RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485883.5

CHRD-215, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 4

Gene CHRD, Length 568 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-215ENST00000485883 KIF27Q86VH2 1401 aa35.64■■■■□ 3.3
CHRD-215ENST00000485883 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.52■■■■□ 3.28
CHRD-215ENST00000485883 CUL7Q14999 1698 aa35.49■■■■□ 3.27
CHRD-215ENST00000485883 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.45■■■■□ 3.27
CHRD-215ENST00000485883 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.43■■■■□ 3.26
CHRD-215ENST00000485883 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.4■■■■□ 3.26
CHRD-215ENST00000485883 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.39■■■■□ 3.26
CHRD-215ENST00000485883 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CHRD-215ENST00000485883 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.37■■■■□ 3.25
CHRD-215ENST00000485883 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.34■■■■□ 3.25
CHRD-215ENST00000485883 MAPKBP1O60336 1514 aa35.31■■■■□ 3.24
CHRD-215ENST00000485883 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CHRD-215ENST00000485883 PTPRGP23470 1445 aa35.24■■■■□ 3.23
CHRD-215ENST00000485883 DIP2BQ9P265 1576 aa35.22■■■■□ 3.23
CHRD-215ENST00000485883 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.16■■■■□ 3.22
CHRD-215ENST00000485883 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.15■■■■□ 3.22
CHRD-215ENST00000485883 IQGAP2Q13576 1575 aa35.15■■■■□ 3.22
CHRD-215ENST00000485883 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.07■■■■□ 3.2
CHRD-215ENST00000485883 DISP1Q96F81 1524 aa35.05■■■■□ 3.2
CHRD-215ENST00000485883 ABCC2Q92887 1545 aa35.03■■■■□ 3.2
CHRD-215ENST00000485883 TSPOAP1O95153 1857 aa34.99■■■■□ 3.19
CHRD-215ENST00000485883 UACAQ9BZF9 1416 aa34.96■■■■□ 3.19
CHRD-215ENST00000485883 ASXL2Q76L83 1435 aa34.95■■■■□ 3.19
CHRD-215ENST00000485883 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.95■■■■□ 3.19
CHRD-215ENST00000485883 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.95■■■■□ 3.19
CHRD-215ENST00000485883 KDM6BO15054 1643 aa34.92■■■■□ 3.18
CHRD-215ENST00000485883 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.89■■■■□ 3.18
CHRD-215ENST00000485883 KIAA0556O60303 1618 aa34.85■■■■□ 3.17
CHRD-215ENST00000485883 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.81■■■■□ 3.16
CHRD-215ENST00000485883 GLI2P10070 1586 aa34.8■■■■□ 3.16
CHRD-215ENST00000485883 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.73■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 PRXQ9BXM0 1461 aa34.71■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.7■■■■□ 3.15
CHRD-215ENST00000485883 GOLGA3Q08378 1498 aa34.62■■■■□ 3.13
CHRD-215ENST00000485883 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
CHRD-215ENST00000485883 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.61■■■■□ 3.13
CHRD-215ENST00000485883 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.58■■■■□ 3.13
CHRD-215ENST00000485883 ABCA8O94911 1581 aa34.55■■■■□ 3.12
CHRD-215ENST00000485883 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.51■■■■□ 3.11
CHRD-215ENST00000485883 P3H3Q8IVL6 736 aa34.48■■■■□ 3.11
CHRD-215ENST00000485883 KCNH8Q96L42 1107 aa34.48■■■■□ 3.11
CHRD-215ENST00000485883 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.45■■■■□ 3.11
CHRD-215ENST00000485883 ARID3CA6NKF2 412 aa34.41■■■■□ 3.1
CHRD-215ENST00000485883 CD109Q6YHK3 1445 aa34.39■■■■□ 3.1
CHRD-215ENST00000485883 ADGRL1O94910 1474 aa34.36■■■■□ 3.09
CHRD-215ENST00000485883 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.34■■■■□ 3.09
CHRD-215ENST00000485883 ATP10BO94823 1461 aa34.31■■■■□ 3.08
CHRD-215ENST00000485883 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.31■■■■□ 3.08
CHRD-215ENST00000485883 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CHRD-215ENST00000485883 SAMD9Q5K651 1589 aa34.25■■■■□ 3.07
CHRD-215ENST00000485883 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CHRD-215ENST00000485883 EEA1Q15075 1411 aa34.19■■■■□ 3.06
CHRD-215ENST00000485883 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.14■■■■□ 3.06
CHRD-215ENST00000485883 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.12■■■■□ 3.05
CHRD-215ENST00000485883 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CHRD-215ENST00000485883 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CHRD-215ENST00000485883 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
CHRD-215ENST00000485883 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.07■■■■□ 3.04
CHRD-215ENST00000485883 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.06■■■■□ 3.04
CHRD-215ENST00000485883 RAPGEF3O95398 923 aa33.97■■■■□ 3.03
CHRD-215ENST00000485883 KIF21BO75037 1637 aa33.97■■■■□ 3.03
CHRD-215ENST00000485883 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.96■■■■□ 3.03
CHRD-215ENST00000485883 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.91■■■■□ 3.02
CHRD-215ENST00000485883 NEO1Q92859 1461 aa33.9■■■■□ 3.02
CHRD-215ENST00000485883 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.89■■■■□ 3.02
CHRD-215ENST00000485883 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.89■■■■□ 3.02
CHRD-215ENST00000485883 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.87■■■■□ 3.01
CHRD-215ENST00000485883 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.81■■■■□ 3
CHRD-215ENST00000485883 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
CHRD-215ENST00000485883 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.79■■■■□ 3
CHRD-215ENST00000485883 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■■□ 3
CHRD-215ENST00000485883 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
CHRD-215ENST00000485883 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CHRD-215ENST00000485883 AKNAQ7Z591 1439 aa33.72■■■□□ 2.99
CHRD-215ENST00000485883 FANCAO15360 1455 aa33.71■■■□□ 2.99
CHRD-215ENST00000485883 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.7■■■□□ 2.99
CHRD-215ENST00000485883 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.69■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 PTPRMP28827 1452 aa33.66■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.66■■■□□ 2.98
CHRD-215ENST00000485883 RICTORQ6R327 1708 aa33.63■■■□□ 2.97
CHRD-215ENST00000485883 FMN1Q68DA7 1419 aa33.61■■■□□ 2.97
CHRD-215ENST00000485883 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.6■■■□□ 2.97
CHRD-215ENST00000485883 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.59■■■□□ 2.97
CHRD-215ENST00000485883 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.59■■■□□ 2.97
CHRD-215ENST00000485883 PLCH2O75038 1416 aa33.55■■■□□ 2.96
CHRD-215ENST00000485883 MADDQ8WXG6 1647 aa33.55■■■□□ 2.96
CHRD-215ENST00000485883 HECW1Q76N89 1606 aa33.54■■■□□ 2.96
CHRD-215ENST00000485883 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.53■■■□□ 2.96
CHRD-215ENST00000485883 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.51■■■□□ 2.95
CHRD-215ENST00000485883 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.5■■■□□ 2.95
CHRD-215ENST00000485883 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.47■■■□□ 2.95
CHRD-215ENST00000485883 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
CHRD-215ENST00000485883 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.45■■■□□ 2.94
CHRD-215ENST00000485883 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.45■■■□□ 2.94
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