RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469356.3

SREBF1-208, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene SREBF1, Length 1,323 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1-208ENST00000469356 GOLGA3Q08378 1498 aa37.51■■■■□ 3.59
SREBF1-208ENST00000469356 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.45■■■■□ 3.59
SREBF1-208ENST00000469356 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
SREBF1-208ENST00000469356 JPH4Q96JJ6 628 aa37.41■■■■□ 3.58
SREBF1-208ENST00000469356 IQGAP2Q13576 1575 aa37.41■■■■□ 3.58
SREBF1-208ENST00000469356 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.36■■■■□ 3.57
SREBF1-208ENST00000469356 SHROOM2Q13796 1616 aa37.34■■■■□ 3.57
SREBF1-208ENST00000469356 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
SREBF1-208ENST00000469356 ARHGEF11O15085 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
SREBF1-208ENST00000469356 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.22■■■■□ 3.55
SREBF1-208ENST00000469356 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.22■■■■□ 3.55
SREBF1-208ENST00000469356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.17■■■■□ 3.54
SREBF1-208ENST00000469356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.17■■■■□ 3.54
SREBF1-208ENST00000469356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.17■■■■□ 3.54
SREBF1-208ENST00000469356 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.14■■■■□ 3.54
SREBF1-208ENST00000469356 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.05■■■■□ 3.52
SREBF1-208ENST00000469356 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.05■■■■□ 3.52
SREBF1-208ENST00000469356 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
SREBF1-208ENST00000469356 DISP1Q96F81 1524 aa37.03■■■■□ 3.52
SREBF1-208ENST00000469356 KIAA0556O60303 1618 aa37.01■■■■□ 3.52
SREBF1-208ENST00000469356 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.98■■■■□ 3.51
SREBF1-208ENST00000469356 ARAP1Q96P48 1450 aa36.95■■■■□ 3.51
SREBF1-208ENST00000469356 SAMD9Q5K651 1589 aa36.95■■■■□ 3.51
SREBF1-208ENST00000469356 PTPRGP23470 1445 aa36.93■■■■□ 3.5
SREBF1-208ENST00000469356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.92■■■■□ 3.5
SREBF1-208ENST00000469356 P3H3Q8IVL6 736 aa36.88■■■■□ 3.49
SREBF1-208ENST00000469356 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
SREBF1-208ENST00000469356 CLIP1P30622 1438 aa36.83■■■■□ 3.49
SREBF1-208ENST00000469356 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
SREBF1-208ENST00000469356 CEP162Q5TB80 1403 aa36.77■■■■□ 3.48
SREBF1-208ENST00000469356 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.75■■■■□ 3.47
SREBF1-208ENST00000469356 UACAQ9BZF9 1416 aa36.68■■■■□ 3.46
SREBF1-208ENST00000469356 FMN1Q68DA7 1419 aa36.67■■■■□ 3.46
SREBF1-208ENST00000469356 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.61■■■■□ 3.45
SREBF1-208ENST00000469356 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
SREBF1-208ENST00000469356 ABCC2Q92887 1545 aa36.57■■■■□ 3.45
SREBF1-208ENST00000469356 ABCA8O94911 1581 aa36.57■■■■□ 3.44
SREBF1-208ENST00000469356 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.56■■■■□ 3.44
SREBF1-208ENST00000469356 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.53■■■■□ 3.44
SREBF1-208ENST00000469356 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.53■■■■□ 3.44
SREBF1-208ENST00000469356 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
SREBF1-208ENST00000469356 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.4■■■■□ 3.42
SREBF1-208ENST00000469356 HECW1Q76N89 1606 aa36.39■■■■□ 3.42
SREBF1-208ENST00000469356 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.38■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.33■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.32■■■■□ 3.41
SREBF1-208ENST00000469356 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
SREBF1-208ENST00000469356 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SREBF1-208ENST00000469356 ATP10BO94823 1461 aa36.27■■■■□ 3.4
SREBF1-208ENST00000469356 ARID3CA6NKF2 412 aa36.27■■■■□ 3.4
SREBF1-208ENST00000469356 MAPKBP1O60336 1514 aa36.26■■■■□ 3.4
SREBF1-208ENST00000469356 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.23■■■■□ 3.39
SREBF1-208ENST00000469356 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
SREBF1-208ENST00000469356 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
SREBF1-208ENST00000469356 ASXL2Q76L83 1435 aa36.18■■■■□ 3.38
SREBF1-208ENST00000469356 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.17■■■■□ 3.38
SREBF1-208ENST00000469356 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
SREBF1-208ENST00000469356 APLP2Q06481 763 aa36.11■■■■□ 3.37
SREBF1-208ENST00000469356 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.11■■■■□ 3.37
SREBF1-208ENST00000469356 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.07■■■■□ 3.37
SREBF1-208ENST00000469356 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SREBF1-208ENST00000469356 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.02■■■■□ 3.36
SREBF1-208ENST00000469356 KCNH8Q96L42 1107 aa36■■■■□ 3.35
SREBF1-208ENST00000469356 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.98■■■■□ 3.35
SREBF1-208ENST00000469356 MAP3K1Q13233 1512 aa35.96■■■■□ 3.35
SREBF1-208ENST00000469356 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 DIP2BQ9P265 1576 aa35.94■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.93■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 TIAM1Q13009 1591 aa35.93■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.92■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 GLI2P10070 1586 aa35.91■■■■□ 3.34
SREBF1-208ENST00000469356 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.88■■■■□ 3.33
SREBF1-208ENST00000469356 KIF14Q15058 1648 aa35.83■■■■□ 3.33
SREBF1-208ENST00000469356 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.83■■■■□ 3.33
SREBF1-208ENST00000469356 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.78■■■■□ 3.32
SREBF1-208ENST00000469356 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.78■■■■□ 3.32
SREBF1-208ENST00000469356 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.77■■■■□ 3.32
SREBF1-208ENST00000469356 CD109Q6YHK3 1445 aa35.75■■■■□ 3.31
SREBF1-208ENST00000469356 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.73■■■■□ 3.31
SREBF1-208ENST00000469356 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.31
SREBF1-208ENST00000469356 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
SREBF1-208ENST00000469356 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
SREBF1-208ENST00000469356 TSPOAP1O95153 1857 aa35.67■■■■□ 3.3
SREBF1-208ENST00000469356 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.64■■■■□ 3.3
SREBF1-208ENST00000469356 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.64■■■■□ 3.3
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SREBF1-208ENST00000469356 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.6■■■■□ 3.29
SREBF1-208ENST00000469356 NCOA2Q15596 1464 aa35.58■■■■□ 3.29
SREBF1-208ENST00000469356 PLCH2O75038 1416 aa35.58■■■■□ 3.29
SREBF1-208ENST00000469356 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.54■■■■□ 3.28
SREBF1-208ENST00000469356 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.53■■■■□ 3.28
SREBF1-208ENST00000469356 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.52■■■■□ 3.28
SREBF1-208ENST00000469356 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.51■■■■□ 3.28
SREBF1-208ENST00000469356 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
SREBF1-208ENST00000469356 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.5■■■■□ 3.27
SREBF1-208ENST00000469356 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.49■■■■□ 3.27
SREBF1-208ENST00000469356 PREX2Q70Z35 1606 aa35.49■■■■□ 3.27
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