RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535353.3

CSAG2-201, Transcript of CSAG family member 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CSAG2, Length 237 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2-201ENST00000535353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC9O60706 1549 aa23.12■■□□□ 1.29
CSAG2-201ENST00000535353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.74■■□□□ 1.23
CSAG2-201ENST00000535353 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.06■■□□□ 1.12
CSAG2-201ENST00000535353 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.84■■□□□ 1.09
CSAG2-201ENST00000535353 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.53■■□□□ 1.04
CSAG2-201ENST00000535353 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
CSAG2-201ENST00000535353 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.15■□□□□ 0.98
CSAG2-201ENST00000535353 NACADO15069 1562 aa21.06■□□□□ 0.96
CSAG2-201ENST00000535353 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.98■□□□□ 0.95
CSAG2-201ENST00000535353 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.98■□□□□ 0.95
CSAG2-201ENST00000535353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.9■□□□□ 0.94
CSAG2-201ENST00000535353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.61■□□□□ 0.89
CSAG2-201ENST00000535353 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CSAG2-201ENST00000535353 CUX2O14529 1486 aa20.53■□□□□ 0.88
CSAG2-201ENST00000535353 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.38■□□□□ 0.85
CSAG2-201ENST00000535353 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.34■□□□□ 0.85
CSAG2-201ENST00000535353 TRIM41Q8WV44 630 aa20.28■□□□□ 0.84
CSAG2-201ENST00000535353 ERCC6Q03468 1493 aa20.05■□□□□ 0.8
CSAG2-201ENST00000535353 SCRIBQ14160 1630 aa19.91■□□□□ 0.78
CSAG2-201ENST00000535353 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
CSAG2-201ENST00000535353 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.64■□□□□ 0.73
CSAG2-201ENST00000535353 NESP48681 1621 aa19.51■□□□□ 0.71
CSAG2-201ENST00000535353 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CSAG2-201ENST00000535353 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CSAG2-201ENST00000535353 NCAPD3P42695 1498 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG2-201ENST00000535353 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CSAG2-201ENST00000535353 SMARCA2P51531 1590 aa19.38■□□□□ 0.69
CSAG2-201ENST00000535353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.33■□□□□ 0.69
CSAG2-201ENST00000535353 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG2-201ENST00000535353 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG2-201ENST00000535353 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG2-201ENST00000535353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG2-201ENST00000535353 HMGXB3Q12766 1538 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG2-201ENST00000535353 OSCARQ8IYS5 282 aa19.19■□□□□ 0.66
CSAG2-201ENST00000535353 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.16■□□□□ 0.66
CSAG2-201ENST00000535353 WDR62O43379 1518 aa19.1■□□□□ 0.65
CSAG2-201ENST00000535353 ARHGEF11O15085 1522 aa19.07■□□□□ 0.64
CSAG2-201ENST00000535353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.07■□□□□ 0.64
CSAG2-201ENST00000535353 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.05■□□□□ 0.64
CSAG2-201ENST00000535353 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CSAG2-201ENST00000535353 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CSAG2-201ENST00000535353 SMARCA4P51532 1647 aa18.89■□□□□ 0.62
CSAG2-201ENST00000535353 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CSAG2-201ENST00000535353 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.81■□□□□ 0.6
CSAG2-201ENST00000535353 ARAP1Q96P48 1450 aa18.78■□□□□ 0.6
CSAG2-201ENST00000535353 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.76■□□□□ 0.59
CSAG2-201ENST00000535353 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.71■□□□□ 0.59
CSAG2-201ENST00000535353 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.7■□□□□ 0.58
CSAG2-201ENST00000535353 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.54■□□□□ 0.56
CSAG2-201ENST00000535353 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CSAG2-201ENST00000535353 CHD1O14646 1710 aa18.52■□□□□ 0.55
CSAG2-201ENST00000535353 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CSAG2-201ENST00000535353 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CSAG2-201ENST00000535353 IFT140Q96RY7 1462 aa18.37■□□□□ 0.53
CSAG2-201ENST00000535353 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.31■□□□□ 0.52
CSAG2-201ENST00000535353 CFTRP13569 1480 aa18.28■□□□□ 0.52
CSAG2-201ENST00000535353 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.25■□□□□ 0.51
CSAG2-201ENST00000535353 PRDM2Q13029 1718 aa18.18■□□□□ 0.5
CSAG2-201ENST00000535353 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG2-201ENST00000535353 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG2-201ENST00000535353 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG2-201ENST00000535353 FBLN2P98095 1184 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 SYNJ1O43426 1573 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 TOPBP1Q92547 1522 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 WIZO95785 1651 aa18.06■□□□□ 0.48
CSAG2-201ENST00000535353 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.01■□□□□ 0.47
CSAG2-201ENST00000535353 FBXO41Q8TF61 875 aa17.95■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.94■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.93■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC8Q09428 1581 aa17.92■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 KDM6BO15054 1643 aa17.9■□□□□ 0.46
CSAG2-201ENST00000535353 WDR97A6NE52 1622 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG2-201ENST00000535353 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
CSAG2-201ENST00000535353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CSAG2-201ENST00000535353 ADGRL1O94910 1474 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG2-201ENST00000535353 SYNJ2O15056 1496 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG2-201ENST00000535353 SOCS7O14512 581 aa17.78■□□□□ 0.44
CSAG2-201ENST00000535353 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CSAG2-201ENST00000535353 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG2-201ENST00000535353 DIP2BQ9P265 1576 aa17.74■□□□□ 0.43
CSAG2-201ENST00000535353 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CSAG2-201ENST00000535353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG2-201ENST00000535353 GRIN2BQ13224 1484 aa17.67■□□□□ 0.42
CSAG2-201ENST00000535353 CEP170Q5SW79 1584 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG2-201ENST00000535353 MAPKBP1O60336 1514 aa17.65■□□□□ 0.42
CSAG2-201ENST00000535353 PBRM1Q86U86 1689 aa17.64■□□□□ 0.42
CSAG2-201ENST00000535353 ILDR2Q71H61 639 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG2-201ENST00000535353 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG2-201ENST00000535353 TSPOAP1O95153 1857 aa17.63■□□□□ 0.41
CSAG2-201ENST00000535353 SHROOM2Q13796 1616 aa17.62■□□□□ 0.41
CSAG2-201ENST00000535353 SOGA1O94964 1423 aa17.6■□□□□ 0.41
CSAG2-201ENST00000535353 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG2-201ENST00000535353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms