RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538838.5

TMEM260-202, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM260, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-202ENST00000538838 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
TMEM260-202ENST00000538838 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.3■■■■□ 3.72
TMEM260-202ENST00000538838 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.26■■■■□ 3.72
TMEM260-202ENST00000538838 IQGAP2Q13576 1575 aa38.26■■■■□ 3.72
TMEM260-202ENST00000538838 OSCARQ8IYS5 282 aa38.26■■■■□ 3.71
TMEM260-202ENST00000538838 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.16■■■■□ 3.7
TMEM260-202ENST00000538838 SHROOM2Q13796 1616 aa38.11■■■■□ 3.69
TMEM260-202ENST00000538838 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.03■■■■□ 3.68
TMEM260-202ENST00000538838 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
TMEM260-202ENST00000538838 JPH4Q96JJ6 628 aa37.98■■■■□ 3.67
TMEM260-202ENST00000538838 SAMD9Q5K651 1589 aa37.94■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 CEP162Q5TB80 1403 aa37.92■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.91■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 KIAA0556O60303 1618 aa37.9■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 DISP1Q96F81 1524 aa37.9■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.88■■■■□ 3.66
TMEM260-202ENST00000538838 CLIP1P30622 1438 aa37.86■■■■□ 3.65
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.83■■■■□ 3.65
TMEM260-202ENST00000538838 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.8■■■■□ 3.64
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGEF11O15085 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
TMEM260-202ENST00000538838 P3H3Q8IVL6 736 aa37.75■■■■□ 3.63
TMEM260-202ENST00000538838 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
TMEM260-202ENST00000538838 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
TMEM260-202ENST00000538838 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.73■■■■□ 3.63
TMEM260-202ENST00000538838 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.73■■■■□ 3.63
TMEM260-202ENST00000538838 ARAP1Q96P48 1450 aa37.68■■■■□ 3.62
TMEM260-202ENST00000538838 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
TMEM260-202ENST00000538838 PTPRGP23470 1445 aa37.52■■■■□ 3.6
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TMEM260-202ENST00000538838 FMN1Q68DA7 1419 aa37.46■■■■□ 3.59
TMEM260-202ENST00000538838 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
TMEM260-202ENST00000538838 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.41■■■■□ 3.58
TMEM260-202ENST00000538838 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.41■■■■□ 3.58
TMEM260-202ENST00000538838 ABCA8O94911 1581 aa37.4■■■■□ 3.58
TMEM260-202ENST00000538838 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.39■■■■□ 3.58
TMEM260-202ENST00000538838 UACAQ9BZF9 1416 aa37.33■■■■□ 3.57
TMEM260-202ENST00000538838 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.31■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 ABCC2Q92887 1545 aa37.3■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 HECW1Q76N89 1606 aa37.29■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.28■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.28■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.28■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.27■■■■□ 3.56
TMEM260-202ENST00000538838 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.24■■■■□ 3.55
TMEM260-202ENST00000538838 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
TMEM260-202ENST00000538838 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
TMEM260-202ENST00000538838 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TMEM260-202ENST00000538838 ARID3CA6NKF2 412 aa37.12■■■■□ 3.53
TMEM260-202ENST00000538838 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TMEM260-202ENST00000538838 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TMEM260-202ENST00000538838 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.08■■■■□ 3.53
TMEM260-202ENST00000538838 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.07■■■■□ 3.52
TMEM260-202ENST00000538838 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.06■■■■□ 3.52
TMEM260-202ENST00000538838 ATP10BO94823 1461 aa37.05■■■■□ 3.52
TMEM260-202ENST00000538838 TIAM1Q13009 1591 aa37■■■■□ 3.51
TMEM260-202ENST00000538838 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
TMEM260-202ENST00000538838 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
TMEM260-202ENST00000538838 MAP3K1Q13233 1512 aa36.93■■■■□ 3.5
TMEM260-202ENST00000538838 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.5
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TMEM260-202ENST00000538838 APLP2Q06481 763 aa36.87■■■■□ 3.49
TMEM260-202ENST00000538838 MAPKBP1O60336 1514 aa36.84■■■■□ 3.49
TMEM260-202ENST00000538838 ASXL2Q76L83 1435 aa36.81■■■■□ 3.48
TMEM260-202ENST00000538838 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.78■■■■□ 3.48
TMEM260-202ENST00000538838 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.77■■■■□ 3.48
TMEM260-202ENST00000538838 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.77■■■■□ 3.48
TMEM260-202ENST00000538838 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
TMEM260-202ENST00000538838 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.74■■■■□ 3.47
TMEM260-202ENST00000538838 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
TMEM260-202ENST00000538838 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
TMEM260-202ENST00000538838 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.73■■■■□ 3.47
TMEM260-202ENST00000538838 KIF14Q15058 1648 aa36.7■■■■□ 3.47
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TMEM260-202ENST00000538838 DIP2BQ9P265 1576 aa36.59■■■■□ 3.45
TMEM260-202ENST00000538838 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.57■■■■□ 3.44
TMEM260-202ENST00000538838 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.55■■■■□ 3.44
TMEM260-202ENST00000538838 NCOA2Q15596 1464 aa36.54■■■■□ 3.44
TMEM260-202ENST00000538838 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.53■■■■□ 3.44
TMEM260-202ENST00000538838 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.53■■■■□ 3.44
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TMEM260-202ENST00000538838 GLI2P10070 1586 aa36.48■■■■□ 3.43
TMEM260-202ENST00000538838 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.45■■■■□ 3.43
TMEM260-202ENST00000538838 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.44■■■■□ 3.42
TMEM260-202ENST00000538838 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.43■■■■□ 3.42
TMEM260-202ENST00000538838 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.4■■■■□ 3.42
TMEM260-202ENST00000538838 PREX2Q70Z35 1606 aa36.39■■■■□ 3.42
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TMEM260-202ENST00000538838 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.37■■■■□ 3.41
TMEM260-202ENST00000538838 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.36■■■■□ 3.41
TMEM260-202ENST00000538838 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.36■■■■□ 3.41
TMEM260-202ENST00000538838 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
TMEM260-202ENST00000538838 TSPOAP1O95153 1857 aa36.32■■■■□ 3.4
TMEM260-202ENST00000538838 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.31■■■■□ 3.4
TMEM260-202ENST00000538838 CD109Q6YHK3 1445 aa36.3■■■■□ 3.4
TMEM260-202ENST00000538838 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TMEM260-202ENST00000538838 PLCH2O75038 1416 aa36.26■■■■□ 3.4
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.26■■■■□ 3.39
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