RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492099.1

SH3GL3-204, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 3, endophilin A3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SH3GL3, Length 1,170 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3-204ENST00000492099 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.38■■■■■ 5.01
SH3GL3-204ENST00000492099 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
SH3GL3-204ENST00000492099 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
SH3GL3-204ENST00000492099 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.3■■■■■ 5
SH3GL3-204ENST00000492099 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.05■■■■■ 4.96
SH3GL3-204ENST00000492099 IQGAP2Q13576 1575 aa45.91■■■■■ 4.94
SH3GL3-204ENST00000492099 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.86■■■■■ 4.93
SH3GL3-204ENST00000492099 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.77■■■■■ 4.92
SH3GL3-204ENST00000492099 PTPRGP23470 1445 aa45.77■■■■■ 4.92
SH3GL3-204ENST00000492099 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.74■■■■■ 4.91
SH3GL3-204ENST00000492099 PRXQ9BXM0 1461 aa45.73■■■■■ 4.91
SH3GL3-204ENST00000492099 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.67■■■■■ 4.9
SH3GL3-204ENST00000492099 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
SH3GL3-204ENST00000492099 DISP1Q96F81 1524 aa45.64■■■■■ 4.9
SH3GL3-204ENST00000492099 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
SH3GL3-204ENST00000492099 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.6■■■■■ 4.89
SH3GL3-204ENST00000492099 MAPKBP1O60336 1514 aa45.55■■■■■ 4.88
SH3GL3-204ENST00000492099 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.54■■■■■ 4.88
SH3GL3-204ENST00000492099 EEA1Q15075 1411 aa45.54■■■■■ 4.88
SH3GL3-204ENST00000492099 KIAA0556O60303 1618 aa45.47■■■■■ 4.87
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.44■■■■■ 4.87
SH3GL3-204ENST00000492099 UACAQ9BZF9 1416 aa45.43■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.41■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.4■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.4■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 GOLGA3Q08378 1498 aa45.4■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCC2Q92887 1545 aa45.4■■■■■ 4.86
SH3GL3-204ENST00000492099 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.32■■■■■ 4.85
SH3GL3-204ENST00000492099 DIP2BQ9P265 1576 aa45.28■■■■■ 4.84
SH3GL3-204ENST00000492099 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
SH3GL3-204ENST00000492099 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.18■■■■■ 4.82
SH3GL3-204ENST00000492099 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.18■■■■■ 4.82
SH3GL3-204ENST00000492099 ASXL2Q76L83 1435 aa45.18■■■■■ 4.82
SH3GL3-204ENST00000492099 P3H3Q8IVL6 736 aa45.03■■■■■ 4.8
SH3GL3-204ENST00000492099 KIF21BO75037 1637 aa45.03■■■■■ 4.8
SH3GL3-204ENST00000492099 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCA8O94911 1581 aa45.03■■■■■ 4.8
SH3GL3-204ENST00000492099 GLI2P10070 1586 aa44.97■■■■■ 4.79
SH3GL3-204ENST00000492099 SAMD9Q5K651 1589 aa44.96■■■■■ 4.79
SH3GL3-204ENST00000492099 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
SH3GL3-204ENST00000492099 TSPOAP1O95153 1857 aa44.88■■■■■ 4.78
SH3GL3-204ENST00000492099 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
SH3GL3-204ENST00000492099 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.85■■■■■ 4.77
SH3GL3-204ENST00000492099 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
SH3GL3-204ENST00000492099 KDM6BO15054 1643 aa44.73■■■■■ 4.75
SH3GL3-204ENST00000492099 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.7■■■■■ 4.75
SH3GL3-204ENST00000492099 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.7■■■■■ 4.75
SH3GL3-204ENST00000492099 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.7■■■■■ 4.75
SH3GL3-204ENST00000492099 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.69■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 ATP10BO94823 1461 aa44.69■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.66■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 ARID3CA6NKF2 412 aa44.66■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 KCNH8Q96L42 1107 aa44.66■■■■■ 4.74
SH3GL3-204ENST00000492099 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.61■■■■■ 4.73
SH3GL3-204ENST00000492099 CD109Q6YHK3 1445 aa44.53■■■■■ 4.72
SH3GL3-204ENST00000492099 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
SH3GL3-204ENST00000492099 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
SH3GL3-204ENST00000492099 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
SH3GL3-204ENST00000492099 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.48■■■■■ 4.71
SH3GL3-204ENST00000492099 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.45■■■■■ 4.71
SH3GL3-204ENST00000492099 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
SH3GL3-204ENST00000492099 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
SH3GL3-204ENST00000492099 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.37■■■■■ 4.69
SH3GL3-204ENST00000492099 FMN1Q68DA7 1419 aa44.33■■■■■ 4.69
SH3GL3-204ENST00000492099 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.32■■■■■ 4.69
SH3GL3-204ENST00000492099 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.28■■■■■ 4.68
SH3GL3-204ENST00000492099 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
SH3GL3-204ENST00000492099 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.15■■■■■ 4.66
SH3GL3-204ENST00000492099 HECW1Q76N89 1606 aa44.13■■■■■ 4.65
SH3GL3-204ENST00000492099 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
SH3GL3-204ENST00000492099 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.09■■■■■ 4.65
SH3GL3-204ENST00000492099 NEO1Q92859 1461 aa44.04■■■■■ 4.64
SH3GL3-204ENST00000492099 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
SH3GL3-204ENST00000492099 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.02■■■■■ 4.64
SH3GL3-204ENST00000492099 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.99■■■■■ 4.631e-7■■□□□ 13.4
SH3GL3-204ENST00000492099 CLIP1P30622 1438 aa43.94■■■■■ 4.62
SH3GL3-204ENST00000492099 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.9■■■■■ 4.62
SH3GL3-204ENST00000492099 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.88■■■■■ 4.61
SH3GL3-204ENST00000492099 RAPGEF3O95398 923 aa43.84■■■■■ 4.61
SH3GL3-204ENST00000492099 FANCAO15360 1455 aa43.83■■■■■ 4.61
SH3GL3-204ENST00000492099 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 ADGRL1O94910 1474 aa43.81■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 AKNAQ7Z591 1439 aa43.81■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.8■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.79■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 PLCH2O75038 1416 aa43.77■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.76■■■■■ 4.6
SH3GL3-204ENST00000492099 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.75■■■■■ 4.59
SH3GL3-204ENST00000492099 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
SH3GL3-204ENST00000492099 KIF14Q15058 1648 aa43.72■■■■■ 4.59
SH3GL3-204ENST00000492099 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.67■■■■■ 4.58
SH3GL3-204ENST00000492099 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.64■■■■■ 4.58
SH3GL3-204ENST00000492099 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.61■■■■■ 4.57
SH3GL3-204ENST00000492099 CEP162Q5TB80 1403 aa43.59■■■■■ 4.57
SH3GL3-204ENST00000492099 RICTORQ6R327 1708 aa43.58■■■■■ 4.57
SH3GL3-204ENST00000492099 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.55■■■■■ 4.56
SH3GL3-204ENST00000492099 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.49■■■■■ 4.55
SH3GL3-204ENST00000492099 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.48■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms