RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506438.5

PITX1-205, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-205ENST00000506438 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.55■■■■□ 3.44
PITX1-205ENST00000506438 KIF27Q86VH2 1401 aa36.54■■■■□ 3.44
PITX1-205ENST00000506438 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
PITX1-205ENST00000506438 IGF1RP08069 1367 aa36.49■■■■□ 3.43
PITX1-205ENST00000506438 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.48■■■■□ 3.43
PITX1-205ENST00000506438 CUL7Q14999 1698 aa36.48■■■■□ 3.43
PITX1-205ENST00000506438 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.44■■■■□ 3.42
PITX1-205ENST00000506438 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.42■■■■□ 3.42
PITX1-205ENST00000506438 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.41■■■■□ 3.42
PITX1-205ENST00000506438 MAPKBP1O60336 1514 aa36.41■■■■□ 3.42
PITX1-205ENST00000506438 DIP2BQ9P265 1576 aa36.32■■■■□ 3.41
PITX1-205ENST00000506438 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.29■■■■□ 3.4
PITX1-205ENST00000506438 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PITX1-205ENST00000506438 PTPRGP23470 1445 aa36.22■■■■□ 3.39
PITX1-205ENST00000506438 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.19■■■■□ 3.38
PITX1-205ENST00000506438 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.14■■■■□ 3.38
PITX1-205ENST00000506438 IQGAP2Q13576 1575 aa36.12■■■■□ 3.37
PITX1-205ENST00000506438 KDM6BO15054 1643 aa36.1■■■■□ 3.37
PITX1-205ENST00000506438 TSPOAP1O95153 1857 aa36.07■■■■□ 3.36
PITX1-205ENST00000506438 ABCC2Q92887 1545 aa36.05■■■■□ 3.36
PITX1-205ENST00000506438 ASXL2Q76L83 1435 aa35.96■■■■□ 3.35
PITX1-205ENST00000506438 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.95■■■■□ 3.35
PITX1-205ENST00000506438 DISP1Q96F81 1524 aa35.94■■■■□ 3.34
PITX1-205ENST00000506438 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.93■■■■□ 3.34
PITX1-205ENST00000506438 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.93■■■■□ 3.34
PITX1-205ENST00000506438 UACAQ9BZF9 1416 aa35.93■■■■□ 3.34
PITX1-205ENST00000506438 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.86■■■■□ 3.33
PITX1-205ENST00000506438 GLI2P10070 1586 aa35.85■■■■□ 3.33
PITX1-205ENST00000506438 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX1-205ENST00000506438 KIAA0556O60303 1618 aa35.79■■■■□ 3.32
PITX1-205ENST00000506438 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.77■■■■□ 3.32
PITX1-205ENST00000506438 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
PITX1-205ENST00000506438 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
PITX1-205ENST00000506438 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PITX1-205ENST00000506438 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.65■■■■□ 3.3
PITX1-205ENST00000506438 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.63■■■■□ 3.3
PITX1-205ENST00000506438 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.63■■■■□ 3.29
PITX1-205ENST00000506438 GOLGA3Q08378 1498 aa35.59■■■■□ 3.29
PITX1-205ENST00000506438 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.58■■■■□ 3.29
PITX1-205ENST00000506438 PRXQ9BXM0 1461 aa35.55■■■■□ 3.28
PITX1-205ENST00000506438 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PITX1-205ENST00000506438 EEA1Q15075 1411 aa35.54■■■■□ 3.28
PITX1-205ENST00000506438 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.54■■■■□ 3.28
PITX1-205ENST00000506438 ADGRL1O94910 1474 aa35.52■■■■□ 3.28
PITX1-205ENST00000506438 ABCA8O94911 1581 aa35.46■■■■□ 3.27
PITX1-205ENST00000506438 KCNH8Q96L42 1107 aa35.41■■■■□ 3.26
PITX1-205ENST00000506438 CD109Q6YHK3 1445 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX1-205ENST00000506438 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX1-205ENST00000506438 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
PITX1-205ENST00000506438 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.34■■■■□ 3.25
PITX1-205ENST00000506438 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.33■■■■□ 3.25
PITX1-205ENST00000506438 ARID3CA6NKF2 412 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-205ENST00000506438 P3H3Q8IVL6 736 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-205ENST00000506438 ATP10BO94823 1461 aa35.16■■■■□ 3.22
PITX1-205ENST00000506438 SAMD9Q5K651 1589 aa35.11■■■■□ 3.21
PITX1-205ENST00000506438 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX1-205ENST00000506438 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 KIF21BO75037 1637 aa35.05■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX1-205ENST00000506438 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
PITX1-205ENST00000506438 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
PITX1-205ENST00000506438 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.99■■■■□ 3.19
PITX1-205ENST00000506438 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PITX1-205ENST00000506438 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.91■■■■□ 3.18
PITX1-205ENST00000506438 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PITX1-205ENST00000506438 NEO1Q92859 1461 aa34.9■■■■□ 3.18
PITX1-205ENST00000506438 RAPGEF3O95398 923 aa34.88■■■■□ 3.17
PITX1-205ENST00000506438 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.8■■■■□ 3.16
PITX1-205ENST00000506438 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.79■■■■□ 3.16
PITX1-205ENST00000506438 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.77■■■■□ 3.16
PITX1-205ENST00000506438 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.77■■■■□ 3.16
PITX1-205ENST00000506438 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
PITX1-205ENST00000506438 PTPRMP28827 1452 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX1-205ENST00000506438 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX1-205ENST00000506438 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
PITX1-205ENST00000506438 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.66■■■■□ 3.14
PITX1-205ENST00000506438 FANCAO15360 1455 aa34.66■■■■□ 3.14
PITX1-205ENST00000506438 AKNAQ7Z591 1439 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX1-205ENST00000506438 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX1-205ENST00000506438 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.142e-8■■■■□ 23.4
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PITX1-205ENST00000506438 MADDQ8WXG6 1647 aa34.61■■■■□ 3.13
PITX1-205ENST00000506438 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX1-205ENST00000506438 RICTORQ6R327 1708 aa34.59■■■■□ 3.13
PITX1-205ENST00000506438 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
PITX1-205ENST00000506438 FMN1Q68DA7 1419 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-205ENST00000506438 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PITX1-205ENST00000506438 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.47■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 HECW1Q76N89 1606 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX1-205ENST00000506438 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX1-205ENST00000506438 PLCH2O75038 1416 aa34.42■■■■□ 3.1
PITX1-205ENST00000506438 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.42■■■■□ 3.1
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