RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.57■■□□□ 1.84
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CLDN9-201ENST00000445369 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.53■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.52■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CLDN9-201ENST00000445369 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.45■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
CLDN9-201ENST00000445369 P3H3Q8IVL6 736 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN9-201ENST00000445369 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN9-201ENST00000445369 SAMD9Q5K651 1589 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN9-201ENST00000445369 FMN1Q68DA7 1419 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN9-201ENST00000445369 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.31■■□□□ 1.8
CLDN9-201ENST00000445369 PBRM1Q86U86 1689 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN9-201ENST00000445369 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.8
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CLDN9-201ENST00000445369 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN9-201ENST00000445369 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN9-201ENST00000445369 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CLDN9-201ENST00000445369 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.21■■□□□ 1.79
CLDN9-201ENST00000445369 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 MAPKBP1O60336 1514 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 GRIN2BQ13224 1484 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 ADAMTS12P58397 1594 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN9-201ENST00000445369 NEUROD1Q13562 356 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN9-201ENST00000445369 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
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CLDN9-201ENST00000445369 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN9-201ENST00000445369 IQGAP2Q13576 1575 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN9-201ENST00000445369 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN9-201ENST00000445369 WDR62O43379 1518 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN9-201ENST00000445369 MIER1Q8N108 512 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN9-201ENST00000445369 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN9-201ENST00000445369 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
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CLDN9-201ENST00000445369 NCOA2Q15596 1464 aa26■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 HECW1Q76N89 1606 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 ERCC6Q03468 1493 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 ARHGEF11O15085 1522 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.96■■□□□ 1.75
CLDN9-201ENST00000445369 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN9-201ENST00000445369 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CLDN9-201ENST00000445369 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.88■■□□□ 1.73
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CLDN9-201ENST00000445369 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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CLDN9-201ENST00000445369 KIAA0556O60303 1618 aa25.81■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.79■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
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CLDN9-201ENST00000445369 NAIPQ13075 1403 aa25.78■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 GRIN2AQ12879 1464 aa25.78■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 DISP1Q96F81 1524 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 UACAQ9BZF9 1416 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN9-201ENST00000445369 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN9-201ENST00000445369 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CLDN9-201ENST00000445369 MIA2Q96PC5 1412 aa25.7■■□□□ 1.7
CLDN9-201ENST00000445369 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.68■■□□□ 1.7
CLDN9-201ENST00000445369 AKNAQ7Z591 1439 aa25.67■■□□□ 1.7
CLDN9-201ENST00000445369 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CLDN9-201ENST00000445369 CEP170Q5SW79 1584 aa25.64■■□□□ 1.7
CLDN9-201ENST00000445369 SYNJ2O15056 1496 aa25.63■■□□□ 1.69
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CLDN9-201ENST00000445369 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CLDN9-201ENST00000445369 NUP160Q12769 1436 aa25.53■■□□□ 1.68
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CLDN9-201ENST00000445369 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.5■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.5■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 DAPK1P53355 1430 aa25.48■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.47■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 ROCK1Q13464 1354 aa25.46■■□□□ 1.67
CLDN9-201ENST00000445369 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.45■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.44■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 ABCC5O15440 1437 aa25.43■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.42■■□□□ 1.66
CLDN9-201ENST00000445369 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
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