RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408888.7

RBM34-201, Transcript of RNA binding motif protein 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RBM34, Length 2,054 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM34-201ENST00000408888 MAP3K1Q13233 1512 aa29.92■■■□□ 2.38
RBM34-201ENST00000408888 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.91■■■□□ 2.38
RBM34-201ENST00000408888 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.88■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 BCL11AQ9H165 835 aa29.87■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 WDR62O43379 1518 aa29.86■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.83■■■□□ 2.37
RBM34-201ENST00000408888 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
RBM34-201ENST00000408888 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.79■■■□□ 2.36
RBM34-201ENST00000408888 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
RBM34-201ENST00000408888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
RBM34-201ENST00000408888 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
RBM34-201ENST00000408888 WDR97A6NE52 1622 aa29.72■■■□□ 2.35
RBM34-201ENST00000408888 IGF1RP08069 1367 aa29.7■■■□□ 2.34
RBM34-201ENST00000408888 TIAM1Q13009 1591 aa29.69■■■□□ 2.34
RBM34-201ENST00000408888 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.337e-7■■■■□ 26.3
RBM34-201ENST00000408888 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
RBM34-201ENST00000408888 IFT140Q96RY7 1462 aa29.6■■■□□ 2.33
RBM34-201ENST00000408888 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.58■■■□□ 2.33
RBM34-201ENST00000408888 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.58■■■□□ 2.33
RBM34-201ENST00000408888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.57■■■□□ 2.32
RBM34-201ENST00000408888 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.57■■■□□ 2.32
RBM34-201ENST00000408888 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
RBM34-201ENST00000408888 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.55■■■□□ 2.32
RBM34-201ENST00000408888 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.52■■■□□ 2.32
RBM34-201ENST00000408888 MAPKBP1O60336 1514 aa29.5■■■□□ 2.31
RBM34-201ENST00000408888 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.5■■■□□ 2.31
RBM34-201ENST00000408888 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.49■■■□□ 2.31
RBM34-201ENST00000408888 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.48■■■□□ 2.31
RBM34-201ENST00000408888 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
RBM34-201ENST00000408888 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.44■■■□□ 2.3
RBM34-201ENST00000408888 PBRM1Q86U86 1689 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM34-201ENST00000408888 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RBM34-201ENST00000408888 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.42■■■□□ 2.3
RBM34-201ENST00000408888 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.36■■■□□ 2.29
RBM34-201ENST00000408888 GRIN2BQ13224 1484 aa29.35■■■□□ 2.29
RBM34-201ENST00000408888 CUL7Q14999 1698 aa29.35■■■□□ 2.29
RBM34-201ENST00000408888 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.34■■■□□ 2.29
RBM34-201ENST00000408888 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
RBM34-201ENST00000408888 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.29■■■□□ 2.28
RBM34-201ENST00000408888 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.27■■■□□ 2.28
RBM34-201ENST00000408888 ITGAEP38570 1179 aa29.23■■■□□ 2.27
RBM34-201ENST00000408888 ADAMTS12P58397 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
RBM34-201ENST00000408888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.17■■■□□ 2.26
RBM34-201ENST00000408888 FBLN2P98095 1184 aa29.17■■■□□ 2.26
RBM34-201ENST00000408888 FMN1Q68DA7 1419 aa29.15■■■□□ 2.26
RBM34-201ENST00000408888 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RBM34-201ENST00000408888 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.1■■■□□ 2.25
RBM34-201ENST00000408888 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RBM34-201ENST00000408888 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RBM34-201ENST00000408888 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.06■■■□□ 2.24
RBM34-201ENST00000408888 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
RBM34-201ENST00000408888 SYNJ2O15056 1496 aa29.03■■■□□ 2.24
RBM34-201ENST00000408888 GRIN2AQ12879 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
RBM34-201ENST00000408888 CCER2I3L3R5 266 aa29.01■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 SAMD9Q5K651 1589 aa29■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 P3H3Q8IVL6 736 aa29■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 HFM1A2PYH4 1435 aa28.99■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.98■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.98■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 UACAQ9BZF9 1416 aa28.96■■■□□ 2.23
RBM34-201ENST00000408888 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.93■■■□□ 2.22
RBM34-201ENST00000408888 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.92■■■□□ 2.22
RBM34-201ENST00000408888 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.9■■■□□ 2.22
RBM34-201ENST00000408888 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
RBM34-201ENST00000408888 CEP170Q5SW79 1584 aa28.89■■■□□ 2.22
RBM34-201ENST00000408888 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.88■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.87■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 CHD1O14646 1710 aa28.87■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.86■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 IQGAP2Q13576 1575 aa28.85■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 TONSLQ96HA7 1378 aa28.84■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 KCNH8Q96L42 1107 aa28.83■■■□□ 2.21
RBM34-201ENST00000408888 ARHGEF11O15085 1522 aa28.81■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 NCOA2Q15596 1464 aa28.81■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.8■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 NAIPQ13075 1403 aa28.8■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 ANP32CO43423 234 aa28.8■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 NUP160Q12769 1436 aa28.79■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 PTPRKQ15262 1439 aa28.78■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 AKNAQ7Z591 1439 aa28.77■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.77■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.76■■■□□ 2.2
RBM34-201ENST00000408888 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
RBM34-201ENST00000408888 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.69■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 NEFLP07196 543 aa28.68■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.68■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 JPH4Q96JJ6 628 aa28.67■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.66■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 HECW1Q76N89 1606 aa28.65■■■□□ 2.18
RBM34-201ENST00000408888 DISP1Q96F81 1524 aa28.62■■■□□ 2.17
RBM34-201ENST00000408888 FKBP8Q14318 412 aa28.61■■■□□ 2.17
RBM34-201ENST00000408888 MIA2Q96PC5 1412 aa28.61■■■□□ 2.17
RBM34-201ENST00000408888 KIAA0556O60303 1618 aa28.57■■■□□ 2.16
RBM34-201ENST00000408888 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms