RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
CS-214ENST00000548849 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.83■■■□□ 2.37
CS-214ENST00000548849 IGF1RP08069 1367 aa29.83■■■□□ 2.37
CS-214ENST00000548849 KIF27Q86VH2 1401 aa29.82■■■□□ 2.36
CS-214ENST00000548849 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.78■■■□□ 2.36
CS-214ENST00000548849 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.76■■■□□ 2.35
CS-214ENST00000548849 CUL7Q14999 1698 aa29.75■■■□□ 2.35
CS-214ENST00000548849 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.71■■■□□ 2.35
CS-214ENST00000548849 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.69■■■□□ 2.34
CS-214ENST00000548849 MAPKBP1O60336 1514 aa29.68■■■□□ 2.34
CS-214ENST00000548849 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.64■■■□□ 2.34
CS-214ENST00000548849 DIP2BQ9P265 1576 aa29.6■■■□□ 2.33
CS-214ENST00000548849 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CS-214ENST00000548849 PTPRGP23470 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
CS-214ENST00000548849 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.52■■■□□ 2.32
CS-214ENST00000548849 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.5■■■□□ 2.31
CS-214ENST00000548849 IQGAP2Q13576 1575 aa29.46■■■□□ 2.31
CS-214ENST00000548849 TSPOAP1O95153 1857 aa29.46■■■□□ 2.31
CS-214ENST00000548849 KDM6BO15054 1643 aa29.42■■■□□ 2.3
CS-214ENST00000548849 ABCC2Q92887 1545 aa29.4■■■□□ 2.3
CS-214ENST00000548849 ASXL2Q76L83 1435 aa29.34■■■□□ 2.29
CS-214ENST00000548849 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.34■■■□□ 2.29
CS-214ENST00000548849 DISP1Q96F81 1524 aa29.33■■■□□ 2.29
CS-214ENST00000548849 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.32■■■□□ 2.28
CS-214ENST00000548849 UACAQ9BZF9 1416 aa29.32■■■□□ 2.28
CS-214ENST00000548849 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.31■■■□□ 2.28
CS-214ENST00000548849 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.25■■■□□ 2.27
CS-214ENST00000548849 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.24■■■□□ 2.27
CS-214ENST00000548849 GLI2P10070 1586 aa29.24■■■□□ 2.27
CS-214ENST00000548849 KIAA0556O60303 1618 aa29.19■■■□□ 2.26
CS-214ENST00000548849 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.19■■■□□ 2.26
CS-214ENST00000548849 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CS-214ENST00000548849 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CS-214ENST00000548849 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CS-214ENST00000548849 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.08■■■□□ 2.25
CS-214ENST00000548849 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.07■■■□□ 2.24
CS-214ENST00000548849 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.04■■■□□ 2.24
CS-214ENST00000548849 GOLGA3Q08378 1498 aa29.04■■■□□ 2.24
CS-214ENST00000548849 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CS-214ENST00000548849 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29■■■□□ 2.23
CS-214ENST00000548849 PRXQ9BXM0 1461 aa28.96■■■□□ 2.23
CS-214ENST00000548849 KCNH8Q96L42 1107 aa28.95■■■□□ 2.22
CS-214ENST00000548849 ADGRL1O94910 1474 aa28.94■■■□□ 2.22
CS-214ENST00000548849 ABCA8O94911 1581 aa28.92■■■□□ 2.22
CS-214ENST00000548849 CD109Q6YHK3 1445 aa28.88■■■□□ 2.21
CS-214ENST00000548849 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CS-214ENST00000548849 P3H3Q8IVL6 736 aa28.85■■■□□ 2.21
CS-214ENST00000548849 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.84■■■□□ 2.21
CS-214ENST00000548849 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.83■■■□□ 2.21
CS-214ENST00000548849 ARID3CA6NKF2 412 aa28.81■■■□□ 2.2
CS-214ENST00000548849 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.77■■■□□ 2.2
CS-214ENST00000548849 ATP10BO94823 1461 aa28.72■■■□□ 2.19
CS-214ENST00000548849 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CS-214ENST00000548849 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CS-214ENST00000548849 SAMD9Q5K651 1589 aa28.64■■■□□ 2.18
CS-214ENST00000548849 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CS-214ENST00000548849 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.6■■■□□ 2.17
CS-214ENST00000548849 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.6■■■□□ 2.17
CS-214ENST00000548849 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.59■■■□□ 2.17
CS-214ENST00000548849 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.58■■■□□ 2.17
CS-214ENST00000548849 KIF21BO75037 1637 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-214ENST00000548849 EEA1Q15075 1411 aa28.55■■■□□ 2.16
CS-214ENST00000548849 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.55■■■□□ 2.16
CS-214ENST00000548849 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CS-214ENST00000548849 RAPGEF3O95398 923 aa28.5■■■□□ 2.15
CS-214ENST00000548849 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.5■■■□□ 2.15
CS-214ENST00000548849 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CS-214ENST00000548849 NEO1Q92859 1461 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-214ENST00000548849 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.44■■■□□ 2.14
CS-214ENST00000548849 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CS-214ENST00000548849 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-214ENST00000548849 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-214ENST00000548849 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-214ENST00000548849 PTPRMP28827 1452 aa28.32■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 AKNAQ7Z591 1439 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.122e-20■□□□□ 10.1
CS-214ENST00000548849 FANCAO15360 1455 aa28.27■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.26■■■□□ 2.12
CS-214ENST00000548849 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.24■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 RICTORQ6R327 1708 aa28.22■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 MADDQ8WXG6 1647 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-214ENST00000548849 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.2■■■□□ 2.1
CS-214ENST00000548849 FMN1Q68DA7 1419 aa28.12■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 PLCH2O75038 1416 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.1■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.1■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 HECW1Q76N89 1606 aa28.08■■■□□ 2.09
CS-214ENST00000548849 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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