RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535353.3

CSAG2-201, Transcript of CSAG family member 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CSAG2, Length 237 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2-201ENST00000535353 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.48■□□□□ 0.39
CSAG2-201ENST00000535353 GRIN2AQ12879 1464 aa17.47■□□□□ 0.39
CSAG2-201ENST00000535353 NUP160Q12769 1436 aa17.47■□□□□ 0.39
CSAG2-201ENST00000535353 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CSAG2-201ENST00000535353 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.43■□□□□ 0.38
CSAG2-201ENST00000535353 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.42■□□□□ 0.38
CSAG2-201ENST00000535353 TOP2BQ02880 1626 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG2-201ENST00000535353 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG2-201ENST00000535353 ADAMTS12P58397 1594 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG2-201ENST00000535353 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
CSAG2-201ENST00000535353 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CSAG2-201ENST00000535353 CUX1P39880 1505 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG2-201ENST00000535353 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
CSAG2-201ENST00000535353 GLI2P10070 1586 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG2-201ENST00000535353 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG2-201ENST00000535353 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG2-201ENST00000535353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.18■□□□□ 0.34
CSAG2-201ENST00000535353 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CSAG2-201ENST00000535353 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG2-201ENST00000535353 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG2-201ENST00000535353 KIF21BO75037 1637 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG2-201ENST00000535353 CERKQ8TCT0 537 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG2-201ENST00000535353 JPH4Q96JJ6 628 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG2-201ENST00000535353 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG2-201ENST00000535353 PTPRMP28827 1452 aa17.08■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.07■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.06■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 ASXL2Q76L83 1435 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC2Q92887 1545 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 CUL7Q14999 1698 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG2-201ENST00000535353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG2-201ENST00000535353 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17■□□□□ 0.31
CSAG2-201ENST00000535353 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG2-201ENST00000535353 MADDQ8WXG6 1647 aa16.91■□□□□ 0.3
CSAG2-201ENST00000535353 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.89■□□□□ 0.29
CSAG2-201ENST00000535353 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.86■□□□□ 0.29
CSAG2-201ENST00000535353 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
CSAG2-201ENST00000535353 PTPRGP23470 1445 aa16.84■□□□□ 0.29
CSAG2-201ENST00000535353 HSPA2P54652 639 aa16.83■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.81■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.8■□□□□ 0.28
CSAG2-201ENST00000535353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.76■□□□□ 0.27
CSAG2-201ENST00000535353 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.73■□□□□ 0.27
CSAG2-201ENST00000535353 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.72■□□□□ 0.27
CSAG2-201ENST00000535353 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.72■□□□□ 0.27
CSAG2-201ENST00000535353 UACAQ9BZF9 1416 aa16.71■□□□□ 0.27
CSAG2-201ENST00000535353 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.7■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 STRCQ7RTU9 1775 aa16.69■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 CD109Q6YHK3 1445 aa16.68■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.65■□□□□ 0.26
CSAG2-201ENST00000535353 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.64■□□□□ 0.25
CSAG2-201ENST00000535353 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.63■□□□□ 0.25
CSAG2-201ENST00000535353 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.61■□□□□ 0.25
CSAG2-201ENST00000535353 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.58■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.57■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.57■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.55■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.54■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 IQGAP2Q13576 1575 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 DISP1Q96F81 1524 aa16.53■□□□□ 0.24
CSAG2-201ENST00000535353 PTPRTO14522 1441 aa16.51■□□□□ 0.23
CSAG2-201ENST00000535353 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.48■□□□□ 0.23
CSAG2-201ENST00000535353 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.48■□□□□ 0.23
CSAG2-201ENST00000535353 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.47■□□□□ 0.23
CSAG2-201ENST00000535353 FANCAO15360 1455 aa16.44■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.44■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 RAPGEF3O95398 923 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 KIAA0556O60303 1618 aa16.43■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.42■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 NEO1Q92859 1461 aa16.41■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 RICTORQ6R327 1708 aa16.4■□□□□ 0.22
CSAG2-201ENST00000535353 KCNH8Q96L42 1107 aa16.39■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 IGF1RP08069 1367 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 ABCA8O94911 1581 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG2-201ENST00000535353 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 AKNAQ7Z591 1439 aa16.32■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 HSPA1LP34931 641 aa16.29■□□□□ 0.2
CSAG2-201ENST00000535353 NCOA1Q15788 1441 aa16.27■□□□□ 0.19
CSAG2-201ENST00000535353 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.25■□□□□ 0.19
CSAG2-201ENST00000535353 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CSAG2-201ENST00000535353 KIF27Q86VH2 1401 aa16.23■□□□□ 0.19
CSAG2-201ENST00000535353 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.21■□□□□ 0.19
CSAG2-201ENST00000535353 MLECQ14165 292 aa16.2■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 C3P01024 1663 aa16.19■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.19■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms