RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IQGAP2Q13576 1575 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SHROOM2Q13796 1616 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-211ENST00000430853 JPH4Q96JJ6 628 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.33■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.29■■□□□ 1
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.27■■□□□ 1
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARHGEF11O15085 1522 aa21.26■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DISP1Q96F81 1524 aa21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SAMD9Q5K651 1589 aa21.23■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIAA0556O60303 1618 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.19■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLIP1P30622 1438 aa21.13■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CEP162Q5TB80 1403 aa21.12■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.12■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PTPRGP23470 1445 aa21.11■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARAP1Q96P48 1450 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.09■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-211ENST00000430853 P3H3Q8IVL6 736 aa21.07■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.05■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FMN1Q68DA7 1419 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UACAQ9BZF9 1416 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCA8O94911 1581 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCC2Q92887 1545 aa20.94■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.94■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.94■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.93■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.88■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.87■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.87■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HECW1Q76N89 1606 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.85■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ATP10BO94823 1461 aa20.79■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.78■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAPKBP1O60336 1514 aa20.76■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.74■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAP3K1Q13233 1512 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ASXL2Q76L83 1435 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARID3CA6NKF2 412 aa20.68■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.67■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 APLP2Q06481 763 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TIAM1Q13009 1591 aa20.64■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.59■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.57■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GLI2P10070 1586 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DIP2BQ9P265 1576 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KCNH8Q96L42 1107 aa20.54■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIF14Q15058 1648 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.5■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.5■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CD109Q6YHK3 1445 aa20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NCOA2Q15596 1464 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PLCH2O75038 1416 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PREX2Q70Z35 1606 aa20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TSPOAP1O95153 1857 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 328.4 ms