RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523167.1

RNF19A-211, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 4

Gene RNF19A, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19A-211ENST00000523167 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.88■■■■■ 4.13
RNF19A-211ENST00000523167 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.81■■■■■ 4.12
RNF19A-211ENST00000523167 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.79■■■■■ 4.12
RNF19A-211ENST00000523167 IQGAP2Q13576 1575 aa40.76■■■■■ 4.12
RNF19A-211ENST00000523167 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.72■■■■■ 4.11
RNF19A-211ENST00000523167 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.7■■■■■ 4.11
RNF19A-211ENST00000523167 JPH4Q96JJ6 628 aa40.65■■■■■ 4.1
RNF19A-211ENST00000523167 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.09
RNF19A-211ENST00000523167 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.56■■■■■ 4.08
RNF19A-211ENST00000523167 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
RNF19A-211ENST00000523167 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.48■■■■■ 4.07
RNF19A-211ENST00000523167 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
RNF19A-211ENST00000523167 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.39■■■■■ 4.06
RNF19A-211ENST00000523167 DISP1Q96F81 1524 aa40.36■■■■■ 4.05
RNF19A-211ENST00000523167 CLIP1P30622 1438 aa40.35■■■■■ 4.05
RNF19A-211ENST00000523167 CEP162Q5TB80 1403 aa40.35■■■■■ 4.05
RNF19A-211ENST00000523167 SAMD9Q5K651 1589 aa40.33■■■■■ 4.05
RNF19A-211ENST00000523167 KIAA0556O60303 1618 aa40.33■■■■■ 4.05
RNF19A-211ENST00000523167 ARHGEF11O15085 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
RNF19A-211ENST00000523167 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.28■■■■■ 4.04
RNF19A-211ENST00000523167 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.27■■■■■ 4.04
RNF19A-211ENST00000523167 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.26■■■■■ 4.03
RNF19A-211ENST00000523167 P3H3Q8IVL6 736 aa40.23■■■■■ 4.03
RNF19A-211ENST00000523167 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.19■■■■■ 4.02
RNF19A-211ENST00000523167 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.19■■■■■ 4.02
RNF19A-211ENST00000523167 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.19■■■■■ 4.02
RNF19A-211ENST00000523167 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.16■■■■■ 4.02
RNF19A-211ENST00000523167 PTPRGP23470 1445 aa40.15■■■■■ 4.02
RNF19A-211ENST00000523167 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
RNF19A-211ENST00000523167 ARAP1Q96P48 1450 aa40.06■■■■■ 4
RNF19A-211ENST00000523167 FMN1Q68DA7 1419 aa40.04■■■■■ 4
RNF19A-211ENST00000523167 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.93■■■■□ 3.98
RNF19A-211ENST00000523167 UACAQ9BZF9 1416 aa39.89■■■■□ 3.98
RNF19A-211ENST00000523167 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.85■■■■□ 3.97
RNF19A-211ENST00000523167 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.83■■■■□ 3.97
RNF19A-211ENST00000523167 ABCA8O94911 1581 aa39.83■■■■□ 3.97
RNF19A-211ENST00000523167 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.8■■■■□ 3.96
RNF19A-211ENST00000523167 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.8■■■■□ 3.96
RNF19A-211ENST00000523167 ABCC2Q92887 1545 aa39.79■■■■□ 3.96
RNF19A-211ENST00000523167 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.77■■■■□ 3.96
RNF19A-211ENST00000523167 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.73■■■■□ 3.95
RNF19A-211ENST00000523167 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
RNF19A-211ENST00000523167 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
RNF19A-211ENST00000523167 HECW1Q76N89 1606 aa39.71■■■■□ 3.95
RNF19A-211ENST00000523167 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.69■■■■□ 3.94
RNF19A-211ENST00000523167 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
RNF19A-211ENST00000523167 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
RNF19A-211ENST00000523167 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.59■■■■□ 3.93
RNF19A-211ENST00000523167 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.56■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 ARID3CA6NKF2 412 aa39.54■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 ATP10BO94823 1461 aa39.52■■■■□ 3.92
RNF19A-211ENST00000523167 APLP2Q06481 763 aa39.5■■■■□ 3.91
RNF19A-211ENST00000523167 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
RNF19A-211ENST00000523167 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
RNF19A-211ENST00000523167 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
RNF19A-211ENST00000523167 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.37■■■■□ 3.89
RNF19A-211ENST00000523167 MAP3K1Q13233 1512 aa39.37■■■■□ 3.89
RNF19A-211ENST00000523167 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.35■■■■□ 3.89
RNF19A-211ENST00000523167 MAPKBP1O60336 1514 aa39.34■■■■□ 3.89
RNF19A-211ENST00000523167 TIAM1Q13009 1591 aa39.33■■■■□ 3.89
RNF19A-211ENST00000523167 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.31■■■■□ 3.88
RNF19A-211ENST00000523167 ASXL2Q76L83 1435 aa39.31■■■■□ 3.88
RNF19A-211ENST00000523167 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.27■■■■□ 3.88
RNF19A-211ENST00000523167 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.24■■■■□ 3.87
RNF19A-211ENST00000523167 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
RNF19A-211ENST00000523167 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.17■■■■□ 3.86
RNF19A-211ENST00000523167 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.17■■■■□ 3.86
RNF19A-211ENST00000523167 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.13■■■■□ 3.85
RNF19A-211ENST00000523167 KCNH8Q96L42 1107 aa39.12■■■■□ 3.85
RNF19A-211ENST00000523167 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
RNF19A-211ENST00000523167 KIF14Q15058 1648 aa39.06■■■■□ 3.84
RNF19A-211ENST00000523167 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.05■■■■□ 3.84
RNF19A-211ENST00000523167 DIP2BQ9P265 1576 aa38.98■■■■□ 3.83
RNF19A-211ENST00000523167 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
RNF19A-211ENST00000523167 GLI2P10070 1586 aa38.96■■■■□ 3.83
RNF19A-211ENST00000523167 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.96■■■■□ 3.83
RNF19A-211ENST00000523167 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.91■■■■□ 3.82
RNF19A-211ENST00000523167 NCOA2Q15596 1464 aa38.91■■■■□ 3.82
RNF19A-211ENST00000523167 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.89■■■■□ 3.82
RNF19A-211ENST00000523167 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
RNF19A-211ENST00000523167 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
RNF19A-211ENST00000523167 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.85■■■■□ 3.81
RNF19A-211ENST00000523167 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.84■■■■□ 3.81
RNF19A-211ENST00000523167 CD109Q6YHK3 1445 aa38.82■■■■□ 3.81
RNF19A-211ENST00000523167 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.79■■■■□ 3.8
RNF19A-211ENST00000523167 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.77■■■■□ 3.8
RNF19A-211ENST00000523167 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 PLCH2O75038 1416 aa38.73■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.73■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.71■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.71■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.7■■■■□ 3.79
RNF19A-211ENST00000523167 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.7■■■■□ 3.78
RNF19A-211ENST00000523167 PREX2Q70Z35 1606 aa38.68■■■■□ 3.78
RNF19A-211ENST00000523167 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
RNF19A-211ENST00000523167 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.66■■■■□ 3.78
RNF19A-211ENST00000523167 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms