RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469781.5

C1orf35-203, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 2,256 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-203ENST00000469781 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.11■■■□□ 2.57
C1orf35-203ENST00000469781 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
C1orf35-203ENST00000469781 CUL7Q14999 1698 aa31.07■■■□□ 2.56
C1orf35-203ENST00000469781 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
C1orf35-203ENST00000469781 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.02■■■□□ 2.56
C1orf35-203ENST00000469781 P3H3Q8IVL6 736 aa31.01■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.98■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 ITGAEP38570 1179 aa30.96■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 WDR97A6NE52 1622 aa30.96■■■□□ 2.55
C1orf35-203ENST00000469781 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.94■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.93■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 WDR62O43379 1518 aa30.93■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.92■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.89■■■□□ 2.54
C1orf35-203ENST00000469781 NEUROD1Q13562 356 aa30.89■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.87■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.86■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.533e-7■■■■■ 38.6
C1orf35-203ENST00000469781 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.84■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.84■■■□□ 2.53
C1orf35-203ENST00000469781 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.8■■■□□ 2.52
C1orf35-203ENST00000469781 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
C1orf35-203ENST00000469781 FMN1Q68DA7 1419 aa30.79■■■□□ 2.52
C1orf35-203ENST00000469781 IFT140Q96RY7 1462 aa30.77■■■□□ 2.52
C1orf35-203ENST00000469781 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
C1orf35-203ENST00000469781 MIER1Q8N108 512 aa30.74■■■□□ 2.51
C1orf35-203ENST00000469781 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.73■■■□□ 2.51
C1orf35-203ENST00000469781 SAMD9Q5K651 1589 aa30.67■■■□□ 2.5
C1orf35-203ENST00000469781 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.67■■■□□ 2.5
C1orf35-203ENST00000469781 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
C1orf35-203ENST00000469781 MAPKBP1O60336 1514 aa30.61■■■□□ 2.49
C1orf35-203ENST00000469781 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
C1orf35-203ENST00000469781 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
C1orf35-203ENST00000469781 GRIN2BQ13224 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
C1orf35-203ENST00000469781 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.57■■■□□ 2.48
C1orf35-203ENST00000469781 PBRM1Q86U86 1689 aa30.57■■■□□ 2.48
C1orf35-203ENST00000469781 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.56■■■□□ 2.48
C1orf35-203ENST00000469781 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.52■■■□□ 2.48
C1orf35-203ENST00000469781 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
C1orf35-203ENST00000469781 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.44■■■□□ 2.46
C1orf35-203ENST00000469781 ADAMTS12P58397 1594 aa30.42■■■□□ 2.46
C1orf35-203ENST00000469781 NCOA2Q15596 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
C1orf35-203ENST00000469781 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.4■■■□□ 2.46
C1orf35-203ENST00000469781 IQGAP2Q13576 1575 aa30.37■■■□□ 2.45
C1orf35-203ENST00000469781 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
C1orf35-203ENST00000469781 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.37■■■□□ 2.45
C1orf35-203ENST00000469781 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.36■■■□□ 2.45
C1orf35-203ENST00000469781 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.34■■■□□ 2.45
C1orf35-203ENST00000469781 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.31■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 HECW1Q76N89 1606 aa30.3■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 HFM1A2PYH4 1435 aa30.29■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.27■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 PTPRKQ15262 1439 aa30.27■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
C1orf35-203ENST00000469781 FBLN2P98095 1184 aa30.25■■■□□ 2.43
C1orf35-203ENST00000469781 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.24■■■□□ 2.43
C1orf35-203ENST00000469781 ARHGEF11O15085 1522 aa30.23■■■□□ 2.43
C1orf35-203ENST00000469781 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
C1orf35-203ENST00000469781 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.22■■■□□ 2.43
C1orf35-203ENST00000469781 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
C1orf35-203ENST00000469781 GRIN2AQ12879 1464 aa30.2■■■□□ 2.42
C1orf35-203ENST00000469781 UACAQ9BZF9 1416 aa30.19■■■□□ 2.42
C1orf35-203ENST00000469781 SYNJ2O15056 1496 aa30.18■■■□□ 2.42
C1orf35-203ENST00000469781 NAIPQ13075 1403 aa30.17■■■□□ 2.42
C1orf35-203ENST00000469781 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
C1orf35-203ENST00000469781 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
C1orf35-203ENST00000469781 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
C1orf35-203ENST00000469781 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.11■■■□□ 2.41
C1orf35-203ENST00000469781 TONSLQ96HA7 1378 aa30.08■■■□□ 2.41
C1orf35-203ENST00000469781 MIA2Q96PC5 1412 aa30.05■■■□□ 2.4
C1orf35-203ENST00000469781 ARID3CA6NKF2 412 aa30.05■■■□□ 2.4
C1orf35-203ENST00000469781 KIAA0556O60303 1618 aa30.04■■■□□ 2.4
C1orf35-203ENST00000469781 DISP1Q96F81 1524 aa30.02■■■□□ 2.4
C1orf35-203ENST00000469781 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.01■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 CEP170Q5SW79 1584 aa29.98■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 AKNAQ7Z591 1439 aa29.98■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.96■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
C1orf35-203ENST00000469781 NUP160Q12769 1436 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf35-203ENST00000469781 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
C1orf35-203ENST00000469781 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.91■■■□□ 2.38
C1orf35-203ENST00000469781 TRIM52Q96A61 297 aa29.88■■■□□ 2.37
C1orf35-203ENST00000469781 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
C1orf35-203ENST00000469781 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
C1orf35-203ENST00000469781 JPH4Q96JJ6 628 aa29.86■■■□□ 2.37
C1orf35-203ENST00000469781 KDM6BO15054 1643 aa29.81■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 DAPK1P53355 1430 aa29.8■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 CHD1O14646 1710 aa29.8■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 KCNH8Q96L42 1107 aa29.78■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 ROCK1Q13464 1354 aa29.78■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
C1orf35-203ENST00000469781 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms