RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428824.4

POU5F1P3-201, Transcript of POU class 5 homeobox 1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene POU5F1P3, Length 1,078 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1P3-201ENST00000428824 IGF1RP08069 1367 aa35.36■■■■□ 3.25
POU5F1P3-201ENST00000428824 CUL7Q14999 1698 aa35.33■■■■□ 3.25
POU5F1P3-201ENST00000428824 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.28■■■■□ 3.24
POU5F1P3-201ENST00000428824 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.26■■■■□ 3.24
POU5F1P3-201ENST00000428824 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
POU5F1P3-201ENST00000428824 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.14■■■■□ 3.22
POU5F1P3-201ENST00000428824 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAPKBP1O60336 1514 aa35.13■■■■□ 3.21
POU5F1P3-201ENST00000428824 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.13■■■■□ 3.21
POU5F1P3-201ENST00000428824 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.1■■■■□ 3.21
POU5F1P3-201ENST00000428824 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.05■■■■□ 3.2
POU5F1P3-201ENST00000428824 DIP2BQ9P265 1576 aa35.01■■■■□ 3.2
POU5F1P3-201ENST00000428824 PTPRGP23470 1445 aa34.97■■■■□ 3.19
POU5F1P3-201ENST00000428824 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.94■■■■□ 3.18
POU5F1P3-201ENST00000428824 IQGAP2Q13576 1575 aa34.93■■■■□ 3.18
POU5F1P3-201ENST00000428824 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.9■■■■□ 3.18
POU5F1P3-201ENST00000428824 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
POU5F1P3-201ENST00000428824 ABCC2Q92887 1545 aa34.81■■■■□ 3.16
POU5F1P3-201ENST00000428824 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.8■■■■□ 3.16
POU5F1P3-201ENST00000428824 DISP1Q96F81 1524 aa34.77■■■■□ 3.16
POU5F1P3-201ENST00000428824 TSPOAP1O95153 1857 aa34.75■■■■□ 3.15
POU5F1P3-201ENST00000428824 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
POU5F1P3-201ENST00000428824 KDM6BO15054 1643 aa34.73■■■■□ 3.15
POU5F1P3-201ENST00000428824 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.71■■■■□ 3.15
POU5F1P3-201ENST00000428824 UACAQ9BZF9 1416 aa34.71■■■■□ 3.15
POU5F1P3-201ENST00000428824 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.68■■■■□ 3.14
POU5F1P3-201ENST00000428824 ASXL2Q76L83 1435 aa34.68■■■■□ 3.14
POU5F1P3-201ENST00000428824 KIAA0556O60303 1618 aa34.62■■■■□ 3.13
POU5F1P3-201ENST00000428824 GLI2P10070 1586 aa34.62■■■■□ 3.13
POU5F1P3-201ENST00000428824 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.58■■■■□ 3.13
POU5F1P3-201ENST00000428824 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.54■■■■□ 3.12
POU5F1P3-201ENST00000428824 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
POU5F1P3-201ENST00000428824 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
POU5F1P3-201ENST00000428824 GOLGA3Q08378 1498 aa34.43■■■■□ 3.1
POU5F1P3-201ENST00000428824 PRXQ9BXM0 1461 aa34.43■■■■□ 3.1
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.42■■■■□ 3.1
POU5F1P3-201ENST00000428824 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.39■■■■□ 3.1
POU5F1P3-201ENST00000428824 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.33■■■■□ 3.09
POU5F1P3-201ENST00000428824 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.33■■■■□ 3.09
POU5F1P3-201ENST00000428824 ABCA8O94911 1581 aa34.32■■■■□ 3.08
POU5F1P3-201ENST00000428824 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
POU5F1P3-201ENST00000428824 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.15■■■■□ 3.06
POU5F1P3-201ENST00000428824 CD109Q6YHK3 1445 aa34.13■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.13■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 ADGRL1O94910 1474 aa34.13■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.12■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 KCNH8Q96L42 1107 aa34.12■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
POU5F1P3-201ENST00000428824 P3H3Q8IVL6 736 aa34.06■■■■□ 3.04
POU5F1P3-201ENST00000428824 SAMD9Q5K651 1589 aa34.03■■■■□ 3.04
POU5F1P3-201ENST00000428824 ATP10BO94823 1461 aa34.01■■■■□ 3.04
POU5F1P3-201ENST00000428824 EEA1Q15075 1411 aa33.99■■■■□ 3.03
POU5F1P3-201ENST00000428824 ARID3CA6NKF2 412 aa33.98■■■■□ 3.03
POU5F1P3-201ENST00000428824 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.92■■■■□ 3.02
POU5F1P3-201ENST00000428824 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.88■■■■□ 3.01
POU5F1P3-201ENST00000428824 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.86■■■■□ 3.01
POU5F1P3-201ENST00000428824 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.79■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.78■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
POU5F1P3-201ENST00000428824 KIF21BO75037 1637 aa33.75■■■□□ 2.99
POU5F1P3-201ENST00000428824 NEO1Q92859 1461 aa33.71■■■□□ 2.99
POU5F1P3-201ENST00000428824 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.69■■■□□ 2.98
POU5F1P3-201ENST00000428824 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.69■■■□□ 2.98
POU5F1P3-201ENST00000428824 RAPGEF3O95398 923 aa33.63■■■□□ 2.97
POU5F1P3-201ENST00000428824 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.61■■■□□ 2.97
POU5F1P3-201ENST00000428824 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.57■■■□□ 2.96
POU5F1P3-201ENST00000428824 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.5■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.47■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 AKNAQ7Z591 1439 aa33.46■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 FANCAO15360 1455 aa33.46■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.45■■■□□ 2.95
POU5F1P3-201ENST00000428824 RICTORQ6R327 1708 aa33.45■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 PTPRMP28827 1452 aa33.43■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.42■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.42■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.39■■■□□ 2.94
POU5F1P3-201ENST00000428824 FMN1Q68DA7 1419 aa33.38■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.38■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.36■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 HECW1Q76N89 1606 aa33.35■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.33■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 MADDQ8WXG6 1647 aa33.33■■■□□ 2.93
POU5F1P3-201ENST00000428824 PLCH2O75038 1416 aa33.29■■■□□ 2.92
POU5F1P3-201ENST00000428824 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
POU5F1P3-201ENST00000428824 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.26■■■□□ 2.91
POU5F1P3-201ENST00000428824 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.25■■■□□ 2.91
POU5F1P3-201ENST00000428824 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
POU5F1P3-201ENST00000428824 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.22■■■□□ 2.91
POU5F1P3-201ENST00000428824 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.22■■■□□ 2.91
POU5F1P3-201ENST00000428824 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms