RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488865.2

RNF220-216, Transcript of ring finger protein 220, humanhuman

TSL 2

Gene RNF220, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220-216ENST00000488865 IGF1RP08069 1367 aa45.41■■■■■ 4.86
RNF220-216ENST00000488865 CUL7Q14999 1698 aa45.32■■■■■ 4.85
RNF220-216ENST00000488865 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.24■■■■■ 4.83
RNF220-216ENST00000488865 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.1■■■■■ 4.81
RNF220-216ENST00000488865 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.99■■■■■ 4.79
RNF220-216ENST00000488865 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.98■■■■■ 4.79
RNF220-216ENST00000488865 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.93■■■■■ 4.78
RNF220-216ENST00000488865 MAPKBP1O60336 1514 aa44.91■■■■■ 4.78
RNF220-216ENST00000488865 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.86■■■■■ 4.77
RNF220-216ENST00000488865 PTPRGP23470 1445 aa44.8■■■■■ 4.76
RNF220-216ENST00000488865 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.8■■■■■ 4.76
RNF220-216ENST00000488865 IQGAP2Q13576 1575 aa44.79■■■■■ 4.76
RNF220-216ENST00000488865 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.79■■■■■ 4.76
RNF220-216ENST00000488865 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.74■■■■■ 4.75
RNF220-216ENST00000488865 DIP2BQ9P265 1576 aa44.71■■■■■ 4.75
RNF220-216ENST00000488865 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.71■■■■■ 4.75
RNF220-216ENST00000488865 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
RNF220-216ENST00000488865 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
RNF220-216ENST00000488865 DISP1Q96F81 1524 aa44.57■■■■■ 4.73
RNF220-216ENST00000488865 ABCC2Q92887 1545 aa44.55■■■■■ 4.72
RNF220-216ENST00000488865 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.54■■■■■ 4.72
RNF220-216ENST00000488865 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.51■■■■■ 4.72
RNF220-216ENST00000488865 UACAQ9BZF9 1416 aa44.46■■■■■ 4.71
RNF220-216ENST00000488865 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.39■■■■■ 4.7
RNF220-216ENST00000488865 KIAA0556O60303 1618 aa44.37■■■■■ 4.69
RNF220-216ENST00000488865 ASXL2Q76L83 1435 aa44.37■■■■■ 4.69
RNF220-216ENST00000488865 TSPOAP1O95153 1857 aa44.35■■■■■ 4.69
RNF220-216ENST00000488865 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.31■■■■■ 4.68
RNF220-216ENST00000488865 KDM6BO15054 1643 aa44.31■■■■■ 4.68
RNF220-216ENST00000488865 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.29■■■■■ 4.68
RNF220-216ENST00000488865 GLI2P10070 1586 aa44.28■■■■■ 4.68
RNF220-216ENST00000488865 PRXQ9BXM0 1461 aa44.27■■■■■ 4.68
RNF220-216ENST00000488865 GOLGA3Q08378 1498 aa44.2■■■■■ 4.67
RNF220-216ENST00000488865 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
RNF220-216ENST00000488865 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
RNF220-216ENST00000488865 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
RNF220-216ENST00000488865 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.01■■■■■ 4.64
RNF220-216ENST00000488865 ABCA8O94911 1581 aa43.99■■■■■ 4.63
RNF220-216ENST00000488865 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.96■■■■■ 4.63
RNF220-216ENST00000488865 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.95■■■■■ 4.63
RNF220-216ENST00000488865 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.91■■■■■ 4.62
RNF220-216ENST00000488865 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.84■■■■■ 4.61
RNF220-216ENST00000488865 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
RNF220-216ENST00000488865 EEA1Q15075 1411 aa43.81■■■■■ 4.6
RNF220-216ENST00000488865 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
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RNF220-216ENST00000488865 SAMD9Q5K651 1589 aa43.71■■■■■ 4.59
RNF220-216ENST00000488865 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.7■■■■■ 4.59
RNF220-216ENST00000488865 KCNH8Q96L42 1107 aa43.7■■■■■ 4.59
RNF220-216ENST00000488865 CD109Q6YHK3 1445 aa43.7■■■■■ 4.59
RNF220-216ENST00000488865 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.68■■■■■ 4.58
RNF220-216ENST00000488865 ATP10BO94823 1461 aa43.63■■■■■ 4.57
RNF220-216ENST00000488865 ARID3CA6NKF2 412 aa43.54■■■■■ 4.56
RNF220-216ENST00000488865 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.51■■■■■ 4.56
RNF220-216ENST00000488865 ADGRL1O94910 1474 aa43.5■■■■■ 4.55
RNF220-216ENST00000488865 KIF21BO75037 1637 aa43.42■■■■■ 4.54
RNF220-216ENST00000488865 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.39■■■■■ 4.54
RNF220-216ENST00000488865 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
RNF220-216ENST00000488865 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.38■■■■■ 4.53
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RNF220-216ENST00000488865 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.34■■■■■ 4.53
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RNF220-216ENST00000488865 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
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RNF220-216ENST00000488865 PTPRMP28827 1452 aa42.67■■■■■ 4.42
RNF220-216ENST00000488865 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.6■■■■■ 4.41
RNF220-216ENST00000488865 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
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RNF220-216ENST00000488865 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.57■■■■■ 4.4
RNF220-216ENST00000488865 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.56■■■■■ 4.4
RNF220-216ENST00000488865 MADDQ8WXG6 1647 aa42.56■■■■■ 4.4
RNF220-216ENST00000488865 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.56■■■■■ 4.4
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