RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEFMP07197 916 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEUROD1Q13562 356 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 BECN1Q14457 450 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 HMGXB3Q12766 1538 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 P3H3Q8IVL6 736 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGAEP38570 1179 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRXQ9BXM0 1461 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CUX1P39880 1505 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CUX2O14529 1486 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNJ1O43426 1573 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP162Q5TB80 1403 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 EEA1Q15075 1411 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 APPP05067 770 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIF27Q86VH2 1401 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRZ1-201ENST00000393386 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLIP1P30622 1438 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOPBP1Q92547 1522 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA3Q08378 1498 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID3CA6NKF2 412 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 NRDCO43847 1150 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBLN2P98095 1184 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARAP1Q96P48 1450 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH10P35580 1976 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 USP35Q9P2H5 1018 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM52Q96A61 297 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARID3AQ99856 593 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 JPH4Q96JJ6 628 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOP2BQ02880 1626 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO10Q9HD67 2058 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASC1Q6TDU7 716 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 MIER1Q8N108 512 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 DRC7Q8IY82 874 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMC1Q8TDI8 760 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLCB2Q00722 1185 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms