RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540468.5

CCT7-216, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCT7, Length 1,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-216ENST00000540468 GOLGA3Q08378 1498 aa25.81■■□□□ 1.72
CCT7-216ENST00000540468 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.78■■□□□ 1.72
CCT7-216ENST00000540468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.76■■□□□ 1.71
CCT7-216ENST00000540468 IQGAP2Q13576 1575 aa25.7■■□□□ 1.7
CCT7-216ENST00000540468 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CCT7-216ENST00000540468 SHROOM2Q13796 1616 aa25.67■■□□□ 1.7
CCT7-216ENST00000540468 JPH4Q96JJ6 628 aa25.62■■□□□ 1.69
CCT7-216ENST00000540468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.59■■□□□ 1.69
CCT7-216ENST00000540468 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.57■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.57■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.53■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 ARHGEF11O15085 1522 aa25.52■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 DISP1Q96F81 1524 aa25.52■■□□□ 1.68
CCT7-216ENST00000540468 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.5■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 KIAA0556O60303 1618 aa25.47■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.47■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 SAMD9Q5K651 1589 aa25.47■■□□□ 1.67
CCT7-216ENST00000540468 CEP162Q5TB80 1403 aa25.44■■□□□ 1.66
CCT7-216ENST00000540468 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.42■■□□□ 1.66
CCT7-216ENST00000540468 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CCT7-216ENST00000540468 P3H3Q8IVL6 736 aa25.42■■□□□ 1.66
CCT7-216ENST00000540468 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.4■■□□□ 1.66
CCT7-216ENST00000540468 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.39■■□□□ 1.65
CCT7-216ENST00000540468 CLIP1P30622 1438 aa25.38■■□□□ 1.65
CCT7-216ENST00000540468 ARAP1Q96P48 1450 aa25.37■■□□□ 1.65
CCT7-216ENST00000540468 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.35■■□□□ 1.65
CCT7-216ENST00000540468 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CCT7-216ENST00000540468 PTPRGP23470 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
CCT7-216ENST00000540468 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.25■■□□□ 1.63
CCT7-216ENST00000540468 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.19■■□□□ 1.62
CCT7-216ENST00000540468 ABCA8O94911 1581 aa25.16■■□□□ 1.62
CCT7-216ENST00000540468 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.14■■□□□ 1.62
CCT7-216ENST00000540468 UACAQ9BZF9 1416 aa25.13■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 FMN1Q68DA7 1419 aa25.12■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.11■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 ABCC2Q92887 1545 aa25.1■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 HRCP23327 699 aa25.08■■□□□ 1.61
CCT7-216ENST00000540468 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.08■■□□□ 1.6
CCT7-216ENST00000540468 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CCT7-216ENST00000540468 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.04■■□□□ 1.6
CCT7-216ENST00000540468 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.03■■□□□ 1.6
CCT7-216ENST00000540468 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.02■■□□□ 1.6
CCT7-216ENST00000540468 ARID3CA6NKF2 412 aa25.01■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 HECW1Q76N89 1606 aa24.99■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.98■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.98■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCT7-216ENST00000540468 ATP10BO94823 1461 aa24.95■■□□□ 1.58
CCT7-216ENST00000540468 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCT7-216ENST00000540468 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CCT7-216ENST00000540468 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
CCT7-216ENST00000540468 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.84■■□□□ 1.57
CCT7-216ENST00000540468 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCT7-216ENST00000540468 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCT7-216ENST00000540468 MAPKBP1O60336 1514 aa24.83■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 ASXL2Q76L83 1435 aa24.82■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.81■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 APLP2Q06481 763 aa24.81■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.79■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 TIAM1Q13009 1591 aa24.78■■□□□ 1.56
CCT7-216ENST00000540468 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.75■■□□□ 1.55
CCT7-216ENST00000540468 MAP3K1Q13233 1512 aa24.72■■□□□ 1.55
CCT7-216ENST00000540468 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.72■■□□□ 1.55
CCT7-216ENST00000540468 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 KCNH8Q96L42 1107 aa24.69■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 DIP2BQ9P265 1576 aa24.67■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.67■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 KIF14Q15058 1648 aa24.67■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.65■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.65■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.65■■□□□ 1.54
CCT7-216ENST00000540468 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.64■■□□□ 1.53
CCT7-216ENST00000540468 GLI2P10070 1586 aa24.59■■□□□ 1.53
CCT7-216ENST00000540468 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.59■■□□□ 1.53
CCT7-216ENST00000540468 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.59■■□□□ 1.53
CCT7-216ENST00000540468 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.532e-8■■■■□ 23.3
CCT7-216ENST00000540468 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.57■■□□□ 1.52
CCT7-216ENST00000540468 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCT7-216ENST00000540468 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CCT7-216ENST00000540468 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.53■■□□□ 1.52
CCT7-216ENST00000540468 NCOA2Q15596 1464 aa24.52■■□□□ 1.52
CCT7-216ENST00000540468 TSPOAP1O95153 1857 aa24.51■■□□□ 1.51
CCT7-216ENST00000540468 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.48■■□□□ 1.51
CCT7-216ENST00000540468 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCT7-216ENST00000540468 CD109Q6YHK3 1445 aa24.46■■□□□ 1.51
CCT7-216ENST00000540468 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.46■■□□□ 1.51
CCT7-216ENST00000540468 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.44■■□□□ 1.5
CCT7-216ENST00000540468 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCT7-216ENST00000540468 PREX2Q70Z35 1606 aa24.42■■□□□ 1.5
CCT7-216ENST00000540468 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.41■■□□□ 1.5
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