RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, humanhuman

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6-209ENST00000444973 IGF1RP08069 1367 aa49.6■■■■■ 5.53
NEK6-209ENST00000444973 CUL7Q14999 1698 aa49.48■■■■■ 5.51
NEK6-209ENST00000444973 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.44■■■■■ 5.51
NEK6-209ENST00000444973 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.39■■■■■ 5.5
NEK6-209ENST00000444973 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.28■■■■■ 5.48
NEK6-209ENST00000444973 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.27■■■■■ 5.48
NEK6-209ENST00000444973 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.26■■■■■ 5.48
NEK6-209ENST00000444973 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
NEK6-209ENST00000444973 MAPKBP1O60336 1514 aa49.18■■■■■ 5.46
NEK6-209ENST00000444973 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.17■■■■■ 5.46
NEK6-209ENST00000444973 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.17■■■■■ 5.46
NEK6-209ENST00000444973 DIP2BQ9P265 1576 aa49.07■■■■■ 5.45
NEK6-209ENST00000444973 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
NEK6-209ENST00000444973 PTPRGP23470 1445 aa49.03■■■■■ 5.44
NEK6-209ENST00000444973 IQGAP2Q13576 1575 aa48.98■■■■■ 5.43
NEK6-209ENST00000444973 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.95■■■■■ 5.43
NEK6-209ENST00000444973 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.92■■■■■ 5.42
NEK6-209ENST00000444973 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.8■■■■■ 5.4
NEK6-209ENST00000444973 ABCC2Q92887 1545 aa48.78■■■■■ 5.4
NEK6-209ENST00000444973 DISP1Q96F81 1524 aa48.77■■■■■ 5.4
NEK6-209ENST00000444973 TSPOAP1O95153 1857 aa48.74■■■■■ 5.39
NEK6-209ENST00000444973 KDM6BO15054 1643 aa48.66■■■■■ 5.38
NEK6-209ENST00000444973 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.65■■■■■ 5.38
NEK6-209ENST00000444973 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.65■■■■■ 5.38
NEK6-209ENST00000444973 ASXL2Q76L83 1435 aa48.65■■■■■ 5.38
NEK6-209ENST00000444973 UACAQ9BZF9 1416 aa48.65■■■■■ 5.38
NEK6-209ENST00000444973 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.57■■■■■ 5.37
NEK6-209ENST00000444973 KIAA0556O60303 1618 aa48.55■■■■■ 5.36
NEK6-209ENST00000444973 GLI2P10070 1586 aa48.46■■■■■ 5.35
NEK6-209ENST00000444973 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.45■■■■■ 5.35
NEK6-209ENST00000444973 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.4■■■■■ 5.34
NEK6-209ENST00000444973 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
NEK6-209ENST00000444973 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
NEK6-209ENST00000444973 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
NEK6-209ENST00000444973 PRXQ9BXM0 1461 aa48.29■■■■■ 5.32
NEK6-209ENST00000444973 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.24■■■■■ 5.31
NEK6-209ENST00000444973 GOLGA3Q08378 1498 aa48.23■■■■■ 5.31
NEK6-209ENST00000444973 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.21■■■■■ 5.31
NEK6-209ENST00000444973 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.15■■■■■ 5.3
NEK6-209ENST00000444973 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
NEK6-209ENST00000444973 ABCA8O94911 1581 aa48.1■■■■■ 5.29
NEK6-209ENST00000444973 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.07■■■■■ 5.29
NEK6-209ENST00000444973 KCNH8Q96L42 1107 aa47.93■■■■■ 5.26
NEK6-209ENST00000444973 P3H3Q8IVL6 736 aa47.92■■■■■ 5.26
NEK6-209ENST00000444973 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.89■■■■■ 5.26
NEK6-209ENST00000444973 CD109Q6YHK3 1445 aa47.85■■■■■ 5.25
NEK6-209ENST00000444973 ADGRL1O94910 1474 aa47.84■■■■■ 5.25
NEK6-209ENST00000444973 ARID3CA6NKF2 412 aa47.84■■■■■ 5.25
NEK6-209ENST00000444973 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.82■■■■■ 5.25
NEK6-209ENST00000444973 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.8■■■■■ 5.24
NEK6-209ENST00000444973 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
NEK6-209ENST00000444973 SAMD9Q5K651 1589 aa47.72■■■■■ 5.23
NEK6-209ENST00000444973 ATP10BO94823 1461 aa47.72■■■■■ 5.23
NEK6-209ENST00000444973 EEA1Q15075 1411 aa47.62■■■■■ 5.21
NEK6-209ENST00000444973 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
NEK6-209ENST00000444973 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.56■■■■■ 5.2
NEK6-209ENST00000444973 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.47■■■■■ 5.19
NEK6-209ENST00000444973 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.45■■■■■ 5.19
NEK6-209ENST00000444973 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
NEK6-209ENST00000444973 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
NEK6-209ENST00000444973 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.42■■■■■ 5.18
NEK6-209ENST00000444973 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
NEK6-209ENST00000444973 KIF21BO75037 1637 aa47.34■■■■■ 5.17
NEK6-209ENST00000444973 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.26■■■■■ 5.16
NEK6-209ENST00000444973 NEO1Q92859 1461 aa47.21■■■■■ 5.15
NEK6-209ENST00000444973 HECW2Q9P2P5 1572 aa47.21■■■■■ 5.15
NEK6-209ENST00000444973 RAPGEF3O95398 923 aa47.21■■■■■ 5.15
NEK6-209ENST00000444973 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.2■■■■■ 5.15
NEK6-209ENST00000444973 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.14■■■■■ 5.14
NEK6-209ENST00000444973 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.14■■■■■ 5.14
NEK6-209ENST00000444973 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.09■■■■■ 5.13
NEK6-209ENST00000444973 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
NEK6-209ENST00000444973 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47■■■■■ 5.118e-6■■■■□ 23.7
NEK6-209ENST00000444973 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
NEK6-209ENST00000444973 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.95■■■■■ 5.11
NEK6-209ENST00000444973 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.95■■■■■ 5.11
NEK6-209ENST00000444973 FANCAO15360 1455 aa46.93■■■■■ 5.1
NEK6-209ENST00000444973 AKNAQ7Z591 1439 aa46.92■■■■■ 5.1
NEK6-209ENST00000444973 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.91■■■■■ 5.1
NEK6-209ENST00000444973 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
NEK6-209ENST00000444973 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.87■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.86■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 RICTORQ6R327 1708 aa46.85■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 PTPRMP28827 1452 aa46.85■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.83■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.83■■■■■ 5.09
NEK6-209ENST00000444973 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.81■■■■■ 5.08
NEK6-209ENST00000444973 FMN1Q68DA7 1419 aa46.79■■■■■ 5.08
NEK6-209ENST00000444973 HECW1Q76N89 1606 aa46.76■■■■■ 5.08
NEK6-209ENST00000444973 MADDQ8WXG6 1647 aa46.75■■■■■ 5.07
NEK6-209ENST00000444973 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.68■■■■■ 5.06
NEK6-209ENST00000444973 PLCH2O75038 1416 aa46.67■■■■■ 5.06
NEK6-209ENST00000444973 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.64■■■■■ 5.06
NEK6-209ENST00000444973 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.63■■■■■ 5.05
NEK6-209ENST00000444973 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.61■■■■■ 5.05
NEK6-209ENST00000444973 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
NEK6-209ENST00000444973 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.57■■■■■ 5.05
NEK6-209ENST00000444973 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms