RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM107B-211ENST00000468747 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
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FAM107B-211ENST00000468747 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.43■■■□□ 2.78
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FAM107B-211ENST00000468747 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.43■■■□□ 2.78
FAM107B-211ENST00000468747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.42■■■□□ 2.78
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FAM107B-211ENST00000468747 MAP3K1Q13233 1512 aa32.41■■■□□ 2.78
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FAM107B-211ENST00000468747 IFT140Q96RY7 1462 aa31.93■■■□□ 2.7
FAM107B-211ENST00000468747 WDR62O43379 1518 aa31.93■■■□□ 2.7
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FAM107B-211ENST00000468747 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.7■■■□□ 2.67
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FAM107B-211ENST00000468747 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.67■■■□□ 2.66
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.67■■■□□ 2.66
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FAM107B-211ENST00000468747 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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FAM107B-211ENST00000468747 CEP170Q5SW79 1584 aa31.42■■■□□ 2.62
FAM107B-211ENST00000468747 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
FAM107B-211ENST00000468747 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.41■■■□□ 2.62
FAM107B-211ENST00000468747 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
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FAM107B-211ENST00000468747 TONSLQ96HA7 1378 aa31.32■■■□□ 2.6
FAM107B-211ENST00000468747 JPH4Q96JJ6 628 aa31.31■■■□□ 2.6
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