RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530267.5

USP35-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 35, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP35, Length 2,419 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35-204ENST00000530267 TIAM1Q13009 1591 aa22.61■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.59■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.58■■□□□ 1.21
USP35-204ENST00000530267 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP35-204ENST00000530267 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.54■■□□□ 1.2
USP35-204ENST00000530267 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 32.3
USP35-204ENST00000530267 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.51■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.51■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 MAP3K1Q13233 1512 aa22.5■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.49■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP35-204ENST00000530267 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.44■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.44■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 FMN1Q68DA7 1419 aa22.42■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 PBRM1Q86U86 1689 aa22.41■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP35-204ENST00000530267 SAMD9Q5K651 1589 aa22.36■■□□□ 1.17
USP35-204ENST00000530267 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.36■■□□□ 1.17
USP35-204ENST00000530267 ERCC6Q03468 1493 aa22.35■■□□□ 1.17
USP35-204ENST00000530267 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.33■■□□□ 1.17
USP35-204ENST00000530267 GRIN2BQ13224 1484 aa22.33■■□□□ 1.17
USP35-204ENST00000530267 ADAMTS12P58397 1594 aa22.32■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.31■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 IFT140Q96RY7 1462 aa22.31■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 WDR62O43379 1518 aa22.3■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.29■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 ARID3CA6NKF2 412 aa22.28■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.27■■□□□ 1.16
USP35-204ENST00000530267 IQGAP2Q13576 1575 aa22.25■■□□□ 1.15
USP35-204ENST00000530267 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.24■■□□□ 1.15
USP35-204ENST00000530267 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.19■■□□□ 1.14
USP35-204ENST00000530267 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP35-204ENST00000530267 FBLN2P98095 1184 aa22.18■■□□□ 1.14
USP35-204ENST00000530267 NCOA2Q15596 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
USP35-204ENST00000530267 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 MAPKBP1O60336 1514 aa22.12■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.12■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 GRIN2AQ12879 1464 aa22.1■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 NEUROD1Q13562 356 aa22.09■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.09■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.08■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.08■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.08■■□□□ 1.13
USP35-204ENST00000530267 MIER1Q8N108 512 aa22.08■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 HECW1Q76N89 1606 aa22.07■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.07■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 PTPRKQ15262 1439 aa22.07■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 DISP1Q96F81 1524 aa22.04■■□□□ 1.12
USP35-204ENST00000530267 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.01■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 KIAA0556O60303 1618 aa22.01■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.99■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 SYNJ2O15056 1496 aa21.98■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 CEP170Q5SW79 1584 aa21.97■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.96■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 ARHGEF11O15085 1522 aa21.96■■□□□ 1.11
USP35-204ENST00000530267 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 HFM1A2PYH4 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 NAIPQ13075 1403 aa21.91■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 JPH4Q96JJ6 628 aa21.91■■□□□ 1.1
USP35-204ENST00000530267 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.88■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.87■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 UACAQ9BZF9 1416 aa21.84■■□□□ 1.09
USP35-204ENST00000530267 NUP160Q12769 1436 aa21.83■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 TRIM52Q96A61 297 aa21.81■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.81■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 MIA2Q96PC5 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
USP35-204ENST00000530267 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 TONSLQ96HA7 1378 aa21.76■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 KDM6BO15054 1643 aa21.75■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.75■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.73■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 DAPK1P53355 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
USP35-204ENST00000530267 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.7■■□□□ 1.06
USP35-204ENST00000530267 FOXD1Q16676 465 aa21.69■■□□□ 1.06
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