RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528694.1

CRACR2B-208, Transcript of calcium release activated channel regulator 2B, humanhuman

TSL 2

Gene CRACR2B, Length 2,440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2B-208ENST00000528694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CRACR2B-208ENST00000528694 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CRACR2B-208ENST00000528694 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.27■■■□□ 2.76
CRACR2B-208ENST00000528694 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.27■■■□□ 2.76
CRACR2B-208ENST00000528694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CRACR2B-208ENST00000528694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CRACR2B-208ENST00000528694 ITGAEP38570 1179 aa32.22■■■□□ 2.75
CRACR2B-208ENST00000528694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.22■■■□□ 2.75
CRACR2B-208ENST00000528694 WDR62O43379 1518 aa32.16■■■□□ 2.74
CRACR2B-208ENST00000528694 TIAM1Q13009 1591 aa32.15■■■□□ 2.74
CRACR2B-208ENST00000528694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.13■■■□□ 2.73
CRACR2B-208ENST00000528694 P3H3Q8IVL6 736 aa32.1■■■□□ 2.73
CRACR2B-208ENST00000528694 WDR97A6NE52 1622 aa32.09■■■□□ 2.73
CRACR2B-208ENST00000528694 MAP3K1Q13233 1512 aa32.07■■■□□ 2.72
CRACR2B-208ENST00000528694 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.04■■■□□ 2.72
CRACR2B-208ENST00000528694 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32■■■□□ 2.71
CRACR2B-208ENST00000528694 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.99■■■□□ 2.71
CRACR2B-208ENST00000528694 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CRACR2B-208ENST00000528694 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CRACR2B-208ENST00000528694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.97■■■□□ 2.71
CRACR2B-208ENST00000528694 CUL7Q14999 1698 aa31.94■■■□□ 2.7
CRACR2B-208ENST00000528694 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.94■■■□□ 2.7
CRACR2B-208ENST00000528694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.93■■■□□ 2.7
CRACR2B-208ENST00000528694 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.89■■■□□ 2.7
CRACR2B-208ENST00000528694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CRACR2B-208ENST00000528694 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CRACR2B-208ENST00000528694 MYT1Q01538 1121 aa31.86■■■□□ 2.69
CRACR2B-208ENST00000528694 MAPKBP1O60336 1514 aa31.86■■■□□ 2.69
CRACR2B-208ENST00000528694 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.84■■■□□ 2.69
CRACR2B-208ENST00000528694 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.8■■■□□ 2.68
CRACR2B-208ENST00000528694 IFT140Q96RY7 1462 aa31.78■■■□□ 2.68
CRACR2B-208ENST00000528694 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.77■■■□□ 2.68
CRACR2B-208ENST00000528694 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.77■■■□□ 2.68
CRACR2B-208ENST00000528694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
CRACR2B-208ENST00000528694 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.75■■■□□ 2.67
CRACR2B-208ENST00000528694 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.74■■■□□ 2.67
CRACR2B-208ENST00000528694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.662e-7■■■■□ 23.9
CRACR2B-208ENST00000528694 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.67■■■□□ 2.66
CRACR2B-208ENST00000528694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CRACR2B-208ENST00000528694 PBRM1Q86U86 1689 aa31.62■■■□□ 2.65
CRACR2B-208ENST00000528694 FMN1Q68DA7 1419 aa31.61■■■□□ 2.65
CRACR2B-208ENST00000528694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.6■■■□□ 2.65
CRACR2B-208ENST00000528694 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.64
CRACR2B-208ENST00000528694 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.52■■■□□ 2.64
CRACR2B-208ENST00000528694 SAMD9Q5K651 1589 aa31.51■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.5■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 GRIN2BQ13224 1484 aa31.5■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.48■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 ADAMTS12P58397 1594 aa31.48■■■□□ 2.63
CRACR2B-208ENST00000528694 PTPRKQ15262 1439 aa31.42■■■□□ 2.62
CRACR2B-208ENST00000528694 KCNH8Q96L42 1107 aa31.4■■■□□ 2.62
CRACR2B-208ENST00000528694 NCOA2Q15596 1464 aa31.37■■■□□ 2.61
CRACR2B-208ENST00000528694 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CRACR2B-208ENST00000528694 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.34■■■□□ 2.61
CRACR2B-208ENST00000528694 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.33■■■□□ 2.61
CRACR2B-208ENST00000528694 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CRACR2B-208ENST00000528694 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CRACR2B-208ENST00000528694 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.32■■■□□ 2.6
CRACR2B-208ENST00000528694 HFM1A2PYH4 1435 aa31.3■■■□□ 2.6
CRACR2B-208ENST00000528694 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.27■■■□□ 2.6
CRACR2B-208ENST00000528694 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
CRACR2B-208ENST00000528694 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.26■■■□□ 2.59
CRACR2B-208ENST00000528694 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.25■■■□□ 2.59
CRACR2B-208ENST00000528694 NAIPQ13075 1403 aa31.23■■■□□ 2.59
CRACR2B-208ENST00000528694 UACAQ9BZF9 1416 aa31.23■■■□□ 2.59
CRACR2B-208ENST00000528694 IQGAP2Q13576 1575 aa31.22■■■□□ 2.59
CRACR2B-208ENST00000528694 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.2■■■□□ 2.58
CRACR2B-208ENST00000528694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
CRACR2B-208ENST00000528694 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CRACR2B-208ENST00000528694 TONSLQ96HA7 1378 aa31.18■■■□□ 2.58
CRACR2B-208ENST00000528694 ARHGEF11O15085 1522 aa31.16■■■□□ 2.58
CRACR2B-208ENST00000528694 GRIN2AQ12879 1464 aa31.13■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.12■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.12■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 ARID3CA6NKF2 412 aa31.11■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 HECW1Q76N89 1606 aa31.09■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 SYNJ2O15056 1496 aa31.08■■■□□ 2.57
CRACR2B-208ENST00000528694 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.07■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 FBLN2P98095 1184 aa31.05■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CRACR2B-208ENST00000528694 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.98■■■□□ 2.55
CRACR2B-208ENST00000528694 CHD1O14646 1710 aa30.96■■■□□ 2.55
CRACR2B-208ENST00000528694 KDM6BO15054 1643 aa30.96■■■□□ 2.55
CRACR2B-208ENST00000528694 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 TRIM52Q96A61 297 aa30.94■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 ANP32CO43423 234 aa30.94■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.93■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 KIAA0556O60303 1618 aa30.9■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 NUP160Q12769 1436 aa30.89■■■□□ 2.54
CRACR2B-208ENST00000528694 MIA2Q96PC5 1412 aa30.88■■■□□ 2.53
CRACR2B-208ENST00000528694 DISP1Q96F81 1524 aa30.88■■■□□ 2.53
CRACR2B-208ENST00000528694 CCER2I3L3R5 266 aa30.88■■■□□ 2.53
CRACR2B-208ENST00000528694 AKNAQ7Z591 1439 aa30.85■■■□□ 2.53
CRACR2B-208ENST00000528694 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.82■■■□□ 2.52
CRACR2B-208ENST00000528694 FOXD1Q16676 465 aa30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms