RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SKIL-208	ENST00000477216	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SKIL-208	ENST00000477216	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.66	■■■■■ 4.42
SKIL-208	ENST00000477216	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SKIL-208	ENST00000477216	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SKIL-208	ENST00000477216	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SKIL-208	ENST00000477216	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SKIL-208	ENST00000477216	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SKIL-208	ENST00000477216	CUL7	Q14999	1698 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SKIL-208	ENST00000477216	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SKIL-208	ENST00000477216	KDM6B	O15054	1643 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SKIL-208	ENST00000477216	IGF1R	P08069	1367 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SKIL-208	ENST00000477216	PTPRG	P23470	1445 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SKIL-208	ENST00000477216	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SKIL-208	ENST00000477216	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SKIL-208	ENST00000477216	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.13	■■■■■ 4.33
SKIL-208	ENST00000477216	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.12	■■■■■ 4.33
SKIL-208	ENST00000477216	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SKIL-208	ENST00000477216	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SKIL-208	ENST00000477216	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.06	■■■■■ 4.32
SKIL-208	ENST00000477216	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SKIL-208	ENST00000477216	GLI2	P10070	1586 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SKIL-208	ENST00000477216	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SKIL-208	ENST00000477216	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SKIL-208	ENST00000477216	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SKIL-208	ENST00000477216	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
SKIL-208	ENST00000477216	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SKIL-208	ENST00000477216	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.78	■■■■■ 4.28
SKIL-208	ENST00000477216	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
SKIL-208	ENST00000477216	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SKIL-208	ENST00000477216	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SKIL-208	ENST00000477216	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.69	■■■■■ 4.26
SKIL-208	ENST00000477216	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.67	■■■■■ 4.26
SKIL-208	ENST00000477216	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SKIL-208	ENST00000477216	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SKIL-208	ENST00000477216	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SKIL-208	ENST00000477216	EEA1	Q15075	1411 aa		41.6	■■■■■ 4.25
SKIL-208	ENST00000477216	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
SKIL-208	ENST00000477216	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SKIL-208	ENST00000477216	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.47	■■■■■ 4.23
SKIL-208	ENST00000477216	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SKIL-208	ENST00000477216	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SKIL-208	ENST00000477216	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.46	■■■■■ 4.23
SKIL-208	ENST00000477216	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.45	■■■■■ 4.23
SKIL-208	ENST00000477216	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SKIL-208	ENST00000477216	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SKIL-208	ENST00000477216	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.33	■■■■■ 4.21
SKIL-208	ENST00000477216	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SKIL-208	ENST00000477216	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.31	■■■■■ 4.2
SKIL-208	ENST00000477216	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.29	■■■■■ 4.2
SKIL-208	ENST00000477216	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.25	■■■■■ 4.19
SKIL-208	ENST00000477216	ABCA8	O94911	1581 aa		41.19	■■■■■ 4.18
SKIL-208	ENST00000477216	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.18	■■■■■ 4.18
SKIL-208	ENST00000477216	KIF21B	O75037	1637 aa		41.11	■■■■■ 4.17
SKIL-208	ENST00000477216	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.07	■■■■■ 4.16
SKIL-208	ENST00000477216	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.03	■■■■■ 4.16
SKIL-208	ENST00000477216	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SKIL-208	ENST00000477216	ATP10B	O94823	1461 aa		40.83	■■■■■ 4.13
SKIL-208	ENST00000477216	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.82	■■■■■ 4.13
SKIL-208	ENST00000477216	NEO1	Q92859	1461 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SKIL-208	ENST00000477216	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
SKIL-208	ENST00000477216	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.7	■■■■■ 4.11
SKIL-208	ENST00000477216	P3H3	Q8IVL6	736 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	PTPRM	P28827	1452 aa		40.69	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.67	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	SAMD9	Q5K651	1589 aa		40.65	■■■■■ 4.1
SKIL-208	ENST00000477216	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SKIL-208	ENST00000477216	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
SKIL-208	ENST00000477216	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
SKIL-208	ENST00000477216	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SKIL-208	ENST00000477216	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SKIL-208	ENST00000477216	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SKIL-208	ENST00000477216	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
SKIL-208	ENST00000477216	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
SKIL-208	ENST00000477216	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
SKIL-208	ENST00000477216	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SKIL-208	ENST00000477216	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SKIL-208	ENST00000477216	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SKIL-208	ENST00000477216	FANCA	O15360	1455 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SKIL-208	ENST00000477216	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.32	■■■■■ 4.05
SKIL-208	ENST00000477216	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.3	■■■■■ 4.04
SKIL-208	ENST00000477216	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.29	■■■■■ 4.04
SKIL-208	ENST00000477216	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SKIL-208	ENST00000477216	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.26	■■■■■ 4.03
SKIL-208	ENST00000477216	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
SKIL-208	ENST00000477216	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.21	■■■■■ 4.03
SKIL-208	ENST00000477216	CLIP1	P30622	1438 aa		40.21	■■■■■ 4.03
SKIL-208	ENST00000477216	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.2	■■■■■ 4.03
SKIL-208	ENST00000477216	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.14	■■■■■ 4.02
SKIL-208	ENST00000477216	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.09	■■■■■ 4.01
SKIL-208	ENST00000477216	PLCH2	O75038	1416 aa		40.05	■■■■■ 4

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