RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421383.1

LBR-203, Transcript of lamin B receptor, humanhuman

TSL 3

Gene LBR, Length 736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBR-203ENST00000421383 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
LBR-203ENST00000421383 SHROOM2Q13796 1616 aa42.56■■■■■ 4.4
LBR-203ENST00000421383 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.51■■■■■ 4.39
LBR-203ENST00000421383 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.46■■■■■ 4.39
LBR-203ENST00000421383 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.3■■■■■ 4.36
LBR-203ENST00000421383 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
LBR-203ENST00000421383 IQGAP2Q13576 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
LBR-203ENST00000421383 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
LBR-203ENST00000421383 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.1■■■■■ 4.33
LBR-203ENST00000421383 PTPRGP23470 1445 aa42.04■■■■■ 4.32
LBR-203ENST00000421383 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.03■■■■■ 4.32
LBR-203ENST00000421383 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.99■■■■■ 4.31
LBR-203ENST00000421383 PRXQ9BXM0 1461 aa41.98■■■■■ 4.31
LBR-203ENST00000421383 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
LBR-203ENST00000421383 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.88■■■■■ 4.29
LBR-203ENST00000421383 DISP1Q96F81 1524 aa41.86■■■■■ 4.29
LBR-203ENST00000421383 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.85■■■■■ 4.29
LBR-203ENST00000421383 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.85■■■■■ 4.29
LBR-203ENST00000421383 EEA1Q15075 1411 aa41.82■■■■■ 4.29
LBR-203ENST00000421383 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.77■■■■■ 4.28
LBR-203ENST00000421383 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.73■■■■■ 4.27
LBR-203ENST00000421383 KIAA0556O60303 1618 aa41.69■■■■■ 4.26
LBR-203ENST00000421383 UACAQ9BZF9 1416 aa41.69■■■■■ 4.26
LBR-203ENST00000421383 GOLGA3Q08378 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
LBR-203ENST00000421383 MAPKBP1O60336 1514 aa41.65■■■■■ 4.26
LBR-203ENST00000421383 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.6■■■■■ 4.25
LBR-203ENST00000421383 ABCC2Q92887 1545 aa41.6■■■■■ 4.25
LBR-203ENST00000421383 P3H3Q8IVL6 736 aa41.6■■■■■ 4.25
LBR-203ENST00000421383 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.58■■■■■ 4.25
LBR-203ENST00000421383 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
LBR-203ENST00000421383 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.55■■■■■ 4.24
LBR-203ENST00000421383 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.53■■■■■ 4.24
LBR-203ENST00000421383 ASXL2Q76L83 1435 aa41.45■■■■■ 4.23
LBR-203ENST00000421383 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.44■■■■■ 4.22
LBR-203ENST00000421383 DIP2BQ9P265 1576 aa41.44■■■■■ 4.22
LBR-203ENST00000421383 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.39■■■■■ 4.22
LBR-203ENST00000421383 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
LBR-203ENST00000421383 KIF21BO75037 1637 aa41.34■■■■■ 4.21
LBR-203ENST00000421383 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
LBR-203ENST00000421383 ARID3CA6NKF2 412 aa41.28■■■■■ 4.2
LBR-203ENST00000421383 ABCA8O94911 1581 aa41.28■■■■■ 4.2
LBR-203ENST00000421383 TSPOAP1O95153 1857 aa41.23■■■■■ 4.19
LBR-203ENST00000421383 SAMD9Q5K651 1589 aa41.21■■■■■ 4.19
LBR-203ENST00000421383 KCNH8Q96L42 1107 aa41.18■■■■■ 4.18
LBR-203ENST00000421383 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
LBR-203ENST00000421383 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.14■■■■■ 4.18
LBR-203ENST00000421383 GLI2P10070 1586 aa41.12■■■■■ 4.17
LBR-203ENST00000421383 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.11■■■■■ 4.17
LBR-203ENST00000421383 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
LBR-203ENST00000421383 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
LBR-203ENST00000421383 ATP10BO94823 1461 aa41.04■■■■■ 4.16
LBR-203ENST00000421383 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.99■■■■■ 4.15
LBR-203ENST00000421383 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.99■■■■■ 4.15
LBR-203ENST00000421383 KDM6BO15054 1643 aa40.97■■■■■ 4.15
LBR-203ENST00000421383 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.9■■■■■ 4.14
LBR-203ENST00000421383 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
LBR-203ENST00000421383 CD109Q6YHK3 1445 aa40.88■■■■■ 4.13
LBR-203ENST00000421383 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
LBR-203ENST00000421383 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
LBR-203ENST00000421383 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.86■■■■■ 4.13
LBR-203ENST00000421383 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
LBR-203ENST00000421383 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.8■■■■■ 4.12
LBR-203ENST00000421383 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.79■■■■■ 4.12
LBR-203ENST00000421383 FMN1Q68DA7 1419 aa40.73■■■■■ 4.11
LBR-203ENST00000421383 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.72■■■■■ 4.11
LBR-203ENST00000421383 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.7■■■■■ 4.11
LBR-203ENST00000421383 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
LBR-203ENST00000421383 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
LBR-203ENST00000421383 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.56■■■■■ 4.08
LBR-203ENST00000421383 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
LBR-203ENST00000421383 HECW1Q76N89 1606 aa40.49■■■■■ 4.07
LBR-203ENST00000421383 CLIP1P30622 1438 aa40.48■■■■■ 4.07
LBR-203ENST00000421383 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.42■■■■■ 4.06
LBR-203ENST00000421383 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.38■■■■■ 4.05
LBR-203ENST00000421383 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.37■■■■■ 4.05
LBR-203ENST00000421383 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.056e-7■■■■■ 38.2
LBR-203ENST00000421383 RAPGEF3O95398 923 aa40.35■■■■■ 4.05
LBR-203ENST00000421383 NEO1Q92859 1461 aa40.34■■■■■ 4.05
LBR-203ENST00000421383 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.33■■■■■ 4.05
LBR-203ENST00000421383 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.29■■■■■ 4.04
LBR-203ENST00000421383 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
LBR-203ENST00000421383 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.26■■■■■ 4.04
LBR-203ENST00000421383 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
LBR-203ENST00000421383 FANCAO15360 1455 aa40.24■■■■■ 4.03
LBR-203ENST00000421383 AKNAQ7Z591 1439 aa40.23■■■■■ 4.03
LBR-203ENST00000421383 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.19■■■■■ 4.03
LBR-203ENST00000421383 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 PLCH2O75038 1416 aa40.17■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.17■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 CEP162Q5TB80 1403 aa40.16■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.14■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 ADGRL1O94910 1474 aa40.13■■■■■ 4.02
LBR-203ENST00000421383 KIF14Q15058 1648 aa40.12■■■■■ 4.01
LBR-203ENST00000421383 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
LBR-203ENST00000421383 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.02■■■■■ 4
LBR-203ENST00000421383 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.01■■■■■ 4
LBR-203ENST00000421383 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40■■■■□ 3.99
LBR-203ENST00000421383 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
LBR-203ENST00000421383 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.97■■■■□ 3.99
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