RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550066.5

ROR2-208, Transcript of receptor tyrosine kinase like orphan receptor 2, human

TSL 2

Gene ROR2, Length 4,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROR2-208	ENST00000550066	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROR2-208	ENST00000550066	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROR2-208	ENST00000550066	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROR2-208	ENST00000550066	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ROR2-208	ENST00000550066	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	NBR1	Q14596	966 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ROR2-208	ENST00000550066	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ROR2-208	ENST00000550066	NES	P48681	1621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	CFTR	P13569	1480 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	IGF1R	P08069	1367 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ROR2-208	ENST00000550066	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	SYNJ1	O43426	1573 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ROR2-208	ENST00000550066	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23	5e-6	■■□□□ 14.3
ROR2-208	ENST00000550066	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ROR2-208	ENST00000550066	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24	1e-6	■■■■■ 62.1
ROR2-208	ENST00000550066	CUX1	P39880	1505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ROR2-208	ENST00000550066	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ROR2-208	ENST00000550066	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ROR2-208	ENST00000550066	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ROR2-208	ENST00000550066	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	TOP2B	Q02880	1626 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	FOXD1	Q16676	465 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	ARX	Q96QS3	562 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ROR2-208	ENST00000550066	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	PTPRG	P23470	1445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26	1e-6	■■■■■ 26.9
ROR2-208	ENST00000550066	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	KIF21B	O75037	1637 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	PKD2	Q13563	968 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	NEFM	P07197	916 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	GGT6	Q6P531	493 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ROR2-208	ENST00000550066	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	MLEC	Q14165	292 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	ARAP1	Q96P48	1450 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	NUP155	O75694	1391 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ROR2-208	ENST00000550066	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms