RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 DIP2BQ9P265 1576 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRC-206ENST00000413409 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
PTPRC-206ENST00000413409 MAPKBP1O60336 1514 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRC-206ENST00000413409 KDM6BO15054 1643 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRC-206ENST00000413409 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
PTPRC-206ENST00000413409 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRC-206ENST00000413409 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRC-206ENST00000413409 TSPOAP1O95153 1857 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRC-206ENST00000413409 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRC-206ENST00000413409 TOP2BQ02880 1626 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRC-206ENST00000413409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRC-206ENST00000413409 ADGRL1O94910 1474 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRC-206ENST00000413409 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRC-206ENST00000413409 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.76■■■□□ 2.19
PTPRC-206ENST00000413409 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRC-206ENST00000413409 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRC-206ENST00000413409 PTPRGP23470 1445 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRC-206ENST00000413409 ASXL2Q76L83 1435 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRC-206ENST00000413409 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PTPRC-206ENST00000413409 GLI2P10070 1586 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRC-206ENST00000413409 ABCC2Q92887 1545 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRC-206ENST00000413409 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.58■■■□□ 2.17
PTPRC-206ENST00000413409 IGF1RP08069 1367 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRC-206ENST00000413409 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRC-206ENST00000413409 FBXO41Q8TF61 875 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRC-206ENST00000413409 CUL7Q14999 1698 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRC-206ENST00000413409 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PTPRC-206ENST00000413409 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.45■■■□□ 2.14
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PTPRC-206ENST00000413409 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRC-206ENST00000413409 UACAQ9BZF9 1416 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRC-206ENST00000413409 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.37■■■□□ 2.13
PTPRC-206ENST00000413409 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRC-206ENST00000413409 KIF27Q86VH2 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRC-206ENST00000413409 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRC-206ENST00000413409 DISP1Q96F81 1524 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRC-206ENST00000413409 IQGAP2Q13576 1575 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRC-206ENST00000413409 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRC-206ENST00000413409 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.16■■■□□ 2.1
PTPRC-206ENST00000413409 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.13■■■□□ 2.09
PTPRC-206ENST00000413409 KIF21BO75037 1637 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRC-206ENST00000413409 CD109Q6YHK3 1445 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRC-206ENST00000413409 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRC-206ENST00000413409 KCNH8Q96L42 1107 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRC-206ENST00000413409 PTPRMP28827 1452 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA0556O60303 1618 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRC-206ENST00000413409 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRC-206ENST00000413409 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.98■■■□□ 2.07
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.97■■■□□ 2.07
PTPRC-206ENST00000413409 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.94■■■□□ 2.06
PTPRC-206ENST00000413409 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PTPRC-206ENST00000413409 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRC-206ENST00000413409 ABCA8O94911 1581 aa27.87■■■□□ 2.05
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PTPRC-206ENST00000413409 RAPGEF3O95398 923 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRC-206ENST00000413409 MADDQ8WXG6 1647 aa27.79■■■□□ 2.04
PTPRC-206ENST00000413409 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.79■■■□□ 2.04
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA2P54652 639 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRC-206ENST00000413409 CERKQ8TCT0 537 aa27.75■■■□□ 2.03
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PTPRC-206ENST00000413409 SOCS7O14512 581 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRC-206ENST00000413409 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA3Q08378 1498 aa27.7■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 ATP10BO94823 1461 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.66■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PTPRC-206ENST00000413409 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.64■■■□□ 2.01
PTPRC-206ENST00000413409 NEO1Q92859 1461 aa27.62■■■□□ 2.01
PTPRC-206ENST00000413409 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRC-206ENST00000413409 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.56■■■□□ 2
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PTPRC-206ENST00000413409 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.52■■■□□ 2
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PTPRC-206ENST00000413409 RICTORQ6R327 1708 aa27.43■■□□□ 1.98
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PTPRC-206ENST00000413409 MLECQ14165 292 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRC-206ENST00000413409 FANCAO15360 1455 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRC-206ENST00000413409 PRXQ9BXM0 1461 aa27.39■■□□□ 1.98
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PTPRC-206ENST00000413409 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
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PTPRC-206ENST00000413409 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.34■■□□□ 1.97
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PTPRC-206ENST00000413409 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRC-206ENST00000413409 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 STRCQ7RTU9 1775 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRC-206ENST00000413409 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.26■■□□□ 1.95
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