RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449692.3

C11orf68-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C11orf68, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-202ENST00000449692 SHROOM2Q13796 1616 aa49.99■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 KIF21BO75037 1637 aa49.97■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.97■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.97■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.97■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 JPH4Q96JJ6 628 aa49.96■■■■■ 5.59
C11orf68-202ENST00000449692 IQGAP2Q13576 1575 aa49.87■■■■■ 5.57
C11orf68-202ENST00000449692 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.83■■■■■ 5.57
C11orf68-202ENST00000449692 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.8■■■■■ 5.56
C11orf68-202ENST00000449692 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
C11orf68-202ENST00000449692 GOLGA3Q08378 1498 aa49.72■■■■■ 5.55
C11orf68-202ENST00000449692 EHMT2Q96KQ7 1210 aa49.71■■■■■ 5.55
C11orf68-202ENST00000449692 ARAP1Q96P48 1450 aa49.68■■■■■ 5.54
C11orf68-202ENST00000449692 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.64■■■■■ 5.54
C11orf68-202ENST00000449692 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.57■■■■■ 5.53
C11orf68-202ENST00000449692 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.56■■■■■ 5.52
C11orf68-202ENST00000449692 DISP1Q96F81 1524 aa49.52■■■■■ 5.52
C11orf68-202ENST00000449692 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.51■■■■■ 5.52
C11orf68-202ENST00000449692 KIAA0556O60303 1618 aa49.4■■■■■ 5.5
C11orf68-202ENST00000449692 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.34■■■■■ 5.49
C11orf68-202ENST00000449692 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP49.3■■■■■ 5.48
C11orf68-202ENST00000449692 PTPRGP23470 1445 aa49.27■■■■■ 5.48
C11orf68-202ENST00000449692 SAMD9Q5K651 1589 aa49.25■■■■■ 5.48
C11orf68-202ENST00000449692 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.21■■■■■ 5.47
C11orf68-202ENST00000449692 P3H3Q8IVL6 736 aa49.18■■■■■ 5.46
C11orf68-202ENST00000449692 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.17■■■■■ 5.46
C11orf68-202ENST00000449692 EFCAB5A4FU69 1503 aa49.11■■■■■ 5.45
C11orf68-202ENST00000449692 FHOD3Q2V2M9 1422 aa49.01■■■■■ 5.44
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa49■■■■■ 5.43
C11orf68-202ENST00000449692 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.97■■■■■ 5.43
C11orf68-202ENST00000449692 UACAQ9BZF9 1416 aa48.96■■■■■ 5.43
C11orf68-202ENST00000449692 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.89■■■■■ 5.42
C11orf68-202ENST00000449692 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.88■■■■■ 5.42
C11orf68-202ENST00000449692 CLIP1P30622 1438 aa48.86■■■■■ 5.41
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC2Q92887 1545 aa48.85■■■■■ 5.41
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA8O94911 1581 aa48.84■■■■■ 5.41
C11orf68-202ENST00000449692 CEP162Q5TB80 1403 aa48.78■■■■■ 5.4
C11orf68-202ENST00000449692 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.73■■■■■ 5.39
C11orf68-202ENST00000449692 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.66■■■■■ 5.38
C11orf68-202ENST00000449692 FMN1Q68DA7 1419 aa48.66■■■■■ 5.38
C11orf68-202ENST00000449692 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.65■■■■■ 5.38
C11orf68-202ENST00000449692 MAPKBP1O60336 1514 aa48.54■■■■■ 5.36
C11orf68-202ENST00000449692 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
C11orf68-202ENST00000449692 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
C11orf68-202ENST00000449692 ARID3CA6NKF2 412 aa48.47■■■■■ 5.35
C11orf68-202ENST00000449692 ATP10BO94823 1461 aa48.47■■■■■ 5.35
C11orf68-202ENST00000449692 ASXL2Q76L83 1435 aa48.4■■■■■ 5.34
C11orf68-202ENST00000449692 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa48.36■■■■■ 5.33
C11orf68-202ENST00000449692 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
C11orf68-202ENST00000449692 HECW1Q76N89 1606 aa48.35■■■■■ 5.33
C11orf68-202ENST00000449692 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
C11orf68-202ENST00000449692 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.26■■■■■ 5.32
C11orf68-202ENST00000449692 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
C11orf68-202ENST00000449692 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
C11orf68-202ENST00000449692 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
C11orf68-202ENST00000449692 FYCO1Q9BQS8 1478 aa48.26■■■■■ 5.32
C11orf68-202ENST00000449692 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
C11orf68-202ENST00000449692 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.23■■■■■ 5.31
C11orf68-202ENST00000449692 DIP2BQ9P265 1576 aa48.19■■■■■ 5.31
C11orf68-202ENST00000449692 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa48.19■■■■■ 5.31
C11orf68-202ENST00000449692 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.17■■■■■ 5.3
C11orf68-202ENST00000449692 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.15■■■■■ 5.3
C11orf68-202ENST00000449692 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.15■■■■■ 5.3
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC18Q5T9S5 1454 aa48.07■■■■■ 5.29
C11orf68-202ENST00000449692 PLEKHD1A6NEE1 506 aa48.07■■■■■ 5.29
C11orf68-202ENST00000449692 KCNH8Q96L42 1107 aa48.05■■■■■ 5.28
C11orf68-202ENST00000449692 GLI2P10070 1586 aa48.03■■■■■ 5.28
C11orf68-202ENST00000449692 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
C11orf68-202ENST00000449692 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
C11orf68-202ENST00000449692 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.83■■■■■ 5.25
C11orf68-202ENST00000449692 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.83■■■■■ 5.25
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.78■■■■■ 5.24
C11orf68-202ENST00000449692 TSPOAP1O95153 1857 aa47.78■■■■■ 5.24
C11orf68-202ENST00000449692 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.77■■■■■ 5.24
C11orf68-202ENST00000449692 CD109Q6YHK3 1445 aa47.74■■■■■ 5.23
C11orf68-202ENST00000449692 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.72■■■■■ 5.235e-7■■□□□ 12.4
C11orf68-202ENST00000449692 TIAM1Q13009 1591 aa47.71■■■■■ 5.23
C11orf68-202ENST00000449692 KIF14Q15058 1648 aa47.69■■■■■ 5.23
C11orf68-202ENST00000449692 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.23
C11orf68-202ENST00000449692 MAP3K1Q13233 1512 aa47.65■■■■■ 5.22
C11orf68-202ENST00000449692 MTUS2Q5JR59 1369 aa47.65■■■■■ 5.22
C11orf68-202ENST00000449692 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.65■■■■■ 5.22
C11orf68-202ENST00000449692 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa47.57■■■■■ 5.21
C11orf68-202ENST00000449692 APLP2Q06481 763 aa47.54■■■■■ 5.2
C11orf68-202ENST00000449692 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.54■■■■■ 5.2
C11orf68-202ENST00000449692 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa47.52■■■■■ 5.2
C11orf68-202ENST00000449692 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
C11orf68-202ENST00000449692 PLCH2O75038 1416 aa47.44■■■■■ 5.19
C11orf68-202ENST00000449692 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.42■■■■■ 5.18
C11orf68-202ENST00000449692 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
C11orf68-202ENST00000449692 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.34■■■■■ 5.17
C11orf68-202ENST00000449692 FANCAO15360 1455 aa47.33■■■■■ 5.17
C11orf68-202ENST00000449692 NEO1Q92859 1461 aa47.32■■■■■ 5.17
C11orf68-202ENST00000449692 NCOA2Q15596 1464 aa47.32■■■■■ 5.17
C11orf68-202ENST00000449692 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.31■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 PREX2Q70Z35 1606 aa47.29■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.28■■■■■ 5.16
C11orf68-202ENST00000449692 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.28■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms