RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
MUC1-211ENST00000438413 CUL7Q14999 1698 aa33.68■■■□□ 2.98
MUC1-211ENST00000438413 KIF27Q86VH2 1401 aa33.68■■■□□ 2.98
MUC1-211ENST00000438413 IGF1RP08069 1367 aa33.65■■■□□ 2.98
MUC1-211ENST00000438413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.63■■■□□ 2.97
MUC1-211ENST00000438413 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.59■■■□□ 2.97
MUC1-211ENST00000438413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.57■■■□□ 2.96
MUC1-211ENST00000438413 MAPKBP1O60336 1514 aa33.57■■■□□ 2.96
MUC1-211ENST00000438413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.55■■■□□ 2.96
MUC1-211ENST00000438413 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.5■■■□□ 2.95
MUC1-211ENST00000438413 DIP2BQ9P265 1576 aa33.5■■■□□ 2.95
MUC1-211ENST00000438413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.44■■■□□ 2.94
MUC1-211ENST00000438413 PTPRGP23470 1445 aa33.35■■■□□ 2.93
MUC1-211ENST00000438413 IQGAP2Q13576 1575 aa33.32■■■□□ 2.92
MUC1-211ENST00000438413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.31■■■□□ 2.92
MUC1-211ENST00000438413 TSPOAP1O95153 1857 aa33.29■■■□□ 2.92
MUC1-211ENST00000438413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
MUC1-211ENST00000438413 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.28■■■□□ 2.92
MUC1-211ENST00000438413 KDM6BO15054 1643 aa33.26■■■□□ 2.91
MUC1-211ENST00000438413 ABCC2Q92887 1545 aa33.22■■■□□ 2.91
MUC1-211ENST00000438413 DISP1Q96F81 1524 aa33.15■■■□□ 2.9
MUC1-211ENST00000438413 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.13■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.13■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 ASXL2Q76L83 1435 aa33.11■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.1■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 UACAQ9BZF9 1416 aa33.1■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.08■■■□□ 2.89
MUC1-211ENST00000438413 GLI2P10070 1586 aa33.07■■■□□ 2.88
MUC1-211ENST00000438413 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
MUC1-211ENST00000438413 KIAA0556O60303 1618 aa33.03■■■□□ 2.88
MUC1-211ENST00000438413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.99■■■□□ 2.87
MUC1-211ENST00000438413 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
MUC1-211ENST00000438413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.96■■■□□ 2.87
MUC1-211ENST00000438413 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.94■■■□□ 2.86
MUC1-211ENST00000438413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
MUC1-211ENST00000438413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.91■■■□□ 2.86
MUC1-211ENST00000438413 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.8■■■□□ 2.84
MUC1-211ENST00000438413 GOLGA3Q08378 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
MUC1-211ENST00000438413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.78■■■□□ 2.84
MUC1-211ENST00000438413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
MUC1-211ENST00000438413 PRXQ9BXM0 1461 aa32.74■■■□□ 2.83
MUC1-211ENST00000438413 ABCA8O94911 1581 aa32.72■■■□□ 2.83
MUC1-211ENST00000438413 ADGRL1O94910 1474 aa32.68■■■□□ 2.82
MUC1-211ENST00000438413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.65■■■□□ 2.82
MUC1-211ENST00000438413 CD109Q6YHK3 1445 aa32.58■■■□□ 2.81
MUC1-211ENST00000438413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.57■■■□□ 2.8
MUC1-211ENST00000438413 KCNH8Q96L42 1107 aa32.57■■■□□ 2.8
MUC1-211ENST00000438413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
MUC1-211ENST00000438413 P3H3Q8IVL6 736 aa32.46■■■□□ 2.79
MUC1-211ENST00000438413 SAMD9Q5K651 1589 aa32.44■■■□□ 2.78
MUC1-211ENST00000438413 ATP10BO94823 1461 aa32.42■■■□□ 2.78
MUC1-211ENST00000438413 ARID3CA6NKF2 412 aa32.42■■■□□ 2.78
MUC1-211ENST00000438413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.41■■■□□ 2.78
MUC1-211ENST00000438413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.36■■■□□ 2.77
MUC1-211ENST00000438413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.34■■■□□ 2.77
MUC1-211ENST00000438413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.33■■■□□ 2.77
MUC1-211ENST00000438413 KIF21BO75037 1637 aa32.32■■■□□ 2.76
MUC1-211ENST00000438413 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.31■■■□□ 2.76
MUC1-211ENST00000438413 EEA1Q15075 1411 aa32.26■■■□□ 2.76
MUC1-211ENST00000438413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.21■■■□□ 2.75
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MUC1-211ENST00000438413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
MUC1-211ENST00000438413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
MUC1-211ENST00000438413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.17■■■□□ 2.74
MUC1-211ENST00000438413 NEO1Q92859 1461 aa32.16■■■□□ 2.74
MUC1-211ENST00000438413 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
MUC1-211ENST00000438413 RAPGEF3O95398 923 aa32.1■■■□□ 2.73
MUC1-211ENST00000438413 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.08■■■□□ 2.73
MUC1-211ENST00000438413 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.06■■■□□ 2.72
MUC1-211ENST00000438413 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.05■■■□□ 2.72
MUC1-211ENST00000438413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.01■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.97■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 PTPRMP28827 1452 aa31.97■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.97■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 RICTORQ6R327 1708 aa31.96■■■□□ 2.71
MUC1-211ENST00000438413 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.94■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 FANCAO15360 1455 aa31.93■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.93■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 AKNAQ7Z591 1439 aa31.92■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 MADDQ8WXG6 1647 aa31.91■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
MUC1-211ENST00000438413 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.82■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.79■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 HECW1Q76N89 1606 aa31.78■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 FMN1Q68DA7 1419 aa31.76■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.76■■■□□ 2.68
MUC1-211ENST00000438413 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 PLCH2O75038 1416 aa31.74■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.73■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.73■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.73■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.72■■■□□ 2.67
MUC1-211ENST00000438413 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.71■■■□□ 2.67
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