RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 PRDM2Q13029 1718 aa30.57■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.56■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 MIER1Q8N108 512 aa30.55■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SPRN-201ENST00000414069 ARID3CA6NKF2 412 aa30.49■■■□□ 2.47
SPRN-201ENST00000414069 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.42■■■□□ 2.46
SPRN-201ENST00000414069 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
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SPRN-201ENST00000414069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.35■■■□□ 2.45
SPRN-201ENST00000414069 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.33■■■□□ 2.45
SPRN-201ENST00000414069 TIAM1Q13009 1591 aa30.3■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.3■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.29■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SPRN-201ENST00000414069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.26■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.24■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.21■■■□□ 2.43
SPRN-201ENST00000414069 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.14■■■□□ 2.42
SPRN-201ENST00000414069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.09■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.08■■■□□ 2.41
SPRN-201ENST00000414069 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.07■■■□□ 2.4
SPRN-201ENST00000414069 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.02■■■□□ 2.4
SPRN-201ENST00000414069 FBLN2P98095 1184 aa30■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 CUL7Q14999 1698 aa29.99■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 FMN1Q68DA7 1419 aa29.98■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.97■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.95■■■□□ 2.39
SPRN-201ENST00000414069 MAP3K1Q13233 1512 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 MAPKBP1O60336 1514 aa29.93■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.91■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.91■■■□□ 2.38
SPRN-201ENST00000414069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 KCNH8Q96L42 1107 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.87■■■□□ 2.37
SPRN-201ENST00000414069 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
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SPRN-201ENST00000414069 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.82■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 TRIM52Q96A61 297 aa29.8■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 NCOA2Q15596 1464 aa29.79■■■□□ 2.36
SPRN-201ENST00000414069 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.73■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 FOXD1Q16676 465 aa29.71■■■□□ 2.35
SPRN-201ENST00000414069 GRIN2BQ13224 1484 aa29.7■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.7■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 ERCC6Q03468 1493 aa29.69■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 SAMD9Q5K651 1589 aa29.67■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
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SPRN-201ENST00000414069 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.66■■■□□ 2.34
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SPRN-201ENST00000414069 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SPRN-201ENST00000414069 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 PBRM1Q86U86 1689 aa29.6■■■□□ 2.33
SPRN-201ENST00000414069 IQGAP2Q13576 1575 aa29.59■■■□□ 2.33
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SPRN-201ENST00000414069 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.52■■■□□ 2.32
SPRN-201ENST00000414069 HFM1A2PYH4 1435 aa29.5■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
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SPRN-201ENST00000414069 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.46■■■□□ 2.31
SPRN-201ENST00000414069 UACAQ9BZF9 1416 aa29.44■■■□□ 2.3
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SPRN-201ENST00000414069 GRIN2AQ12879 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 DISP1Q96F81 1524 aa29.35■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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SPRN-201ENST00000414069 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.34■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 WDR62O43379 1518 aa29.33■■■□□ 2.29
SPRN-201ENST00000414069 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 BCANQ96GW7 911 aa29.3■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.3■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SPRN-201ENST00000414069 ANP32CO43423 234 aa29.28■■■□□ 2.28
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