RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533708.1

RAB30-AS1-207, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB30-AS1, Length 825 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 IQGAP2Q13576 1575 aa25.84■■□□□ 1.73
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEP162Q5TB80 1403 aa25.57■■□□□ 1.68
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.57■■□□□ 1.68
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.57■■□□□ 1.68
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.5■■□□□ 1.67
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCA8O94911 1581 aa25.31■■□□□ 1.64
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCC2Q92887 1545 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.21■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.2■■□□□ 1.63
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
RAB30-AS1-207ENST00000533708 HECW1Q76N89 1606 aa25.14■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ARID3CA6NKF2 412 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ATP10BO94823 1461 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.09■■□□□ 1.61
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 ASXL2Q76L83 1435 aa24.95■■□□□ 1.59
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.93■■□□□ 1.58
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 MAP3K1Q13233 1512 aa24.91■■□□□ 1.58
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.9■■□□□ 1.58
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 KCNH8Q96L42 1107 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.8■■□□□ 1.56
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.79■■□□□ 1.56
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PLCH2O75038 1416 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PREX2Q70Z35 1606 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.52■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.52■■□□□ 1.52
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 TSPOAP1O95153 1857 aa24.51■■□□□ 1.51
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