RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427389.5

JOSD1-204, Transcript of Josephin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene JOSD1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1-204ENST00000427389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.77■■■■■ 4.44
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JOSD1-204ENST00000427389 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
JOSD1-204ENST00000427389 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.43■■■■■ 4.38
JOSD1-204ENST00000427389 IQGAP2Q13576 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
JOSD1-204ENST00000427389 PRXQ9BXM0 1461 aa42.21■■■■■ 4.35
JOSD1-204ENST00000427389 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.16■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 PTPRGP23470 1445 aa42.14■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.14■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 DISP1Q96F81 1524 aa42.13■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.12■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.1■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.04■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.97■■■■■ 4.31
JOSD1-204ENST00000427389 MAPKBP1O60336 1514 aa41.95■■■■■ 4.31
JOSD1-204ENST00000427389 KIAA0556O60303 1618 aa41.92■■■■■ 4.3
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JOSD1-204ENST00000427389 EEA1Q15075 1411 aa41.9■■■■■ 4.3
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JOSD1-204ENST00000427389 ABCC2Q92887 1545 aa41.82■■■■■ 4.29
JOSD1-204ENST00000427389 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.8■■■■■ 4.28
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JOSD1-204ENST00000427389 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.65■■■■■ 4.26
JOSD1-204ENST00000427389 ASXL2Q76L83 1435 aa41.63■■■■■ 4.26
JOSD1-204ENST00000427389 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.62■■■■■ 4.25
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JOSD1-204ENST00000427389 KIF21BO75037 1637 aa41.52■■■■■ 4.24
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JOSD1-204ENST00000427389 GLI2P10070 1586 aa41.42■■■■■ 4.22
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JOSD1-204ENST00000427389 ATP10BO94823 1461 aa41.23■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 ARID3CA6NKF2 412 aa41.21■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.2■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 KDM6BO15054 1643 aa41.16■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.16■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.15■■■■■ 4.18
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JOSD1-204ENST00000427389 CD109Q6YHK3 1445 aa41■■■■■ 4.15
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JOSD1-204ENST00000427389 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.96■■■■■ 4.15
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JOSD1-204ENST00000427389 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
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JOSD1-204ENST00000427389 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.62■■■■■ 4.09
JOSD1-204ENST00000427389 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.086e-6■■■■□ 21.5
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JOSD1-204ENST00000427389 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.21■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 RICTORQ6R327 1708 aa40.19■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.17■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.15■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.12■■■■■ 4.01
JOSD1-204ENST00000427389 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.06■■■■■ 4
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