RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CTDSP1-211ENST00000492545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CTDSP1-211ENST00000492545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.45■■■■■ 4.07
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.45■■■■■ 4.07
CTDSP1-211ENST00000492545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.19■■■■■ 4.03
CTDSP1-211ENST00000492545 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.08■■■■■ 4.01
CTDSP1-211ENST00000492545 IQGAP2Q13576 1575 aa40.06■■■■■ 4
CTDSP1-211ENST00000492545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.03■■■■■ 4
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRGP23470 1445 aa39.99■■■■□ 3.99
CTDSP1-211ENST00000492545 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.96■■■■□ 3.99
CTDSP1-211ENST00000492545 PRXQ9BXM0 1461 aa39.91■■■■□ 3.98
CTDSP1-211ENST00000492545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.86■■■■□ 3.97
CTDSP1-211ENST00000492545 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.84■■■■□ 3.97
CTDSP1-211ENST00000492545 DISP1Q96F81 1524 aa39.83■■■■□ 3.97
CTDSP1-211ENST00000492545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.81■■■■□ 3.96
CTDSP1-211ENST00000492545 MAPKBP1O60336 1514 aa39.8■■■■□ 3.96
CTDSP1-211ENST00000492545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
CTDSP1-211ENST00000492545 EEA1Q15075 1411 aa39.76■■■■□ 3.96
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.71■■■■□ 3.95
CTDSP1-211ENST00000492545 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 UACAQ9BZF9 1416 aa39.68■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.68■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA3Q08378 1498 aa39.66■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC2Q92887 1545 aa39.65■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA0556O60303 1618 aa39.65■■■■□ 3.94
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.61■■■■□ 3.93
CTDSP1-211ENST00000492545 DIP2BQ9P265 1576 aa39.52■■■■□ 3.92
CTDSP1-211ENST00000492545 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.5■■■■□ 3.91
CTDSP1-211ENST00000492545 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.49■■■■□ 3.91
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.47■■■■□ 3.91
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
CTDSP1-211ENST00000492545 ASXL2Q76L83 1435 aa39.45■■■■□ 3.91
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCA8O94911 1581 aa39.29■■■■□ 3.88
CTDSP1-211ENST00000492545 GLI2P10070 1586 aa39.29■■■■□ 3.88
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
CTDSP1-211ENST00000492545 P3H3Q8IVL6 736 aa39.26■■■■□ 3.88
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF21BO75037 1637 aa39.25■■■■□ 3.87
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMD9Q5K651 1589 aa39.21■■■■□ 3.87
CTDSP1-211ENST00000492545 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.16■■■■□ 3.86
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPOAP1O95153 1857 aa39.13■■■■□ 3.85
CTDSP1-211ENST00000492545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
CTDSP1-211ENST00000492545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM6BO15054 1643 aa39.04■■■■□ 3.84
CTDSP1-211ENST00000492545 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.01■■■■□ 3.84
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP10BO94823 1461 aa39.01■■■■□ 3.84
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39■■■■□ 3.83
CTDSP1-211ENST00000492545 TEX14Q8IWB6 1497 aa39■■■■□ 3.83
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNH8Q96L42 1107 aa38.99■■■■□ 3.83
CTDSP1-211ENST00000492545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.97■■■■□ 3.83
CTDSP1-211ENST00000492545 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
CTDSP1-211ENST00000492545 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.94■■■■□ 3.82
CTDSP1-211ENST00000492545 ARID3CA6NKF2 412 aa38.93■■■■□ 3.82
CTDSP1-211ENST00000492545 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
CTDSP1-211ENST00000492545 CD109Q6YHK3 1445 aa38.9■■■■□ 3.82
CTDSP1-211ENST00000492545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.88■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.84■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.82■■■■□ 3.81
CTDSP1-211ENST00000492545 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.74■■■■□ 3.79
CTDSP1-211ENST00000492545 FMN1Q68DA7 1419 aa38.72■■■■□ 3.79
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.69■■■■□ 3.78
CTDSP1-211ENST00000492545 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.65■■■■□ 3.78
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.64■■■■□ 3.78
CTDSP1-211ENST00000492545 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
CTDSP1-211ENST00000492545 NEO1Q92859 1461 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDSP1-211ENST00000492545 HECW1Q76N89 1606 aa38.47■■■■□ 3.75
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CTDSP1-211ENST00000492545 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.731e-5■■■■□ 25.8
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CTDSP1-211ENST00000492545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.32■■■■□ 3.73
CTDSP1-211ENST00000492545 RAPGEF3O95398 923 aa38.29■■■■□ 3.72
CTDSP1-211ENST00000492545 FANCAO15360 1455 aa38.28■■■■□ 3.72
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRL1O94910 1474 aa38.27■■■■□ 3.72
CTDSP1-211ENST00000492545 AKNAQ7Z591 1439 aa38.26■■■■□ 3.72
CTDSP1-211ENST00000492545 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.24■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 PLCH2O75038 1416 aa38.23■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.23■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.22■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
CTDSP1-211ENST00000492545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.17■■■■□ 3.7
CTDSP1-211ENST00000492545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
CTDSP1-211ENST00000492545 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.15■■■■□ 3.7
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF14Q15058 1648 aa38.12■■■■□ 3.69
CTDSP1-211ENST00000492545 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.08■■■■□ 3.69
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.08■■■■□ 3.69
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.03■■■■□ 3.68
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.02■■■■□ 3.68
CTDSP1-211ENST00000492545 RICTORQ6R327 1708 aa38.01■■■■□ 3.67
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP162Q5TB80 1403 aa37.99■■■■□ 3.67
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.98■■■■□ 3.67
CTDSP1-211ENST00000492545 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.97■■■■□ 3.67
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