RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400299.6

SELENOM-201, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SELENOM, Length 694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-201ENST00000400299 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.16■■■□□ 2.26
SELENOM-201ENST00000400299 MAPKBP1O60336 1514 aa29.15■■■□□ 2.26
SELENOM-201ENST00000400299 ADAMTS12P58397 1594 aa29.13■■■□□ 2.25
SELENOM-201ENST00000400299 ADGRL1O94910 1474 aa29.11■■■□□ 2.25
SELENOM-201ENST00000400299 JPH4Q96JJ6 628 aa29.07■■■□□ 2.24
SELENOM-201ENST00000400299 FBXO41Q8TF61 875 aa29.02■■■□□ 2.24
SELENOM-201ENST00000400299 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.02■■■□□ 2.24
SELENOM-201ENST00000400299 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.01■■■□□ 2.23
SELENOM-201ENST00000400299 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
SELENOM-201ENST00000400299 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SELENOM-201ENST00000400299 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.77■■■□□ 2.2
SELENOM-201ENST00000400299 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SELENOM-201ENST00000400299 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.75■■■□□ 2.19
SELENOM-201ENST00000400299 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
SELENOM-201ENST00000400299 GLI2P10070 1586 aa28.61■■■□□ 2.17
SELENOM-201ENST00000400299 ASXL2Q76L83 1435 aa28.6■■■□□ 2.17
SELENOM-201ENST00000400299 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SELENOM-201ENST00000400299 TOP2BQ02880 1626 aa28.54■■■□□ 2.16
SELENOM-201ENST00000400299 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.54■■■□□ 2.16
SELENOM-201ENST00000400299 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.53■■■□□ 2.16
SELENOM-201ENST00000400299 PTPRGP23470 1445 aa28.52■■■□□ 2.16
SELENOM-201ENST00000400299 ABCC2Q92887 1545 aa28.52■■■□□ 2.16
SELENOM-201ENST00000400299 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.48■■■□□ 2.15
SELENOM-201ENST00000400299 ILDR2Q71H61 639 aa28.47■■■□□ 2.15
SELENOM-201ENST00000400299 CUL7Q14999 1698 aa28.45■■■□□ 2.14
SELENOM-201ENST00000400299 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.44■■■□□ 2.14
SELENOM-201ENST00000400299 SOCS7O14512 581 aa28.42■■■□□ 2.14
SELENOM-201ENST00000400299 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SELENOM-201ENST00000400299 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.4■■■□□ 2.14
SELENOM-201ENST00000400299 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.33■■■□□ 2.13
SELENOM-201ENST00000400299 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.28■■■□□ 2.12
SELENOM-201ENST00000400299 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.26■■■□□ 2.12
SELENOM-201ENST00000400299 KIF21BO75037 1637 aa28.26■■■□□ 2.11
SELENOM-201ENST00000400299 UACAQ9BZF9 1416 aa28.24■■■□□ 2.11
SELENOM-201ENST00000400299 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.23■■■□□ 2.11
SELENOM-201ENST00000400299 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.2■■■□□ 2.1
SELENOM-201ENST00000400299 IGF1RP08069 1367 aa28.19■■■□□ 2.1
SELENOM-201ENST00000400299 PTPRMP28827 1452 aa28.19■■■□□ 2.1
SELENOM-201ENST00000400299 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SELENOM-201ENST00000400299 CERKQ8TCT0 537 aa28.11■■■□□ 2.09
SELENOM-201ENST00000400299 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SELENOM-201ENST00000400299 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.1■■■□□ 2.09
SELENOM-201ENST00000400299 CD109Q6YHK3 1445 aa28.07■■■□□ 2.08
SELENOM-201ENST00000400299 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.05■■■□□ 2.08
SELENOM-201ENST00000400299 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.05■■■□□ 2.08
SELENOM-201ENST00000400299 DISP1Q96F81 1524 aa28.03■■■□□ 2.08
SELENOM-201ENST00000400299 KCNH8Q96L42 1107 aa28.01■■■□□ 2.07
SELENOM-201ENST00000400299 IQGAP2Q13576 1575 aa28■■■□□ 2.07
SELENOM-201ENST00000400299 HSPA2P54652 639 aa28■■■□□ 2.07
SELENOM-201ENST00000400299 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.99■■■□□ 2.07
SELENOM-201ENST00000400299 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.95■■■□□ 2.06
SELENOM-201ENST00000400299 KIF27Q86VH2 1401 aa27.93■■■□□ 2.06
SELENOM-201ENST00000400299 MADDQ8WXG6 1647 aa27.91■■■□□ 2.06
SELENOM-201ENST00000400299 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.89■■■□□ 2.06
SELENOM-201ENST00000400299 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.89■■■□□ 2.05
SELENOM-201ENST00000400299 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SELENOM-201ENST00000400299 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.86■■■□□ 2.05
SELENOM-201ENST00000400299 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SELENOM-201ENST00000400299 RAPGEF3O95398 923 aa27.8■■■□□ 2.04
SELENOM-201ENST00000400299 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.8■■■□□ 2.04
SELENOM-201ENST00000400299 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SELENOM-201ENST00000400299 KIAA0556O60303 1618 aa27.78■■■□□ 2.04
SELENOM-201ENST00000400299 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.77■■■□□ 2.04
SELENOM-201ENST00000400299 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.62■■■□□ 2.01
SELENOM-201ENST00000400299 ABCA8O94911 1581 aa27.62■■■□□ 2.01
SELENOM-201ENST00000400299 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.6■■■□□ 2.01
SELENOM-201ENST00000400299 ARID3CA6NKF2 412 aa27.57■■■□□ 2
SELENOM-201ENST00000400299 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.52■■■□□ 2
SELENOM-201ENST00000400299 NEO1Q92859 1461 aa27.51■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.5■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.48■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 STRCQ7RTU9 1775 aa27.48■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.47■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.45■■□□□ 1.99
SELENOM-201ENST00000400299 MLECQ14165 292 aa27.44■■□□□ 1.98
SELENOM-201ENST00000400299 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.44■■□□□ 1.98
SELENOM-201ENST00000400299 ATP10BO94823 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
SELENOM-201ENST00000400299 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.41■■□□□ 1.98
SELENOM-201ENST00000400299 GOLGA3Q08378 1498 aa27.39■■□□□ 1.98
SELENOM-201ENST00000400299 FANCAO15360 1455 aa27.38■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.38■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.37■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 RICTORQ6R327 1708 aa27.37■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.35■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.33■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 AKNAQ7Z591 1439 aa27.33■■□□□ 1.97
SELENOM-201ENST00000400299 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.29■■□□□ 1.96
SELENOM-201ENST00000400299 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.28■■□□□ 1.96
SELENOM-201ENST00000400299 P3H3Q8IVL6 736 aa27.25■■□□□ 1.95
SELENOM-201ENST00000400299 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.24■■□□□ 1.95
SELENOM-201ENST00000400299 PTPRTO14522 1441 aa27.24■■□□□ 1.95
SELENOM-201ENST00000400299 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SELENOM-201ENST00000400299 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SELENOM-201ENST00000400299 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.2■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.19■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.19■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms