 aa33.55■■■□□ 2.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.51■■■□□ 2.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.47■■■□□ 2.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIP2BQ9P265 1576 aa33.46■■■□□ 2.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQGAP2Q13576 1575 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.35■■■□□ 2.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC2Q92887 1545 aa33.33■■■□□ 2.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DISP1Q96F81 1524 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UACAQ9BZF9 1416 aa33.27■■■□□ 2.92
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.24■■■□□ 2.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASXL2Q76L83 1435 aa33.23■■■□□ 2.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.23■■■□□ 2.91
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM6BO15054 1643 aa33.2■■■□□ 2.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPOAP1O95153 1857 aa33.19■■■□□ 2.9
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLI2P10070 1586 aa33.13■■■□□ 2.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.12■■■□□ 2.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA0556O60303 1618 aa33.09■■■□□ 2.89
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.01■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGA3Q08378 1498 aa32.99■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRXQ9BXM0 1461 aa32.99■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.95■■■□□ 2.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.89■■■□□ 2.86
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.88■■■□□ 2.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.87■■■□□ 2.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA8O94911 1581 aa32.83■■■□□ 2.85
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.79■■■□□ 2.84
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNH8Q96L42 1107 aa32.78■■■□□ 2.84
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD109Q6YHK3 1445 aa32.73■■■□□ 2.83
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P3H3Q8IVL6 736 aa32.71■■■□□ 2.83
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.69■■■□□ 2.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRL1O94910 1474 aa32.65■■■□□ 2.82
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.63■■■□□ 2.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP10BO94823 1461 aa32.61■■■□□ 2.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARID3CA6NKF2 412 aa32.6■■■□□ 2.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EEA1Q15075 1411 aa32.59■■■□□ 2.81
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD9Q5K651 1589 aa32.53■■■□□ 2.8
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.45■■■□□ 2.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.44■■■□□ 2.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.43■■■□□ 2.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.39■■■□□ 2.78
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.35■■■□□ 2.77
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.31■■■□□ 2.76
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEO1Q92859 1461 aa32.29■■■□□ 2.76
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAPGEF3O95398 923 aa32.27■■■□□ 2.76
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF21BO75037 1637 aa32.25■■■□□ 2.75
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.23■■■□□ 2.75
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.19■■■□□ 2.74
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKNAQ7Z591 1439 aa32.08■■■□□ 2.73
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.07■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.06■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.06■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FANCAO15360 1455 aa32.05■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.02■■■□□ 2.72
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRMP28827 1452 aa32.01■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FMN1Q68DA7 1419 aa32■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.98■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.96■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.94■■■□□ 2.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RICTORQ6R327 1708 aa31.94■■■□□ 2.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLCH2O75038 1416 aa31.93■■■□□ 2.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.93■■■□□ 2.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.91■■■□□ 2.7
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HECW1Q76N89 1606 aa31.87■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.87■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.86■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.86■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.86■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MADDQ8WXG6 1647 aa31.85■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.84■■■□□ 2.69
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.82■■■□□ 2.68
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