RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 IGF1RP08069 1367 aa38.49■■■■□ 3.75
CDKN2A-210ENST00000530628 CUL7Q14999 1698 aa38.48■■■■□ 3.75
CDKN2A-210ENST00000530628 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.4■■■■□ 3.74
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.39■■■■□ 3.74
CDKN2A-210ENST00000530628 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.33■■■■□ 3.73
CDKN2A-210ENST00000530628 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
CDKN2A-210ENST00000530628 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.26■■■■□ 3.72
CDKN2A-210ENST00000530628 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.23■■■■□ 3.71
CDKN2A-210ENST00000530628 MAPKBP1O60336 1514 aa38.18■■■■□ 3.7
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.16■■■■□ 3.7
CDKN2A-210ENST00000530628 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.16■■■■□ 3.7
CDKN2A-210ENST00000530628 DIP2BQ9P265 1576 aa38.07■■■■□ 3.69
CDKN2A-210ENST00000530628 PTPRGP23470 1445 aa38.06■■■■□ 3.68
CDKN2A-210ENST00000530628 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.05■■■■□ 3.68
CDKN2A-210ENST00000530628 IQGAP2Q13576 1575 aa38.04■■■■□ 3.68
CDKN2A-210ENST00000530628 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
CDKN2A-210ENST00000530628 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.99■■■■□ 3.67
CDKN2A-210ENST00000530628 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.91■■■■□ 3.66
CDKN2A-210ENST00000530628 TSPOAP1O95153 1857 aa37.9■■■■□ 3.66
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC2Q92887 1545 aa37.86■■■■□ 3.65
CDKN2A-210ENST00000530628 DISP1Q96F81 1524 aa37.82■■■■□ 3.65
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM6BO15054 1643 aa37.79■■■■□ 3.64
CDKN2A-210ENST00000530628 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.78■■■■□ 3.64
CDKN2A-210ENST00000530628 UACAQ9BZF9 1416 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN2A-210ENST00000530628 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.77■■■■□ 3.64
CDKN2A-210ENST00000530628 ASXL2Q76L83 1435 aa37.73■■■■□ 3.63
CDKN2A-210ENST00000530628 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.72■■■■□ 3.63
CDKN2A-210ENST00000530628 KIAA0556O60303 1618 aa37.69■■■■□ 3.62
CDKN2A-210ENST00000530628 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.67■■■■□ 3.62
CDKN2A-210ENST00000530628 GLI2P10070 1586 aa37.64■■■■□ 3.62
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.61■■■■□ 3.61
CDKN2A-210ENST00000530628 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
CDKN2A-210ENST00000530628 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
CDKN2A-210ENST00000530628 GOLGA3Q08378 1498 aa37.5■■■■□ 3.59
CDKN2A-210ENST00000530628 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CDKN2A-210ENST00000530628 PRXQ9BXM0 1461 aa37.47■■■■□ 3.59
CDKN2A-210ENST00000530628 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.45■■■■□ 3.59
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.38■■■■□ 3.57
CDKN2A-210ENST00000530628 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.36■■■■□ 3.57
CDKN2A-210ENST00000530628 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.35■■■■□ 3.57
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCA8O94911 1581 aa37.34■■■■□ 3.57
CDKN2A-210ENST00000530628 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CDKN2A-210ENST00000530628 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CDKN2A-210ENST00000530628 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.22■■■■□ 3.55
CDKN2A-210ENST00000530628 KCNH8Q96L42 1107 aa37.21■■■■□ 3.55
CDKN2A-210ENST00000530628 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.2■■■■□ 3.55
CDKN2A-210ENST00000530628 P3H3Q8IVL6 736 aa37.17■■■■□ 3.54
CDKN2A-210ENST00000530628 CD109Q6YHK3 1445 aa37.15■■■■□ 3.54
CDKN2A-210ENST00000530628 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.11■■■■□ 3.53
CDKN2A-210ENST00000530628 ADGRL1O94910 1474 aa37.09■■■■□ 3.53
CDKN2A-210ENST00000530628 SAMD9Q5K651 1589 aa37.06■■■■□ 3.52
CDKN2A-210ENST00000530628 ARID3CA6NKF2 412 aa37.05■■■■□ 3.52
CDKN2A-210ENST00000530628 EEA1Q15075 1411 aa37.04■■■■□ 3.52
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP10BO94823 1461 aa37.02■■■■□ 3.52
CDKN2A-210ENST00000530628 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.96■■■■□ 3.51
CDKN2A-210ENST00000530628 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
CDKN2A-210ENST00000530628 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
CDKN2A-210ENST00000530628 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.87■■■■□ 3.49
CDKN2A-210ENST00000530628 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.83■■■■□ 3.49
CDKN2A-210ENST00000530628 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.8■■■■□ 3.48
CDKN2A-210ENST00000530628 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CDKN2A-210ENST00000530628 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.77■■■■□ 3.48
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF21BO75037 1637 aa36.76■■■■□ 3.48
CDKN2A-210ENST00000530628 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.69■■■■□ 3.46
CDKN2A-210ENST00000530628 NEO1Q92859 1461 aa36.68■■■■□ 3.46
CDKN2A-210ENST00000530628 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.66■■■■□ 3.46
CDKN2A-210ENST00000530628 RAPGEF3O95398 923 aa36.61■■■■□ 3.45
CDKN2A-210ENST00000530628 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.6■■■■□ 3.45
CDKN2A-210ENST00000530628 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CDKN2A-210ENST00000530628 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.52■■■■□ 3.44
CDKN2A-210ENST00000530628 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.49■■■■□ 3.43
CDKN2A-210ENST00000530628 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
CDKN2A-210ENST00000530628 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.45■■■■□ 3.43
CDKN2A-210ENST00000530628 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.45■■■■□ 3.43
CDKN2A-210ENST00000530628 AKNAQ7Z591 1439 aa36.43■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.43■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 FANCAO15360 1455 aa36.43■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.41■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 RICTORQ6R327 1708 aa36.4■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CDKN2A-210ENST00000530628 FMN1Q68DA7 1419 aa36.38■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.37■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 HECW1Q76N89 1606 aa36.34■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 PTPRMP28827 1452 aa36.34■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.33■■■■□ 3.41
CDKN2A-210ENST00000530628 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.32■■■■□ 3.4
CDKN2A-210ENST00000530628 MADDQ8WXG6 1647 aa36.26■■■■□ 3.4
CDKN2A-210ENST00000530628 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
CDKN2A-210ENST00000530628 PLCH2O75038 1416 aa36.25■■■■□ 3.39
CDKN2A-210ENST00000530628 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.24■■■■□ 3.39
CDKN2A-210ENST00000530628 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.21■■■■□ 3.39
CDKN2A-210ENST00000530628 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.2■■■■□ 3.39
CDKN2A-210ENST00000530628 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.18■■■■□ 3.38
CDKN2A-210ENST00000530628 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.17■■■■□ 3.38
CDKN2A-210ENST00000530628 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
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