RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438357.1

RPS6KA3-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA3, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-202ENST00000438357 KIF27Q86VH2 1401 aa25.95■■□□□ 1.74
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RPS6KA3-202ENST00000438357 CUL7Q14999 1698 aa25.85■■□□□ 1.73
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RPS6KA3-202ENST00000438357 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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RPS6KA3-202ENST00000438357 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RPS6KA3-202ENST00000438357 CD109Q6YHK3 1445 aa24.95■■□□□ 1.58
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RPS6KA3-202ENST00000438357 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.91■■□□□ 1.58
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RPS6KA3-202ENST00000438357 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS6KA3-202ENST00000438357 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.69■■□□□ 1.54
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RPS6KA3-202ENST00000438357 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
RPS6KA3-202ENST00000438357 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.64■■□□□ 1.54
RPS6KA3-202ENST00000438357 NEO1Q92859 1461 aa24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA3-202ENST00000438357 RAPGEF3O95398 923 aa24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3-202ENST00000438357 FMN1Q68DA7 1419 aa24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA3-202ENST00000438357 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.512e-6■■□□□ 11.9
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RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.49■■□□□ 1.51
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RPS6KA3-202ENST00000438357 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA3-202ENST00000438357 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
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RPS6KA3-202ENST00000438357 HECW1Q76N89 1606 aa24.45■■□□□ 1.5
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RPS6KA3-202ENST00000438357 RICTORQ6R327 1708 aa24.38■■□□□ 1.49
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RPS6KA3-202ENST00000438357 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.36■■□□□ 1.49
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RPS6KA3-202ENST00000438357 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.32■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.31■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 CLIP1P30622 1438 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 KIF14Q15058 1648 aa24.29■■□□□ 1.48
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.29■■□□□ 1.48
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