RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.76□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.76□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCL11AQ9H165 835 aa9.75□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 MSH5O43196 834 aa9.74□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.74□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.72□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF27Q86VH2 1401 aa9.72□□□□□ -0.85
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGF1RP08069 1367 aa9.7□□□□□ -0.86
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.67□□□□□ -0.86
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANP32CO43423 234 aa9.67□□□□□ -0.86
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIAM1Q13009 1591 aa9.66□□□□□ -0.86
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEFLP07196 543 aa9.65□□□□□ -0.86
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC184Q52MB2 194 aa9.64□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.63□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCER2I3L3R5 266 aa9.62□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.61□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTPRKQ15262 1439 aa9.61□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFTRP13569 1480 aa9.6□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.59□□□□□ -0.87
RAPGEF6-211ENST00000512611 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.871e-8■■□□□ 13.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCAPD3P42695 1498 aa9.58□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 TONSLQ96HA7 1378 aa9.57□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.57□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXD1Q16676 465 aa9.55□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.55□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.55□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.54□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.54□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP3K1Q13233 1512 aa9.54□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.54□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.53□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.53□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.52□□□□□ -0.88
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.52□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 HMGXB3Q12766 1538 aa9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARID3CA6NKF2 412 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.49□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAIPQ13075 1403 aa9.49□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 UACAQ9BZF9 1416 aa9.48□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.48□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.47□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 HFM1A2PYH4 1435 aa9.47□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.47□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.46□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.46□□□□□ -0.89
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRS2Q9HD23 443 aa9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 KDM6BO15054 1643 aa9.45□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBR1Q14596 966 aa9.44□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.44□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.43□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.43□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCOA2Q15596 1464 aa9.43□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.42□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEKP35659 375 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 AKNAQ7Z591 1439 aa9.41□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 NESP48681 1621 aa9.41□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.41□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.4□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.4□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.4□□□□□ -0.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.39□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC7Q96M83 1385 aa9.39□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 FMN1Q68DA7 1419 aa9.39□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.39□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.37□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCOA1Q15788 1441 aa9.36□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRDM2Q13029 1718 aa9.36□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.36□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOPBP1Q92547 1522 aa9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRIN2BQ13224 1484 aa9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.32□□□□□ -0.92
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.32□□□□□ -0.92
RAPGEF6-211ENST00000512611 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.32□□□□□ -0.92
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