RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYT1Q01538 1121 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRZ1-201ENST00000393386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCC9O60706 1549 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEFLP07196 543 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRZ1-201ENST00000393386 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRZ1-201ENST00000393386 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 APLP2Q06481 763 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 HRCP23327 699 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCRIBQ14160 1630 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 NACADO15069 1562 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRZ1-201ENST00000393386 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRZ1-201ENST00000393386 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRZ1-201ENST00000393386 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRZ1-201ENST00000393386 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM41Q8WV44 630 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCL11AQ9H165 835 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCAPD3P42695 1498 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBR1Q14596 966 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCANQ96GW7 911 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC24A1O60721 1099 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 SOGA1O94964 1423 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 WIZO95785 1651 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMARCA4P51532 1647 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANP32CO43423 234 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMARCA2P51531 1590 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRZ1-201ENST00000393386 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 NESP48681 1621 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCC8Q09428 1581 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 CFTRP13569 1480 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 FKBP8Q14318 412 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRZ1-201ENST00000393386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARXQ96QS3 562 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 IGF1RP08069 1367 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTMSP20962 102 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms