RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451154.5

USP42-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 42, humanhuman

TSL 5

Gene USP42, Length 520 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP42-204ENST00000451154 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.15■■■■■ 5.14
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USP42-204ENST00000451154 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.7■■■■■ 5.07
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USP42-204ENST00000451154 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.55■■■■■ 4.88
USP42-204ENST00000451154 ARID3CA6NKF2 412 aa45.54■■■■■ 4.88
USP42-204ENST00000451154 EEA1Q15075 1411 aa45.53■■■■■ 4.88
USP42-204ENST00000451154 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
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USP42-204ENST00000451154 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
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USP42-204ENST00000451154 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.28■■■■■ 4.68
USP42-204ENST00000451154 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
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USP42-204ENST00000451154 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.24■■■■■ 4.67
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