RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545227.6

LLGL2-204, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LLGL2, Length 3,527 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-204ENST00000545227 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.64■□□□□ 0.25
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LLGL2-204ENST00000545227 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.62■□□□□ 0.25
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LLGL2-204ENST00000545227 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
LLGL2-204ENST00000545227 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.54■□□□□ 0.24
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LLGL2-204ENST00000545227 TOPBP1Q92547 1522 aa16.52■□□□□ 0.23
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LLGL2-204ENST00000545227 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
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LLGL2-204ENST00000545227 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.94■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 KDM6BO15054 1643 aa15.93■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.92■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 ADAMTS12P58397 1594 aa15.91■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.91■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
LLGL2-204ENST00000545227 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LLGL2-204ENST00000545227 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.138e-7■□□□□ 9.8
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